變形蟲門（學名：Amoebozoa）是一類與變形蟲有親緣關係的原生生物。變形蟲門的多數物種靠細胞內原生質的流動而移動。偽足類似於手指形狀、邊緣是鈍的，大多數是單細胞生物。在土壤中或水域中生存。某些也被發現與其它生物共生，某些甚至是病原體。變形蟲門還包括黏菌，這是多核或多細胞生物，具有變形蟲的形態，但又類似於真菌可以產生孢子，通常肉眼可見。
變形蟲門生物的尺寸變化很大。許多僅10-20 μm，但也有很大尺寸的原生生物品種，如著名的大變形蟲（Amoeba proteus），達到800 μm長，並且由於它的可觀的尺寸成為了用於研究的有代表性的細胞。多核變形蟲，如卓變形蟲屬（Chaos）與多核變形蟲屬（Pelomyxa）可達數毫米長，而某些黏菌面積可達數平方英尺（接近1平方米）。
根據種系發生學，變形蟲是動物與真菌的姐妹群，源自共同的祖先單鞭毛生物（Unikonta）[2]：
變形蟲門根據種系發生學可分為三個亞門。
- ^Parfrey LW, Lahr DJ, Knoll AH, Katz LA.Estimating the timing of early eukaryotic diversification with multigene molecular clocks. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. August 2011,108 (33): 13624–9.PMC 3158185
.PMID 21810989.doi:10.1073/pnas.1110633108. - ^Eichinger, L.; Pachebat, J.A.; Glöckner, G.; Rajandream, M.A.; Sucgang, R.; Berriman, M.; Song, J.; Olsen, R.; Szafranski, K.; Xu, Q.; Others,.The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum. Nature. 2005,435 (7038): 43–57.PMC 1352341 .PMID 15875012.doi:10.1038/nature03481. 引文使用過時參數
coauthors (幫助) - ^董玖紅;文建凡;辛德東;盧思奇.内变形虫(Entamoeba)的进化地位(PDF). 《科學通報》. 2004-08,49 (15): 1486 [2024-11-15]（中文（簡體））.
