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香港小型巴士（簡稱小巴，英語：Minibus/Mini Bus）主要分為公共小型巴士及私家小型巴士，前者作為巴士和鐵路的輔助及接駁交通工具。根據香港政府按照《道路交通條例》第23條1款規定，在1976年刊憲限制全香港只容許最多4,350輛公共小巴營運[1]。在2017至2019年期間，公共小巴乘客量每日大約180萬人次，佔整體公共交通服務市場約14%。[2]根據小巴牌照類別，公共小型巴士可以分為紅色公共小巴及綠色專線小巴兩種，載客量最多為19人。至於私家小巴為私人公司或機構使用，學校小巴亦為私家小巴的一種。
紅色公共小巴，俗稱紅小巴、紅Van、紅頂、紅小、紅巴、公小或公巴，是最初的公共小巴在車身的中央以髹上一條橫向的紅色色帶（所以行內俗稱紅色小巴為紅帶）以茲識別。在1980年代，小巴開始展示車身廣告，但因為不能遮蓋識別紅帶或大面積遮蓋車身，只能在車身外展示大小相當於一張海報的廣告。至1990年代，運輸署容許小巴業界在車身外展示面積接近全車身的廣告，故此識別紅綠兩種小巴的顏色及文字改為髹於車頂，「紅頂」的暱稱由此而來。
紅色小巴除指定禁區外，可行駛香港各地。由於香港政府利用禁區大幅限制紅色小巴服務，所以服務範圍主要集中在舊區，市區內的山頂、金鐘、小西灣、鴨脷洲、尖沙咀、西九龍填海區、啟德、昂船洲、青衣島，以及大部分新發展的新市鎮區域，包括大部分的沙田、大部分的屯門、天水圍全域、將軍澳全域、馬鞍山全域、馬灣、大嶼山及赤鱲角等均禁止紅色小巴駛入。紅色小巴的服務路線、服務時間、班次和收費不固定和不受政府監管。隨著行業發展，不少紅色小巴路線已由有社團背景的商會或小型公司管理，有固定的路線、服務時間、班次和收費，但會因應各種情況而作出更改，例如堵車時可以轉用較暢通的路線。截至2017年3月，全港共有1064輛紅色小巴，佔全港公共小巴數目不到25%，到2023年12月減少至792輛。[3]乘客一般於下車的時候繳付車資，只有少數紅色小巴接受八達通付費。[4]
跟紅色公共小巴不同，綠色專線小巴，俗稱綠小巴、綠Van、綠頂、綠小、綠巴、專小或專巴，的識別色以車身中央髹上綠色色帶以及於車頂髹上綠色的形式出現（所以行內俗稱綠色小巴為綠帶），於1995年開始改為只髹於車頂，由於紅色小巴出現「紅頂」的俗稱，相對綠色專線小巴便出現「綠頂」的俗稱，書面語稱為綠色小巴或專線小巴。
專線小巴的設立主要是為某個社區（例如偏遠地區的鄉村）提供與大型運輸系統接駁服務（如港鐵、巴士），惟時至今日運輸署以「引入競爭」為名已多次違反是項原則，行走新田公路的新界區專線小巴44線即為最佳例子。
所有綠色小巴都有固定路線(或循環線)、服務時間、班次和收費，大部份路線設有固定車站，並須接受政府監管，按規定理論上不得隨意更改。然而，部份專線小巴路線，亦有「名存實亡」（也稱「有線無車」）的現象；這多出現於乘客稀少（例如已取消的新界405A 長宏↔青衣碼頭）或有替代服務（例如新界607S 元朗大馬路↔天水圍（通宵線），由79S分段取代；新界1M 西貢↔彩虹站，以1A名義營運）的路線。
截至2023年12月，全香港共有3,317輛綠色小巴，行走359條專線小巴路線（67條港島專線小巴路線、82條九龍專線小巴路線及210條新界專線小巴路線），大部分路線由私人有限公司經營，當中包括一些集團的多間子公司。專線小巴大部份路線都設有固定車站，乘客可於固定車站侯車或於路線途經之非禁區位置截停上車。乘客於上車的時候須先繳付車資，現金車資須投入錢箱（不設找續），不得交給司機。而所有綠色小巴均接受八達通（部份路線設分段收費，須於繳付車資前先通知司機，讓司機調整八達通收費機；部分路線的八達通機設有按鈕，乘客須自行把收費機按至所須繳付的分段車費）。乘客可於固定車站下車，或於非禁區地點下車。下車前須高聲呼叫司機下車地點，或按電鈴（如設有，及只適用於固定車站），司機揮手作實。專綫小巴營運較紅色小巴有效率，以每輛小巴平均計算，後者日均載客量比前者低近38%。
跟小巴不同，學校私家小巴的識別色最初以車身中央髹上黃色色帶以及白色車身出現，到了2000年代改為車身中央髹上紫色色帶以及黃色車身出現，一般稱為褓姆小巴。褓姆小巴（學校私家小巴）主要載學校校車隊學生回到車線的站放學。
1950年代至1960年代，香港曾經流行一種最多可載9人的客貨車，俗稱白牌車，又因為可載9人而被稱為「九人車」，並且成為公共小巴的前身。由於在市區載客行駛容易被發現及檢控，當時的白牌車主要在新界行駛。白牌車的收費比巴士略高，但比的士便宜得多，因為不需經常停車上落客，行車時間比巴士短，但由於是非法經營而良莠不齊，白牌車偶爾因超速或非法改裝而發生傷亡意外，部份匪徒亦曾利用白牌車作為行劫的交通工具，警方因而曾經大力掃蕩。
1967年香港發生六七暴動[5]，鬥委會指揮暴徒四處縱火及發動連串土製炸彈襲擊[6]，左派暴徒不但破壞電車及放火燒巴士[7]，又襲擊電車及巴士司機等公共交通從業員，並且造成電車乘客傷亡[8]，另有巴士司機罷工，部分路線因而暫停服務。面對鬥委會企圖通過炸彈襲擊等暴力手段癱瘓全香港的交通[9]，港英政府於是對白牌車放寛執法，白牌車駛入市區載客也不予打擊，因為巴士及電車的路線固定容易遇襲導致服務受阻，白牌車則具有路線靈活的特點，可以避開受阻的道路，輔助維持市區的公共交通[10]。在此期間，可載9人的白牌車在市區行駛成為常態，而且越來越受到市民歡迎，數目不斷增加，「九人車」亦成為這類小巴的代名詞。港英政府在同年12月成功平息暴動後，決定將白牌車規範化，同意白牌車登記為合法載客車輛[11]，作為輔助專營巴士服務之用。港英政府在1969年推出白牌車合法化政策，由政府向經營者發牌，取得營業登記證的白牌車成為公共小型巴士，可在香港島、九龍及新界的指定地區合法載客，同時規定公共小型巴士最多14座位及載客14人，「十四座」因而漸漸成為公共小巴的別稱。登記為公共小型巴士的車身款式及外觀需依照規定，車身的主色為奶黃色，在車身的中間以橫向塗上漆一條紅色色帶，並且在色帶上以白色字及中英文標示公共小型巴士十四座位，成為一般所稱的紅色小巴。雖然紅色小巴可以自行決定行車路線及收費，但服務區域及路線範圍都受到運輸署署長的規定[11]，可停車上落客的道路範圍亦受到限制。此外，除得到運輸署署長的批准外，不得駛入如東涌、將軍澳及天水圍等新發展區[11]。在1976年制定公共小巴的上限為4,350輛，多年來並無改變。
1972年，港英政府在香港島山頂試行專營小型巴士制度，由營辦商的車隊行駛固定的路線及收取預先批准的車資。專營小型巴士的外觀與紅色小巴大同小異，都是以奶黃色作為車身的主色，但改為塗上一條綠色及標示公共小型巴士十四座位的色帶，車頂也塗上綠色，成為綠色小巴。同年5月1日，首條專營小巴1號線（往來山頂至中環）投入服務，結果反應良好，遂於1974年正式實施專線小巴制度，至1975年，香港島已經有6條綠色專線小巴路線。由於綠色專線小巴越來越受歡迎的關係，政府於1977年10月26日首次招標數十條綠色專線小巴路線，供給公共小巴商或有興趣的商人競爭投標，首批九龍及新界綠色專線小巴路線分別在1979年4月及11月投入服務。隨着時代發展，市民對公共交通需求不斷提升，港府亦批出九龍市區及新市鎮的專線小巴路線以供競投。
最早期的14座位小巴，車頭頂部沒有目的地牌箱，只在車頭擋風玻璃插上以手寫的目的地及收費的白色膠牌，在路上不容易看到小巴的目的地，乘客可能會因此上錯車。1978年，小巴陸續在車頭頂部安裝目的地牌箱，配合燈泡照明，在日夜都可較清楚顯示目的地，減少因目的地顯示不清產生的誤會。政府於1988年2月23日批准小巴由14座位增加至16座位[12]，部分小巴商會曾經要求政府放寬座位數目至20座位，但是政府認為小巴為輔助性交通工具，及受到保護鐵路政策等限制而不被接受。
由於綠色小巴受到政府監管，而紅色小巴則相反。政府為加強對公共交通的管理，歷年均鼓勵紅色小巴轉為綠色小巴經營。一般而言，公共小巴須要有車輛登記及客運營業證，方可以載客及領取酬金；紅色小巴的車輛登記人和客運營業證持有人，往往是同一人，但是由於綠色小巴營辦商可以租用他人的小巴經營，所以同一輛綠色小巴，可以有不同的車輛登記人和客運營運證持有人。雖然公共小巴的車主可以申請將小巴從公共（紅色）轉為專線（綠色；九龍83A／83M、新界411及618線便是從紅色轉為綠色），或從綠色轉為紅色（只限與另一輛小巴互換牌照，不能單純地由綠轉紅；但從紅轉綠則不必與另一輛小巴互換），但從歷年的小巴分佈數字看，綠色小巴的數目持續上升，而紅色小巴則是越來越少。
為了加強小型巴士行車安全，運輸署於2012年修改法例，強制新入職的公共小型巴士司機必須修讀職前課程，學員通過筆試及駕駛考試後方才獲得頒發公共小型巴士駕駛執照。2013年運輸署招標承辦小型巴士司機職前訓練學校，接獲6份標書，新規定已於2015年6月1日生效。
2017年4月7日，政府就《2017年道路交通（修訂）條例草案》刊登憲報，將小巴的座位上限由16個增至19個；2017年6月28日，立法會下午三讀通過草案，於同年7月7日起生效。有關上限並非強制，如果需要容納19個座位，小巴長度至少要達到7米。營辦商可因應實際營運情況和乘客需求，自行決定是否增加旗下公共小巴的座位，以及確實增加的座位數目及實施時間。
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早期的小巴原是非法的白牌車，主要由客貨車加裝座位而成，其原始設計並非專門的客運車輛，通常最多可載9名乘客，在1960年代的小巴多為英國品牌，如金馬（英语：Commer）、柯士甸（Austin）、摩利士（Morris）和福特等，也有來自日本的大發牌（Daihatsu）與五十鈴（Isuzu）。1969年，港英政府推行小巴合法化的工作，規定每輛小巴最多14個乘客座位，不設企位，載客不得多於14人。雖然現用的車輛可使用至牌照到期，但舊有的小巴因車廂空間已用盡，再增加座位會使車廂極為擠迫，也無法通過政府驗車，但不安裝至上限的14座，就會降低每程車的載客量及利潤，不符合效益。過往使用客貨車改裝的小巴難以將座位增加至14個，小巴營辦商因此物色其他品牌的車輛取代舊車。當時只有日本出品的日產Echo小巴完全符合政府要求，且價格廉宜，營辦商不作他選，紛紛引入Echo小巴取代舊車，以致在1970年代中期至1980年代中期，在街道上行駛的小巴盡是日產Echo的情景，另有少數是五十鈴小巴，日本車雄踞公共小巴市場。
隨着時代發展，香港地鐵在1979年通車，九鐵在1982年配合電氣化有空調的都城嘉慕列車投入服務，九巴訂購的丹尼士喝采型及利蘭勝利二型空調雙層巴士樣辦車，也先後於1980年及1981年運抵香港測試，雖然九巴這兩輛空調巴士測試不成功，但也標誌著空調化是香港陸上公共交通的趨勢，公共小巴的服務也需要提升，政府亦放寬小巴的總負重，配合空調小巴的發展。三菱率先於1983年推出空調Rosa小巴，豐田亦緊隨其後，於翌年推出空調Coaster小巴，為求於香港小巴這個大市場中爭一席位。空調小巴甫推出，便極受小巴營辦商歡迎，紛紛棄用不設空調的日產Echo小巴轉投空調小巴，日產驚覺其「江山」可能不保，亦急急推出空調版Echo（後來正式更名為Civilian）救亡。這個新趨致使非空調的日產Echo小巴在其後10年間迅速被淘汰，在香港小巴市場形成「三雄鼎立」的局面；經過多年汰弱留強，最終日產在香港小巴市場近乎消聲匿跡。1988年，港英政府將公共小巴的座位數量由14個增至16個。
2000年代，捷輝汽車曾經引入2輛梅斯特斯平治Sprinter和1輛IVECO Daily小巴作試驗，為本港唯一曾使用此兩款車型的公共小巴營辦商，但該兩款車已分別於2005年12月退回代理及於2008年1月售出。
時至今日，豐田Coaster已成為大部分小巴的車款，但亦有少量三菱Rosa小巴行駛。香港小巴主要使用Coaster的原因，就是因為維修成本較低，購買零件容易，保養良好情況下壽命可接近20年，耐用程度遠較其他小巴甚至專利巴士優勝。
小巴自1970年代起一直以柴油為燃料，針對香港日益嚴重的空氣污染問題，曾有建議要求小巴改用汽油作燃料，但因為汽油價格較柴油高，行駛里程較短及維修成本較貴，受到小巴營辦商強烈反對。2000年，環保署與運輸署合作推動「另類燃料小巴測試計劃」，旨在研究以非柴油及非汽油作為小巴燃料的可靠程度及減低整體碳排放量。參與是次計劃的小巴生產商共有四間，共派出15輛另類燃料小巴作為測試，主要分為液化石油氣組別及全電動組別。液化石油氣組別有11輛，其中以豐田的石油氣版本Coaster最多，達8輛；退出香港市場多年的日產亦派出1輛石油氣版本的Civilian；同時亦有福特的2輛石油氣Transit小巴。參與測試的全電動小巴則有4輛，全為環力集團引入的「環力迅」電動小巴[13]。經過一連串測試，液化石油氣的三款車型都大致符合要求，但考慮到當時的小巴車隊大部分是柴油版的豐田Coaster，而豐田Coaster石油氣版和柴油版有較多零件可以共用，維修成本較另外兩款石油氣小巴低，最終豐田Coaster的石油氣版成為最主要的小巴車型。至於全電動組別的「環力迅」小巴，是在馬來西亞組裝，車廂比較寬敞，沒有引擎產生的震動，也較寧靜，但受制於當時電動商用車技術仍不成熟，充滿電後的行車里程太短，而且底盤的避震系統效能不佳，行車的震動較大，加上當年太少全電動車，維修不易及成本較高，最終試驗期過後便被棄用。
截至2006年6月，超過一半的公共小巴為石油氣小巴。其實，石油氣小巴佔有率超過一半的原因除了得到政府資助之外，還有就是從2002年起，豐田Coaster的柴油版小巴只有長陣，普通短陣只能提供石油氣版，對於著重車輛靈活性的業內人士有所局限。但是經過各方用戶的反映，豐田於2008年終再度推出短陣柴油版Coaster小巴供用家選擇。
2015年起，馬亞木引入長陣豪華版Coaster，設外趟式車門以至原廠設計的高靠背座椅，其後該車該亦被其他小巴公司引入。
小巴從1988年起一直維持16座，至2017年7月修例後，小巴座位增至19座，牽起一輪換車潮。2017年8月起，豐田Coaster的19座小巴陸續啟用，運輸署堅持要在乘客上落的車門額外加裝一個呈鞋盒外形的一階小梯級，認為可方便上落，不過業界反映額外加裝原廠沒有的這一級梯級，只能向一家獲運輸署批准的供應商訂購及加裝，改裝費要4500港元，而且因為要配合小巴的摺門，加裝的小梯級只有正常梯級不到一半的面積，容易令落車的乘客踏空，或絆倒上車的乘客，發生多宗乘客失足跌倒受傷的事件，導致服務受阻及引起保險問題，部分小巴商自行拆去額外梯級[14]，最終運輸署在2018年7月同意取消該項改裝要求，不用再加裝豐田原廠不存在的梯級[15]。
香港有兩間專綫小巴營辦商響應政府「無障礙運輸」政策，於2017年引入英國的Optare Solo SR，本車型可供輪椅上落，但19個座位坐滿後，在輪椅空間的坐輪椅乘客是否計算在內，還是要空出一個座位，曾經引起爭議，運輸署稱法例規定每輛小巴最多載客19人，當座位坐滿19人後，輪椅乘客不得上車[16]。進智公交的一輛正在瑪麗醫院路線54M上試行，成為全港首輛低地台以及後置引擎的公共小型巴士。馬亞木也有引入特低地台小巴行走808綫。然而，因為運輸署規定最多載客19人，輪椅位反而在日常營運帶來麻煩，又因低地台小巴的車價較貴，引入的數量太少，在香港較缺乏零部件供應，也使維修的時間較長，操作成本比一般車型高，到2025年本已數量極少的低地台小巴需要停駛甚至被棄用[16]。
直到2023年4月為止，香港現役小巴車款如下的:
2013年，3間小巴營辦商計劃於同一一年10月起引入柴電串聯混合動力小巴「GMI Gemini」，以馬達推動，發電機及電池供電，當電池電量少於某一程度時，控制系統會啟動車上的柴油發動機為電池充電及供電給電動機；由香港科技研究公司Green Mobility Innovations研制[17]，底盤使用內地東風EQ6700底盤，在內地組裝，動力系統採用康明斯ISF2.8s5148T 2.8公升歐盟五型引擎、西門子ELVA 108kW電動馬達及磷酸鐵鋰電池，在香港屯門安裝，每部價值130萬港元，比較一般小巴貴80萬，差額由香港政府所建立的綠色運輸資助基金承擔，入一次油可以行走450公里，首批共12架，行走於尖沙咀、南區及屯門[18]。
Gemini車重7公噸，[19] 豐田Coaster車重不多於3.7噸，[20]只是Gemini的52.9%，而同是混合動力的豐田Coaster Hybrid EV重量是3.93噸，[21]是Gemini的56.1%。一般情況下車身較重的車會較耗油。[22]
各Gemini型號資料：[19]
| 代工 | 生產數量 | 領牌數量 | 營運情況 | |
|---|---|---|---|---|
| 第一代 | 東風 | 6 | 5 | 2016年後陸續停用，服役期3-4年。 捷輝汽車：九龍6、6A號線 進智公交：港島39M、69線 馬亞木（冠荣车行）：新界43線 |
| 第二代 | 廣汽客車 | 不詳 | 2 | 源·區購入一輛，委託陽光巴士以私家小型巴士形式營運，另一輛被生產商用作員工巴士。 |
| 第三代 | 比亚迪 | 不詳 | 13 | 19座小巴。 萬昇物流有限公司：2017年12月15日開始行走九龍86號線 漢華小巴商會：紅色小巴 新昌運輸：港島22、23線 喜龍有限公司：新界11M線 樂華專綫小巴：九龍22A、22M號線 |
| 第四代 | 廣州穗景客車 | 不詳 | 7 | 19座小巴。 萬昇物流有限公司：九龍86號線 新昌運輸：港島22、23線 喜龍有限公司：新界11M線 樂華專綫小巴：九龍22A、22M號線 |
雖然2018年之前東涌區和大嶼山未曾有小巴服務，亦未有任何小巴進入東涌試車，但運輸處已在2017年7月落實在港珠澳大橋落成後會有一條循環模式運作的901線行駛港珠澳大橋香港口岸至東涌北一帶大型屋苑（以迎東邨作循環點），代表全港18區皆設有小巴站和小巴服務提供。該路線已由冠忠集團子公司冠亮發展有限公司所投得，在2018年4月6日該路線所使用的小巴抵達九龍灣驗車中心進行檢驗[23]。而在同年5月11日更首次有專線小巴到東涌區內和機場島進行試車[24]。值得一提是該路線所使用的17座位小巴是由19座位小巴改裝，拆除兩個座位及加裝行李架而成。專線小巴901線於2018年10月24日正式投入服務，甫開辦即提供24小時服務，該路線並不會在凌晨時段收取較高車費，創全港小巴業界先河。
另外，冠忠集團旗下的嶼巴則購入現時小巴所使用的豐田Coaster車種行駛34線。但載客量較一般小巴高，亦不屬小巴路線。
為了加強小型巴士行車安全，運輸署於2012年建議修訂《道路交通條例》，加強規管公共小型巴士安全，包括限制所有紅色公共小巴行駛時速上限為80公里、強制小型巴士安裝限速器及強制新入職小型巴士司機修讀職前課程；建議獲得立法會通過。2013年，運輸署招標承辦小型巴士司機職前訓練學校，接獲6份標書，承辦商主要提供導師及課室配套，課程教材則由運輸署按照小型巴士業實務守則提供有關於駕駛安全及顧客服務的課程大綱，內容分4個單元，包括認識小型巴士結構、駕駛技術、乘客安全、禮儀、投訴處理等，為時16小時；預計最早於2014年第三季開辦，屆時所有新入職的小型巴士司機都必須修讀職前課程，通過筆試及駕駛考試，及現行公共小型巴士駕駛執照考試後，方夠能獲得頒發小型巴士駕駛執照[25][26]。
紅色公共小巴因路線不受政府規管，所以路線較有彈性，往往可以使用更暢通的路線以更快抵達目的地（例如由新界往旺角／佐敦道的路線會取道介乎界限街和柏樹街之間的大南街）。對於乘客和經營者而言，「靈活」是紅色公共小巴的優點，但因為受到禁區限制，很多在1970年代後建成的道路及住宅區，紅色小巴都不可進入，也不能使用大部分高速公路，在香港經過多年的城市發展後，這些限制使營運紅色公共小巴的路線變相被固定下來。
紅色公共小巴對於乘客的最大問題是沒有固定的路線、車站、班次及收費。因為沒有固定的車站，又因道路的上落客禁區，常導致初次乘坐紅色小巴的乘客無所適從，甚至不知可在哪處下車。由於紅色小巴的收費不受規管，車費的波幅變化可以很大，為求搶客時可以收取極低的車費打「割喉戰」，但當要提高車費時又可以加至「天價」程度，過往每逢打風掛八號風球時，紅色小巴會突然調高收費，曾經有來往香港仔至華富村的路線把收費由原來的港幣3元加十倍至30元，而來往新界至佐敦道的路線更調高至80元，在佔中期間有些途徑旺角及中西區的路線把車費加價超過50%，坐地起價及不能預測的加價行為，不但被乘客投訴，也嚇怕原本有意乘坐的市民及旅客。另外，由於大部份紅色公共小巴的司機均為自僱人士，收入跟載客人次成正比，車上的乘客如較司機預期少，該處又可以暫時停車或沒有警察驅趕，司機一般會停車等客，拖延不少時間，而司機又因為想追回停車等客的時間，以免達不到當日預定的營運往復次數，繼而影響當日的載客總數及收入，卻往往成為超速駕駛及衝紅燈的誘因。
不同於綠色專線小巴的營運商在中標及簽署服務合約後，可單獨佔用政府指定的總站，行內稱作「站頭」用於泊車及交更，雖然政府也有劃定「站頭」供紅色小巴共用，原本所有紅色小巴都可以免費駛入「站頭」，然而不少紅色小巴「站頭」長期遭到黑社會組織盤踞，司機需要向黑社會份子交保護費才可以駛入及停泊，此外有不少紅色小巴路線被黑社會以商會或有限公司的名義壟斷，一般司機如欲行走某些載客量較穩定的路線，便需要先繳付一筆為數不少的入線費及每月繳付一筆「站頭」保護費，受歡迎的路線往往動輒需要數十萬元的入線費[27]，雖然索取保護費或入線費是不法行為，但因為司機害怕遭黑幫人士報復而不敢舉報，警方又缺乏積極行動應對，這些問題一直未能得到有效解決[28]。
小巴的載客量比巴士少，但綠色小巴營辦商可以通過調動車輛，在需要時加密班次，而車身短小的小型巴士亦較專營巴士公司的中大型單層及雙層巴士靈活，容易進出狹窄的道路。小巴適合需要頻密班次的短途接駁路線，或者為人口疏落的偏遠地區提供公共交通服務。因為專營巴士公司不願意在路線太短、缺乏中途站，或是在乘客量太低的偏遠地區開辦專營巴士路線，小巴能夠彌補專利巴士服務的不足之處，包括承接專利巴士公司放棄營辦的路線，而這亦是政府對綠色專線小巴的定位，也因此綠色小巴的行車路線，除了市區前往市郊及在新界郊區的路線因地理因素而較長途外，在市區的綠色小巴路線通常行車距離較短，以接駁屋邨、屋苑、廠區及醫院等為主。
綠色小巴設有固定的路線，即使司機可根據載客情況及交通狀況略為調整行車路線，但仍然需要滿足乘客在指定車站上落的要求。經營上也遠遠沒有紅色公共小巴那麼靈活，綠色小巴由於受到政府較多監管，調整收費或削減班次都需要先經運輸署批准，故此經營的路線不受歡迎，也不能以改變營運方式挽救，只能繼續經營至合約期結束。另外，有部分綠色專線小巴營辦商為節省開支，疏於更換旗下殘舊的小巴。
有部分綠色專線小巴路線的客量低或只有特定時段有較多乘客，缺乏利潤，甚至虧損，但因為是該屋苑、工廠區或公共設施的唯一公共交通工具，作為一項公共服務，政府不能輕易把該條綠色小巴路線取消或大幅削減班次，為使該等路線繼續維持，所以通常會採取捆綁招標，將有較多利潤和缺乏利潤的路線放在同一個組合捆綁競投，使投得高客量路線的小巴承辦商也要在低客量的路線提供服務。
除此之外，綠色專線小巴團體希望放寬政府小巴座位上限，根據小巴團體委託香港大學民意計劃所作調查顯示，六成半人認為放寬有助縮短候車時間，以及紓緩擠塞[29]。而業界亦承諾三年不加價，以及提供長者優惠[30]。但政府仍然拒絕有關建議，運輸署官員質疑業界會否遵守凍結費用承諾，但資深大律師湯家驊指，署長有權力否決違反承諾的加價[31]。
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因小巴經營模式問題[註 1]，衝紅燈和超速的情形頗為常見，尤以紅色小巴為甚，這種駕駛行為甚至被市民譏諷為「亡命小巴」。例如2004年10月22日（重陽節），2架紅色小巴於香港北角英皇道因互相搶客而超速撞車，釀成2死17傷意外，結果2名司機於2005年年尾被判罪名成立而入獄。另外於2006年5月18日凌晨，新界北交通總部特遣隊派出2名警員假扮乘客於銅鑼灣登上一輛紅色小巴，並暗中攜攝影機將「飛車」過程拍下，發現該小巴途中至少5次衝紅燈、切雙白線，另一隊警員在青山公路時速限制50公里路段，以雷射測速槍偵察到小巴車速逾100公里。警方最後在元朗將小巴截停，以危險駕駛罪名將司機拘捕[32]。
現時政府正採取多項措施加強小巴乘客的安全，如加裝乘客安全帶、向乘客顯示的速度計等。
可是甚少小巴乘客會扣上安全帶，而向乘客顯示的速度計更有不少被紅色小巴司機改裝過，以減少超速時所發出的「嗶嗶...」聲響，及令顯示屏所顯示的車速較實際行車速度為低。
近年較少人入行駕駛公共小巴，因為綠色小巴司機的薪金不及其他客運職位，有部分公司將工資與載客量掛鉤，導致收入不穩定，而且不少綠色小巴路線的班次頻密，少休息時間，工時又長，休息日少，又缺乏福利，而紅色小巴多為自僱模式，司機要承擔租車費及燃料費，收入的波幅大，如當日客量太低，司機當日便會虧本，雖然有部分經營紅色小巴的公司僱用司機，但多以拆帳方式支付薪金，收入缺乏保障，且缺乏福利，加上紅色小巴的載客人次有逐年減少的趨勢，導致司機的收入減少。年輕世代如有意加入客運行業，也會優先考慮每月收入2萬元起、每月收入較穩定，可以免費乘車，又有醫療及家屬福利的專營巴士司機職位，導致小巴司機年齡老化，不少司機年屆70歲[33]。運輸署提出放寬商用車輛牌照限制，由現時必須持有駕駛執照最少3年，改為1年，以吸引更多合資格人士駕駛小巴。
香港的小巴比其他大型公共運輸工具有較少的限制，而且營運商眾多，所以監管上十分困難。小巴衝紅燈、切雙白線、馬路上左穿右插、胡亂調頭、超速、超載等犯法行為亦屢見不鮮，不時引起害人害己的交通意外。為免更多意外發生，警方安排了不定期的路障，以增強司機小心駕駛的意識，並立例限制新車必須設有乘客安全帶，保障乘客的安全。2009年8月3日，政府宣佈強制全港4,300多輛紅色及綠色小巴自資6,000至8,000元加裝車速限制器，令小巴時速不能高於80公里，此舉惹來多名立法會議員及區議員反對。[34]政府到2010年6月7日起，規定新登記公共小巴必須安裝最高預設車速為每小時80公里的車速限制器和黑盒。[35]
2004年10月22日清晨5時45分，兩名公共小型巴士司機疑為爭生意鬥快，由筲箕灣開出往西環期間，在英皇道亡命飛車追逐，其間在健康東街十字路口懷疑衝紅燈，前面一輛小巴攔腰猛撼一輛的士後，失控衝上路中石壆，撞毀燈箱、交通燈、街燈及二十多米鐵欄等設施，司機乘客全部受傷；緊貼其後另一輛小巴扭閃避時，失控鏟上石壆翻側，被塌下街燈擊中，車上一男一女乘客被拋出車外，遭翻側的小巴當場壓死，其餘乘客全部受傷，的士被撞後衝向路邊鐵欄，車上四人亦浴血。事故造成2死18傷。[36]
2009年7月25日清晨5時許，一輛懷疑超速行駛的44A綠色專線小巴尾隨一輛涉嫌超重載貨的貨櫃車上斜駛至元朗公路近博愛交匯處時，小巴司機疑錯誤判斷，沒有留意貨櫃車減慢車速，高速撞向貨櫃車車尾後爆炸，大火將車頭燒成廢鐵[37]，男司機首當其衝葬身火海，連同車頭兩排座位的乘客，如三文治般人夾人叠在一起，其他乘客亦東歪西倒受傷，全車死傷枕藉，釀成4死13傷[38]，當中一男一女乘客於當日傷重不治，另一名男乘客留醫1日後不治。
2015年12月18日下午4時40分，錦田錦上路與東匯路交界的十字路口發生嚴重的小巴車禍，一輛中型貨車司機疑誤將紅燈當成綠燈並突然駛出，猛撞一輛正橫過路口的滿座608號線小巴，撞車歷時僅3秒，但小巴幾乎拋起，衝前10米猛撞路邊鐵欄翻側，其間有乘客拋出車外，有人被車身壓住，最終導致5死13傷，包括3個月大女嬰在內共四名乘客當場死亡，另一人留醫3日後亦不治，是香港歷來死傷最慘重的小巴車禍。警方以涉嫌危險駕駛導致他人死亡罪拘捕70歲貨車司機。[39]
2019年10月1日香港示威期間，下午3時左右，有市民攝得一輛行走九龍區專線小巴19M線的豐田Coaster 6LS型（PS9968）於蒲崗村道落斜時，被大量人群阻礙，無法行車，逐加速衝向前方在車路聚集的市民。人群慌忙四散，情況混亂，有人向小巴投擲雜物。小巴最後成功突圍，往鑽石山荷里活廣場方向離開，無人受傷。至晚上9時左右，該車被發現在大有街一車房外起火，消防到場救熄，但小巴已嚴重焚毀。該車因損毀嚴重難以修復，於同年10月29日除牌退役, 當時車齡只有八年，PS9968亦成為反對逃犯條例修訂草案運動期間首部被縱火而退役的公共運輸車輛[來源請求][40]
2019年11月18日：清晨5時許，有數名身穿黑衣男子於旺角（花園街）總站出沒，以硬物破壞平日主要行走公共小巴旺角至慈雲山線的豐田Coaster小巴玻璃窗後，向車廂內及小巴外投擲燃燒彈，其中3輛小巴（BT6008（2008年6LS）、DJ613（2017年7LL）及MS7295（2007年5LS2））登時陷於烈焰，並冒出濃濃黑煙，滾向半空，並攀升向對上樓層單位。其間有黑衣男子再以硬物扑向第4輛小巴時，剛有司機返回，見狀立刻高呼喝止，黑衣男子未有再投擲燃燒彈縱火，拔足逃去，司機未有追趕，致電報案求助。消防員接報趕至，調動3隊煙帽隊拉3條喉灌救，並協助6名住客疏散落樓逃生。火勢於1小時後被救熄，共有3名男女住客分別吸入濃煙不適及受輕傷，後獲一併送院治理。現場消息稱，早前曾有示威者在上址乘坐該線小巴時，懷疑有司機坐地起價至10多元一程，惹起該名示威者不滿，雙方曾為此發生爭執，不排除與縱火事件有關。當中BT6008損毁最為嚴重而除牌退役，DJ613經過修復後更換車牌為WN2475，現行走新界503/503K線。而MS7295在復修後，更換車牌WM2564於同一路線繼續服務。[41]
於2012年4月13日起，紅色公共小巴的車速限制在每小時最高80公里及強制性須要安裝認可的車速限制器的條例生效，相關的《2012年道路交通（修訂）條例》亦於當日刊憲。違反與車速限制器相關的規定，例如使用沒有安裝認可車速限制器的紅色公共小巴，或者使用已經安裝認可車速限制器，但是車速限制器未能夠保持於良好及有效用的狀態的紅色公共小巴，均屬違法。違例者可以被判處罰款1萬港元及監禁6個月。另外，如果在沒有合法權限或合理辯解下，干擾車速限制器的正常操作，罰則相同。條例亦將電子數據記錄儀（俗稱黑盒）列為紅色公共小巴的其中一項基本裝備。
此外，條例規定申請公共小巴駕駛執照的司機，均須要修讀學習、並且完成職前課程，才可以獲得頒發駕駛執照，公共小巴司機則需要在小巴上展示司機證[42][來源請求]
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 西環 |  Y | 域多利道往加惠民道[43] |
| 上環 | Y | 干諾道中往林士街[47] 干諾道西近西消防街東行[48] |
| 中環 | Y | 夏愨道往愛丁堡廣場[55] 干諾道中往愛丁堡廣場[56] |
| 金鐘 |  N | 金鐘道往正義道[73][74] 金鐘道往樂禮街[75] |
| 半山區 | Y | 上亞厘畢道近萊利樓西行[83] 羅便臣道往雅賓利道[84] |
| 山頂 | N |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 灣仔 | Y | 菲林明道往港灣徑[92] 皇后大道東往聯發街[93] |
| 銅鑼灣 | Y | 摩頓臺往告士打道天橋[106] 告士打道往加寧街[107] |
| 大坑 | Y | 大坑道往勵德邨道[117][118] |
| 渣甸山 | Y | 大坑道往白建時道[119] |
| 跑馬地 | Y | 黃泥涌道往香港仔隧道[121] |
| 黃泥涌 |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 小西灣 | N | 柴灣道近常安街東行[125] |
| 柴灣 | Y | 東區走廊往柴灣[128] 永泰道往順泰道[129] |
| 筲箕灣 | Y | 東區走廊往柴灣近愛秩序灣（星期一至五16:00至10:00，星期六及公眾假期全日）[147] 柴灣道往阿公岩道北行[148] |
| 西灣河 | ||
| 鰂魚涌 | Y | 英皇道往太古城道[161][162] 東區走廊往康山[163] |
| 北角 | Y | 東區走廊往銅鑼灣近柯達大廈二期[170] 英皇道往東區走廊近健康村[171] |
| 寶馬山 | N | 健康西街近七姊妹道南行[174] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 薄扶林 | Y | 域多利道往大口環道[182] 域多利道往金粟街[183] |
| 田灣 | Y | 田灣海傍道[197] |
| 香港仔 | Y | 南寧街[199][200] |
| 鴨脷洲 | N | 黃竹坑道往鴨脷洲橋道[202][203] |
| 黃竹坑 | Y | 香葉道近城巴車廠[204] 香葉道近南朗山道東行[205] |
| 壽臣山 | Y | 南風道往深水灣道[214] |
| 淺水灣 | Y | |
| 舂坎角 | N | 淺水灣道往舂坎角道[215] |
| 赤柱 | ||
| 大潭 | Y | 大潭道近大潭水塘道北行[217] |
| 石澳及鶴咀 | Y |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 荔枝角 | Y | 荔景山路近景荔徑北行[219] |
| 長沙灣 | Y | 深旺道往深盛路[223] 荔枝角道往通州街[224] |
| 深水埗 | Y | 欽州街西近昌新里南行[233] |
| 昂船洲 | N | 貨櫃碼頭南路近呈祥道南行[234] 青衣路迴旋處往青沙公路（不能往昂船洲大橋）[235] |
| 石硤尾 | Y | 大坑西街[240] |
| 大窩坪 | Y | 南昌街往澤安道[242] |
| 又一村 | Y | 大坑東街往達之路[244] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 旺角 | Y | 旺角道近通菜街西行[245] |
| 油麻地 | Y | 油麻地交匯處往葵涌方向[247] |
| 京士柏 | Y | 京士柏道近衛理道西行[252] |
| 大角咀 | Y | 海泓道[255][256] |
| 尖沙咀 | N | 加士居道往漆咸道南[260] 康莊道往順風道[261] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 黃大仙 | Y | 雅竹街[306] 馬仔坑道近馬仔坑遊樂場西行[307] |
| 鑽石山 | Y | 大磡道往大老山隧道[310] |
| 斧山 | Y | 瓊東街[311] |
| 新蒲崗 | Y | 康強街[312] |
| 牛池灣 | Y | 龍翔道往黃菊路[315] 太子道東往藍鐘路[316] |
| 慈雲山 | Y | |
| 橫頭磡及樂富 | Y | 竹園道往聯合道[323] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 觀塘及牛頭角 | Y | 觀塘道往創紀之城五期[326] 將軍澳道往觀塘繞道（01:00-10:00）[327] |
| 九龍灣 | Y | 觀塘道往康德道[334] 偉業街往德福花園平台[335] |
| 秀茂坪及四順 | Y | 秀茂坪道往順安道[347] 順利邨道往順安道[348] |
| 佐敦谷 | N | 彩霞道近彩盈坊東行[332] |
| 坪石 | Y | 新清水灣道往清水灣道8號停車場[356] |
| 茶果嶺 | Y | 偉發道往茶果嶺道[329] |
| 藍田 | Y | 將軍澳道往將軍澳隧道[359] |
| 油塘及鯉魚門 | Y | 茶果嶺道近油塘道西行[364] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 荃灣市中心 | Y | 兆和街[366] 美環街[367] |
| 梨木樹至石圍角 | Y | 國瑞路介乎昌榮路至楊屋村迴旋處一段西行[384] 梨樹路近梨木樹邨第1座以北[385] |
| 汀九 | Y | |
| 深井 | Y | 青山公路深井段往屯門公路[394] |
| 青龍頭 | Y | |
| 馬灣及大嶼山青洲仔半島 | N | 青荃路支路往担杆山交匯處（不能往青馬大橋）[395] 担杆山交匯處往青衣北岸公路（不能往青馬大橋）[396] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 上葵涌 | Y | 青山公路葵涌段往石排街[398] 圍乪街往石排街[399] |
| 下葵涌 | Y | 葵富路往葵仁路[405] 貨櫃碼頭迴旋處往葵義路[406] |
| 青衣島 | N | 葵青路往青衣大橋[423] 德士古道往青荃路[376] |
| 昂船洲 | N | 貨櫃碼頭南路近呈祥道南行[413] 青衣路迴旋處往青沙公路（不能往昂船洲大橋）[235] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 大欖 | Y （只限青山公路沿途） | 屯門公路[433] |
| 掃管笏 | 掃管笏路[434] | |
| 三聖至虎地 | 三聖街[435] 海榮路[436] | |
| 藍地 | 藍地交匯處往元朗公路[449][450] | |
| 其他 | N | 海榮路（不能往屯門南）[436] 兆麟街（不能往兆麟苑、友愛邨、安定邨）[437] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 大圍 | Y | 大埔公路大圍段往大圍新村路[495] 大埔公路大圍段往城門隧道公路[496] |
| 沙田市中心 | N | 沙田正街近獅子山隧道公路東行[510] 沙田鄉事會路[511][512] |
| 火炭 | N | 大埔公路沙田段支路往火炭路[518] |
| 沙田馬場 | Y | |
| 九肚山 | N | 九肚山路[523] |
| 馬料水 | Y （只限大埔公路沿途） | 大學道[524] |
| 大學站 | N | 大埔公路沙田段近沙田馬場北行（不能往吐露港公路）[522] |
| 馬料水碼頭 | ||
| 香港科技園 | ||
| 沙田圍 | N | 車公廟路近獅子山隧道東行[525] |
| 圓洲角 | ||
| 石門 | ||
| 亞公角 | ||
| 馬鞍山 | ||
| 烏溪沙 |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 白石角 | N | 大埔公路沙田段近沙田馬場北行（不能往吐露港公路）[522] |
| 大埔滘 | Y | |
| 大埔 | Y | 大埔公路元洲仔段往吐露港公路[532][533] 南運路近廣福道南行[534] |
| 大埔工業邨 | N | 大埔太和路近南運路東行[547] |
| 鳳園 | ||
| 船灣 | ||
| 汀角 | ||
| 大美督 | ||
| 康樂園 | Y | 大窩西支路往南華莆[549] |
| 南華莆 | ||
| 林村 | Y | |
| 十四鄉 | N | 大埔公路沙田段往吐露港公路（不能往馬鞍山）[550] |
| 北潭凹 | ||
| 黃石 |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 上水 | Y | 馬會道往智明街[553] 龍琛路近馬會道南行[554] |
| 粉嶺 | Y | 百和路近和興路支路南行[563] 新運路近馬會道西行[564] |
| 聯和墟 | Y | 和睦街近和泰街西行[570] |
| 龍躍頭 | Y | 龍馬路近凱榮路南行[574] |
| 坪輋 | Y | 坪輋路近坪原路北行[575] |
| 打鼓嶺 | N | 坪輋路近坪原路北行[575] |
| 沙頭角 | Y | 沙頭角公路迴旋處往香園圍公路[578][579] |
| 和合石 | Y | 和合石路[583] |
| 文錦渡 | N | 文錦渡路近L7車場[562] |
| 古洞 | Y | 青山公路洲頭段往柏壽路[586] |
| 地區 | 紅色小巴可否駛入？ | 禁區街道 |
|---|---|---|
| 全區 | N | 青荃路支路往担杆山交匯處（不能往青馬大橋）[395] 担杆山交匯處往青衣北岸公路（不能往青馬大橋）[396] 青朗公路往青馬大橋[397] |
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| 巴士 |
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| 小巴 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 的士 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 鐵路 |
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| 渡輪 |
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| 民航 |
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| 其他 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 票务 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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