編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
1	蘇澳溪	8.83	29.65	西帽山	蘇澳鎮	宜蘭縣
2	南澳溪	48.40	311.73	三星山	南澳鄉	宜蘭縣
3	新城溪	18.13	50.46	蘭崁山	蘇澳鎮	宜蘭縣
4	得子口溪	19.30	98.35	三角崙山	頭城鎮	宜蘭縣
5	東澳溪	8.00	20.60	大白山	南澳鄉	宜蘭縣
6	大溪川	6.00	14.20	三方向山南峰	頭城鎮	宜蘭縣

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
7	雙溪	26.81	132.50	雙溪區長源里中坑	貢寮區	新北市
8	尖山腳溪	9.90	10.63	貢寮區美豐里南草山	貢寮區	新北市
9	瑪鋉溪	22.50	9.48	萬里區溪底里大尖山	萬里區	新北市
10	員潭溪	6.20	22.33	萬里區雙興里礦嘴山	萬里區	新北市
11	小坑溪	8.70	4.40	石門區茂林里小坑頭	石門區	新北市
12	乾華溪	12.10	10.03	石門區乾華里竹子山北峰	石門區	新北市
13	石門溪	9.35	4.30	石門區尖鹿里十塊厝仔	石門區	新北市
14	老梅溪	24.20	14.85	三芝區圓山里鷹子鼻	石門區	新北市
15	楓林溪	4.00	2.25	三芝區橫山里坑仔內	石門區	新北市
16	八甲溪	4.00	2.83	三芝區橫山里內橫山	石門區	新北市
17	埔坪溪	5.00	12.90	三芝區埔坪里埔頭坑	三芝區	新北市
18	八蓮溪	11.00	15.00	三芝區圓山里竹子山	三芝區	新北市
19	大屯溪	14.50	15.68	三芝區店子里、圓山里小觀音山	淡水區	新北市
20	後洲溪	5.50	3.05	淡水區蕃薯里三角埔	淡水區	新北市
21	興仁溪	6.00	7.99	三芝區興華里北新莊	淡水區	新北市
22	水仙溪	11.71	17.18	林口區林口里林口	八里區	新北市
23	寶斗溪	5.68	17.20	林口區中湖里中湖	林口區	新北市
24	林口溪	8.32	18.38	林口區南勢里力行莊	林口區	新北市
新	林子溪	13.50	24.32	淡水區水源里大屯山	淡水區	新北市

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
25	南崁溪	30.73	214.67	龜山區樂善里牛角坡	大園區	桃園市
26	老街溪	36.70	81.59	龍潭區三林里三角林	大園區	桃園市
27	社子溪	24.17	77.83	楊梅區永寧里老坑山	新屋區	桃園市
28	富林溪	14.75	15.48	觀音區新坡里舊埤	觀音區	桃園市
29	大堀溪	18.59	47.38	楊梅區高榮里東高山頂	觀音區	桃園市
30	觀音溪	7.80	23.88	新屋區清華里	觀音區	桃園市
31	新屋溪	13.59	6.58	新屋區九斗里上青埔	新屋區	桃園市
32	坑子溪	4.8		蘆竹區	貓尾崎排水匯流口	桃園市
33	茄苳溪	15.1		八德區	蘆竹區	桃園市
	合計	166.23

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
33	西湖溪	32.50	110.53	三義鄉雙潭村關刀山	後龍鎮	苗栗縣
34	通霄溪	10.00	79.88	通霄鎮福興里大坑	通霄鎮	苗栗縣
35	苑裡溪	16.50	13.38	苑裡鎮蕉埔里蕉埔	通霄鎮、苑裡鎮	苗栗縣
36	房裡溪	14.00	39.30	苑裡鎮石鎮里火炎山	苑裡鎮	苗栗縣

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
39	林邊溪	41.30	336.30	南大武山	林邊鄉、佳冬鄉	屏東縣
40	率芒溪	22.33	89.61	大樹林山	枋寮鄉	屏東縣
41	枋山溪	25.67	125.48	南湖呂山	枋山鄉	屏東縣
42	楓港溪	20.38	102.52	牡丹溪山	枋山鄉	屏東縣
43	保力溪	20.70	105.23	四林山	車城鄉	屏東縣
44	港口溪	32.00	101.69	高土佛山	滿州鄉	屏東縣
45	七里溪	4.00	50.38	內獅頭山	枋山鄉	屏東縣
46	石盤溪	4.00	6.08	里龍山	枋山鄉	屏東縣
47	九棚溪	4.00	19.70	萬里得山	滿州鄉	屏東縣
48	港子溪	6.00	15.75	舊社丹	滿州鄉	屏東縣
49	牡丹溪（旭海溪）	4.00	11.63	舊牡丹南方	牡丹鄉	屏東縣
50	里仁溪	2.00	5.88	觀音山南西峰	牡丹鄉	屏東縣

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
51	知本溪	39.25	198.45	霧頭山	卑南鄉、太麻里鄉	臺東縣
52	利嘉溪	37.80	174.70	大浦山	臺東市	臺東縣
53	太平溪	20.50	88.00	太巴六九	臺東市	臺東縣
54	塔瓦溪	3.00	4.48	牡丹溪山	達仁鄉	臺東縣
55	達仁溪	3.00	12.00	壽峠	達仁鄉	臺東縣
56	安朔溪	12.10	58.40	卡勃卡那山	達仁鄉	臺東縣
57	朝庸溪	7.70	13.00	達仁鄉	大武鄉	臺東縣
58	大武溪	18.70	109.52	大樹林山	大武鄉	臺東縣
59	烏萬溪	7.15	16.50	新化社	大武鄉	臺東縣
60	津林溪	8.30	16.30	柿子埔社	大武鄉	臺東縣
61	大竹溪	23.65	133.41	大力里山	大武鄉	臺東縣
62	金崙溪	26.40	151.94	衣丁山	太麻里鄉	臺東縣
63	太麻里溪	35.20	217.53	北大武山	太麻里鄉	臺東縣
64	文里溪	4.00	5.90	文里格	太麻里鄉	臺東縣
65	都蘭溪	4.00	5.70	都巒山南峰	東河鄉	臺東縣
66	八里溪	4.00	17.73	都巒山東峰	東河鄉	臺東縣
67	馬武窟溪	28.00	150.33	都巒山	東河鄉	臺東縣
68	成功溪	8.00	15.50	新港山南峰	成功鎮	臺東縣
69	富家溪	9.02	25.70	分水崙山	成功鎮	臺東縣
70	都威溪	5.94	14.80	成廣澳山	成功鎮	臺東縣
71	沙灣溪	5.00	7.43	大庄處	長濱鄉	臺東縣
72	寧埔溪	4.00	4.90	安通越山	長濱鄉	臺東縣
73	竹湖溪	6.00	10.60	安通越山	長濱鄉	臺東縣
74	大德溪	4.00	6.38	北花東山	長濱鄉	臺東縣
75	長濱溪	4.00	6.30	北花東山	長濱鄉	臺東縣
76	城埔溪	4.00	6.88	上田組	長濱鄉	臺東縣
77	馬海溪	4.00	6.15	三間屋山	長濱鄉	臺東縣
78	山間溪	4.00	5.05	三間屋山	長濱鄉	臺東縣
79	水母溪	12.00	40.40	三間屋山	長濱鄉	臺東縣

編號	水系名	幹流長度	流域面積	發源地	出海地	流經縣市
80	吉安溪	11.40	42.16	七腳川山	花蓮市	花蓮縣
81	美崙溪	15.80	76.40	七腳川山	花蓮市	花蓮縣
82	立霧溪	55.00	616.30	奇萊主山北峰	新城鄉	花蓮縣
83	三富溪	5.00	6.65	三富山	豐濱鄉	花蓮縣
84	豐濱溪	16.98	82.99	秀望山	豐濱鄉	花蓮縣
85	加蘭溪	5.50	9.38	海岸山脈	豐濱鄉	花蓮縣
86	薯寮溪	5.00	10.13	壽豐山海岸山脈	壽豐鄉	花蓮縣
87	三棧溪	25.00	123.32	怕托普山	新城鄉	花蓮縣
88	水連溪	8.00	26.25	壽豐山海岸山脈	壽豐鄉	花蓮縣
89	石公溪	3.00	9.00	清水山	秀林鄉	花蓮縣
90	大富溪	3.00	5.83	清水山	秀林鄉	花蓮縣
91	大清水溪	10.00	51.70	清水山北峰	秀林鄉	花蓮縣

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