福建省海岸线曲折，岛屿众多，下表所列为全省面积在1平方公里以上的岛屿，不包含因与大陆通过围垦或修建海塘（大堤）连接而消失的岛屿，如东山岛已经成为东山半岛，福清市的江阴岛已经成为江阴半岛。这里的岛屿面积除有特别说明的外，均来自第一次（1988-1995年）海岛调查。为陆地面积，不包括潮间带。
目前共有10平方公里以上岛屿15座。第一次海岛调查时，尚有东山岛、江阴岛、丙洲屿、雷东岛、大嶝岛的面积在10平方公里以上，但这些岛屿目前已经通过围垦成为大陆的一部分。
| 排序 | 名称 | 陆地面积 （平方公里） | 人口[1] | 人口[2] | 最高海拔 | 所属市县 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 海坛岛 | 274.33 | 270,034 | 350,000 | - | 福州市平潭县 | 海岛县，设潭城镇、苏澳镇、澳前镇、北厝镇、流水镇、平原镇、敖东镇、 岚城乡、中楼乡、白青乡、屿头乡、东庠乡、芦洋乡 |
| 厦门岛 | 约155 | 339.6 | 厦门市 | 设湖里区、思明区。2016年拆除高集海堤，再次成岛 | |||
| 2 | 金门岛 | 137.88 | 42783 | ？ | - | 金门县 | 属福建省 (中华民国)管辖，设金城鎮、金湖鎮、金沙鎮、金寧鄉 |
| 3 | 琅岐岛 | 64.65 | 66699 | ？ | - | 福州市马尾区 | 设琅岐镇，闽江口河口岛 |
| 4 | 紫泥岛 | 46.99 | 50925 | ？ | - | 龙海市 | 设紫泥镇，为九龙江口河口岛 |
| 5 | 南日岛 | 45.08 | 49901 | ？ | - | 莆田市秀屿区 | 设南日镇，若排除河口岛和金门，也被认为是福建第二大岛 |
| 6 | 三都岛 | 29.57 | 9181 | ？ | - | 宁德市蕉城区 | 设三都镇，镇府在岛，部分镇域位于大陆 |
| 7 | 大嵛山 | 21.50 | 5021 | ？ | - | 福鼎市 | 设嵛山镇，福瑶列岛主岛 |
| 8 | 小金门岛 | 14.26 | 0 | ？ | - | 金门县 | 由中华民国实际管辖 |
| 9 | 湄洲岛 | 14.21 | 32156 | ？ | - | 莆田市秀屿区 | 设湄洲镇 |
| 10 | 乌礁洲 | 13.84 | 0 | ？ | - | 龙海市 | 属紫泥镇，有桥通紫泥岛 |
| 11 | 粗芦岛 | 13.67 | 17519 | ？ | - | 连江县 | 属琯頭鎮，为闽江口诸岛之一 |
| 12 | 浮鹰岛 | 11.50 | 1903 | ？ | - | 霞浦县 | |
| 13 | 大练岛 | 10.84 | 5951 | 5,617 | - | 福州市平潭县 | 设大练乡和6个村 |
| 14 | 马祖岛 | 10.26 | 5558 | ？ | - | 连江县 | 由中华民国实际管辖 |
根据福建省发展和改革委员会2008年1月23日提供的《福建省海岛开发建设和保护规划（征求意见稿）》，福建省现辖管区内共有海岛1546个，其中有人居住海岛99个（即不包括计划单列的厦门市内的厦门岛、鼓浪屿岛、大嶝岛及金门县的大金门岛、小金门岛和马祖列岛等岛屿）[3]，这个数据中有个别岛屿，实际上已经通过海堤修筑或围垦成为大陆或其它岛屿的一部分，如东山岛、江阴岛、雷东岛等[4]。
| 县市 | 岛组 | 设乡镇岛 | 设村岛 | 自然村岛 | 无居民海岛 | 主要已消失海岛 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 宁德市福鼎市 | 沙埕港诸岛 | - | - | 牛屿、腰屿、长屿、莲花屿 | 青屿、金屿 | 上屿、下屿、孝屿、姚家屿 |
| 其它近陆诸岛 | - | - | - | 东瓜屿、过境岛、跳尾岛 | ||
| 台山列岛 | - | 西台山 | 东台山 | 外半山、门前屿、南船屿、园屿、南屿 | ||
| 七星列岛 | - | 东星岛 | 西星岛 | 日屿 | ||
| 福瑶列岛 | 大嵛山 | - | 小嵛山 | |||
| 宁德市霞浦县 | 东部近陆诸岛 | - | 烽火岛 | 虎屿、北澳岛 | 割山屿、狮头屿、根竹仔屿、小目岛、大目岛、火烟山岛；佛堂岛、短表岛、长表岛、老虎头岛、屿尾岛、岐屿、笔架山、浸屿、长草屿 | |
| 西洋-浮鹰诸岛 | 西洋岛 | 浮鹰岛 | 小西洋岛、马刺岛 | 乌屿、大东屿、马鞍岛、魁山岛、尼姑屿 | ||
| 四礵列岛 | - | 北礵岛 | - | 东礵岛、西礵岛、南礵岛 | ||
| 三都澳诸岛 | - | 竹江岛、东安岛、长腰岛 | 雷江岛、大屿头岛 | 前屿、木屿 | ||
| 宁德市福安市 | - | 六屿、福屿 | - | |||
| 宁德市蕉城区 | 三都岛 | 青山岛、白匏岛、斗帽岛、鸡公山、云淡门岛、官沪岛、鸟屿 | - | 鸡笼屿、橄榄屿、猴毛屿 | ||
| 福州市罗源县 | 近陆诸岛 | - | - | - | ||
| 福州市连江县 | 北茭半岛周围 | - | 东洛岛 | 西洛岛、址洛岛 | 前屿、下屿 | |
| 马祖列岛[註 1] | ||||||
| 闽江口诸岛 | - | 粗芦岛、川石岛、壶江岛 | - | - | - | |
| 福州市马尾区 | 琅岐岛 | - | - | |||
| 福州市長樂區 | 近陆 | |||||
| 东洛列岛 | - | 东洛岛 | - | |||
| 白犬列岛[註 1] | ||||||
| 福州市福清市 | 近陆 | - | 吉钓岛、大板岛、可门岛、小麦屿 | 目屿 | 江阴岛、文关岛、东壁岛[註 2] | |
| 福州市平潭县 | 平潭诸岛 | 海壇岛[註 3]、屿头岛、大练岛、东庠岛、草屿 | 乐屿、小练岛、小庠岛、塘屿 | - | ||
| 莆田市辖区 | 近陆 | |||||
| 南日群岛 | 南日岛 | |||||
| 湄洲诸岛 | 湄洲岛 |
