威斯特伐利亞和約 簽訂後的德意志諸國德語國家在政治和宗教上在近代早期 （約1500-1800年）的存在分歧和差異。在中世紀晚期（約1250-1500年），組成神聖羅馬帝國的國家之間的宗教緊張局勢一直存在，尤其體現在波西米亞爆發的胡斯戰爭。然而這一時期決定性的宗教改革運動，導致了該地區前所未有的暴力和政治動盪。
通常認為宗教改革運動始於馬丁·路德 1517年在維滕貝格 市（當時在薩克森選侯國 ，現在位於薩克森-安哈爾特 境內）發表的九十五條論綱 。宗教改革將德國各州劃分為新的宗教界線：北部、東部和許多主要城市（如斯特拉斯堡、 法蘭克福 和紐倫堡 ）成為新教地區，而南部和西部地區基本上仍然是天主教徒。為了維護神聖羅馬帝國內部的穩定，1555年德意志諸侯和神聖羅馬帝國皇帝簽訂了奧格斯堡和約 。然而這些努力最終會失敗，並最終導致了三十年戰爭 （1618-1648年）這場歐洲大陸迄今為止最具破壞性的衝突之一。三十年戰爭以威斯特伐利亞和約 的簽訂而告終。
這一時期還見證了普魯士王國 的出現和壯大，它成為了前任霸權的哈布斯堡王朝 的主要競爭對手。在啟蒙時代 之後的歐洲近代早期結束和拿破崙戰爭期間神聖羅馬帝國解體之後，這種奧地利-普魯士的對抗 將成為19世紀德國歷史發展的最大驅動力。
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