2008年，厦深铁路广东段动工建设，在惠州市惠阳区设惠州南站。2009年，惠州南站选址于惠阳区淡水新桥村。2010年，惠州南站正式开工施建。 2013年，伴随厦深铁路全线通车，惠州南站投入使用。2017年，厦深铁路深圳至汕尾段每日开行城际列车，经停惠州南站。惠州南站主体建筑两层，附属建筑三层，采用以下进下出为主、上进下出为辅的进出站方式；设有一座旅客进站地下通道和一座旅客出站地下通道，连接站房与各站台；第一、二层均为候车大厅，三层为办公区域；站前广场地面与站房一层持平，设有公交车站、出租车站和其它社会车辆停车场；站台车场与站房二层持平。