| Vùng kết cấu kết hợp Zinc của Integrase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| solution structure of the n-terminal zn binding domain of hiv-1 integrase (e form), nmr, 38 structures | |||||||||
| Danh pháp | |||||||||
| Ký hiệu | Integrase_Zn | ||||||||
| Pfam | PF02022 | ||||||||
| InterPro | IPR003308 | ||||||||
| SCOP | 1wjb | ||||||||
| |||||||||
| Vùng kết cấu nhân Integrase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Crystal structure of the RSV two-domain integrase. | |||||||||
| Danh pháp | |||||||||
| Ký hiệu | rve | ||||||||
| Pfam | PF00665 | ||||||||
| Pfam clan | CL0219 | ||||||||
| InterPro | IPR001584 | ||||||||
| SCOP | 2itg | ||||||||
| |||||||||
| Vùng kết cấu kết hợp DNA của Integrase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||
| Crystal structure of the RSV two-domain integrase. | |||||||||
| Danh pháp | |||||||||
| Ký hiệu | IN_DBD_C | ||||||||
| Pfam | PF00552 | ||||||||
| InterPro | IPR001037 | ||||||||
| SCOP | 1ihw | ||||||||
| |||||||||
Integrase, hoặc gọi làenzym chỉnh hợp[Chú ý 1], làenzym trợ giúpvirus phiên mã ngược mangDNA -thông tin di truyền củavirus, chỉnh hợp vào trong DNA củatúc chủ.[1] Thông thường do virus tự thân mang vào, hơn nữa enzym chỉnh hợp không tồn tại ở tế bào túc chủ, cho nên có thể coi là một đích bắn thích hợp củathuốc kháng virus.
Các nhà nghiên cứu có thể đã tìm ra phương pháp mới để đối phóHIV, đó chính là ức chế một loại enzymHIV được gọi làenzym chỉnh hợp, nhà nghiên cứu đang thí nghiệm một loại thuốc mới, loại thuốc này có thể ức chế enzym chỉnh hợp, thông qua thí nghiệm trên thânkhỉ, phát hiện loại thuốc này có thể kiểm soát được sự lây nhiễm củabệnh HIV/AIDS.
Enzym chỉnh hợp của HIV-1 là enzym thiết yếu cho quá trình nhân đôi củavirus phiên mã ngược, nó thúc đẩyDNA củavirus chỉnh hợp vào trong DNAnhiễm sắc thể củatúc chủ để quá trình nhân đôi diễn ra nhanh hơn, nhưng mà trong tế bào con người không có chất tương tự, do đó trở thành mục tiêu giàu sức hấp dẫn và hợp lí cho việc chữa trị bệnh HIV/AIDS.
Có rất nhiều chất ức chế enzym chỉnh hợp của HIV-1 được giám định, trong đó một số hợp chất cho thấy hoạt tính ức chế có chọn lọc enzym chỉnh hợp HIV-1 và ngăn cản hoặc đứt gãy giữa chừng quá trình nhân đôi virus, và hai loại chất ức chế có ảnh hưởng nhất làhợp chấtvòng thơm polyhydroxy chứa catechol và hợp chất aryl β-diketo acid được báo cáo gần đây.
Các loại hợp chất khác nhau của thuốc mới kháng HIV, bao gồm dẫn xuấtBenzimidazole,Nucleoside, Polypeptide, hợp chất vòng thơm thay thếhydroxy và hợp chất diketo acid,...
Chỉnh hợp virus (chữ Anh:viral integration), gọi tắtchỉnh hợp, là danh từsinh học, chỉ quá trìnhvirus đem vật liệu di truyền (DNA hoặcRNA) của bản thân nó ghép vào trongnhiễm sắc thể củatế bàotúc chủ, những vật liệu di truyền này có thể dựa vào sự sao chép củatế bàotúc chủ mà sao chép. Chỉnh hợp virus thường hay thông qua enzym chỉnh hợp để hoàn thành.
Chỉnh hợp virus có thể chia thành ba loại: chỉnh hợp cưỡng ép, chỉnh hợp ngẫu nhiên và phần tử virus nội sinh.
Nếu chỉnh hợp virus là sự kiện cần thiết phải xảy ra trong quá trình nhân đôi virus, thì phương thức chỉnh hợp này được gọi là chỉnh hợp cưỡng ép. Virus chọn dùng phương thức chỉnh hợp này bao gồm virus thuộc họRetroviridae (họ Virus phiên mã ngược), họPseudoviridae (họ Virus giả) và họMetaviridae (họ Virus chuyển vị) cùng với một số virus thuộc họMyoviridae (họThể phệ khuẩn có đuôi cơ bắp) và họSiphoviridae (họThể phệ khuẩn có đuôi dài). Những virus này trong quá trình truyền nhiễmtế bàotúc chủ, sự chỉnh hợp của vật liệu di truyền sẽ khiến chobộ gen củavirus vĩnh viễn ghép vào trongnhiễm sắc thể củatế bàotúc chủ. Sự chỉnh hợp virus của họRetroviridae về sau gọi làprovirus (nguyên virus,en), sự chỉnh hợp virus làm truyền nhiễm tế bàosinh vật nhân sơ về sau gọi làprophage (nguyên thể phệ khuẩn,en).
Chỉnh hợp ngẫu nhiên chỉ sự chỉnh hợp của virus hoàn toàn không cần thiết trong quá trình nhân đôi virus. Tuy nhiên, sau chỉnh hợp sẽ mang đến một số lợi ích chovirus hoặctế bàotúc chủ. Virus có thể tiến hành truyền nhiễm không triệu chứng (tiềm ẩn) một khoảng thời gian dài trong tế bào túc chủ, đồng thời tế bào túc chủ cũng có thể thu được một số tính trạng hữu ích. Rất nhiềuđộc tốvi khuẩn chính là do prophage sản sinh sau khi chỉnh hợp.
Có một số virus thông qua cơ hội ngẫu nhiên và hiếm thấy mà chỉnh hợp vào trongnhiễm sắc thể củatế bàotúc chủ, sau đó lưu tồn trongbộ gen củatúc chủ sau khi đã từng trải một khoảng thời gian rất dài, gọi là virus nội sinh. Loại hình virus nội sinh đã biết bao gồm:
Quá trình chỉnh hợp virus vô cùng phức tạp. Lấyvirus phiên mã ngược nhưHIV (virus suy giảm miễn dịch ở người) làm ví dụ, quá trình chỉnh hợp có thể khái quát thành 6 bước trọng yếu:
Chất ức chế enzym chỉnh hợp HIV-1 do các nhà khoa học thuộcCông ty Merck & Co. khai mở phát triển, tháng 3 năm 2003 bắt đầu đi vào nghiên cứu lâm sàng giai đoạn 1 ởHoa Kì vàBỉ, đối tượng là tình nguyện viên chưa từng bị truyền nhiễm HIV. Nghiên cứu lâm sàng giai đoạn 1 là giai đoạn đầu tiên nhất của thí nghiệm trên cơ thể người, mục đích chủ yếu là đánh giá tính an toàn, tính dung nạp vàđộng lực học dược vật (mức độ chuyển hoá thuốc trong máu) của thuốc nghiên cứu. Theo tiến sĩ y học Jeffrey Chodakewitz - phó Chủ tịch Ban Nghiên cứu lâm sàng vaccine và Bệnh tật truyền nhiễm thuộcCông ty Merck & Co.,Hoa Kì, nói rằng cho đến nay, có số ít tình nguyện viên khoẻ mạnh (không đến 70 người) đã tham dự nghiên cứu, họ về tổng thể dung nạp tốt đối với thuốc. Ông chú ý đến số liệu tiền lâm sàng hiện tại ủng hộ liều lượng mỗi ngày hai lần, giả sử tất cả nghiên cứu đều tiến hành thuận lợi, vẫn cần nghiên cứu thông qua lâm sàng để xác định liều lượng uống thuốc thích hợp.
Một bài nghiên cứu đăng tải trên tạp chíScience vào ngày 8 tháng 7 năm 2004 chỉ ra, báo cáo của công ty Merck nói rằng, khi khỉ bị HIV truyền nhiễm thời kì đầu dùng loại thuốc này, đã đóng vai trò bảo vệ rõ rệt đối với loài khỉ, do đó loọi thuốc này được gọi là chất ức chế enzym chỉnh hợp, thuốc cũng có hiệu quả đối với người bệnh nặng.Công ty Merck & Co. còn đang nghiên cứu một vài chất ức chế enzym chỉnh hợp, họ dùng một số tình nguyện viên tiến hành thí nghiệm, để tiện xác định loại thuốc này có an toàn không, có đủ tác dụng ức chế đối với virus lọc[Chú ý 2] hay không.