Nơi cao nhất ở Idaho (3,9 km hay 12.662foot) làđỉnh Borah ởdãy núi Sông Mất (Lost River Mountains) về phía bắc củaMackay. Nơi thấp nhất của Idaho nằm trongLewiston, ở đấy sông Clearwater nối với sông Rắn và chảy tiếp tớiWashington.
Miền Idaho có thể có người ở từ 14.500 năm trước đây. Khi các nhàkhao cổ học đào tạihang Ụ Wilson (Wilson Butte Cave) gầnTwin Falls vào năm1959, họ tìm ra những đồ của con người, bao gồm nhữngđầu mũi tên, những trong đồ tạo tác cũ nhất tạiBắc Mỹ. Cácthổ dân Mỹ đông nhất ở vùng đó có ngườiNez Perce về miền bắc và nhánh bắc và tây của dânShoshone về miền nam.
Ngành buôn bán lông thú và công việc truyền giáo mang những thực dân đầu tiên vào miền này. Năm1809,Nhà Kullyspell, nhà đầu tiên có ngườiMỹ trắng làm chủ và trạm buôn bán đầu tiên ở Idaho, được xây dựng. Năm1836,Henry H. Spalding xây mộthội truyền giáo gầnLapwai, ở đấy ông in ra cuốn sách đầu tiên của miền Tây Bắc, thành lập nhà trường đầu tiên của Idaho, xây dựng hệ thống tưới đầu tiên, và trồngkhoai tây đầu tiên của tiểu bang.Narcissa Whitman vàEliza Hart Spalding là những phụ nữ da trắng đầu tiên vào miền Idaho ngày nay. Hội truyền giáo Cataldo, kiến trúc cũ nhất vẫn đứng ở Idaho, được xây dựng tạiCataldo bởidân Coeur d'Alene và các nhà truyền giáoCông giáo từ năm1848 đến1853.
Trong thời kỳ này, miền Idaho thuộc về lãnh thổ vô tổ chức được gọi Miền Oregon và bị Hoa Kỳ vàVương quốc Anh tuyên bố quyền đất này. Hoa Kỳ giành được quyền đất này doHiệp ước Oregon năm1846. Biên giới đầu tiên củaLãnh thổ Oregon vào năm1848 bao gồm cả ba tiểu bang ven biển thuộc miền Tây Bắc ngày nay và kéo dài về hướng đông tớiđường chia lục địa. Năm1853, các vùng ở bên bắc củavĩ tuyến 46° bắc được trở thành Lãnh thổ Washington, chia đôi miền Idaho ngày nay. Miền này được hợp nhất lại vào năm1859, sau khi Oregon được phong cấp tiểu bang và các biên giớiLãnh thổ Washington bị vẽ lại.
Bản đồ Đường Oregon cũ (1852–1906) doEzra Meeker vẽ
Tuy hàng ngàn người đi qua Idaho trênĐường Oregon và qua miền này do cuộcđổ xô tìm vàng ở California năm1849, nhưng chỉ có ít người ở lâu. Thị trấn đầu tiên ở Idaho làFranklin, được thành lập vào tháng 4 năm1860 bởi các ngườiMormon tin rằng họ vẫn còn ởLãnh thổ Utah (cuộc đo đạc sau đó cho rằng họ thực sự đã qua biên giới). Sau đó cùng năm, cuộc đổ xô tìm vàng đầu tiên trong một loạt đổ xô ở Idaho bắt đầu tạiPierce ởQuận Clearwater ngày nay. Tới năm1862, các thị trấn đã được xây dựng ở miền bắc và miền nam do công nghiệp mỏ mở mang.
Ngày4 tháng 3 năm1863,Tổng thốngAbraham Lincoln ký đạo luật thành lậpLãnh thổ Idaho từ những phần của Lãnh thổ Washington vàLãnh thổ Dakota với thủ phủ tạiLewiston. Lãnh thổ Idaho đầu tiên bao gồm phần lớn của những vùng mà tương lai được trở thành các tiểu bang Idaho, Montana, và Wyoming, và có dân số ít hơn 17.000 người. Lãnh thổ Idaho được cùng biên giới với tiểu bang ngày nay vào năm1868.
Khi Tổng thốngBenjamin Harrison ký đạo luật nhận Idaho là tiểu bang Hoa Kỳ ngày3 tháng 7 năm1890, dân số của tiểu bang là 88.548 người.George L. Shoup được trở thành thống đốc đầu tiên của tiểu bang này.
Idaho có tên rất bất thường. Có lẽ là đây là tiểu bang duy nhất được đặt tên do mộttrò đánh lừa. Khi người ta đang chọn tên cho lãnh thổ mới, người vận động hành langGeorge M. Willing đề nghị "Idaho" vì cho rằng đây là một từ trong tiếng thổ dân có nghĩa "cái quý nhất của dãy núi". Sau đó, ông Willing bị phát hiện là đã tự đặt ra cái tên này, và vì thế lãnh thổ Idaho này được đổi tên thànhColorado. Cuối cùng, chuyện này bị quên lãng, và Idaho ngày nay được đặt tên này khi Lãnh thổ Idaho được thành lập chính thức năm 1863.