ZNF644 Ідентифікатори Символи ZNF644 Зовнішні ІД OMIM :614159 MGI: 1277212 HomoloGene: 12971 GeneCards: ZNF644 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 1: 90.92 – 91.02 Mb Хр. 5: 106.62 – 106.7 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ZNF644 (англ. Zinc finger protein 644 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 149 565[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MRSFLQQDVN KTKSRLNVLN GLANNMDDLK INTDITGAKE ELLDDNNFIS DKESGVHKPK DCQTSFQKNN TLTLPEELSK DKSENALSGG QSSLFIHAGA PTVSSENFIL PKGAAVNGPV SHSSLTKTSN MNKGSVSLTT GQPVDQPTTE SCSTLKVAAD LQLSTPQKAS QHQVLFLLSD VAHAKNPTHS NKKLPTSASV GCDIQNSVGS NIKSDGTLIN QVEVGEDGED LLVKDDCVNT VTGISSGTDG FRSENDTNWD PQKEFIQFLM TNEETVDKAP PHSKIGLEKK RKRKMDVSKI TRYTEDCFSD SNCVPNKSKM QEVDFLEQNE ELQAVDSQKY ALSKVKPEST DEDLESVDAF QHLIYNPDKC GEESSPVHTS TFLSNTLKKK CEESDSESPA TFSTEEPSFY PCTKCNVNFR EKKHLHRHMM YHLDGNSHFR HLNVPRPYAC RECGRTFRDR NSLLKHMIIH QERRQKLMEE IRELKELQDE GRSARLQCPQ CVFGTNCPKT FVQHAKTHEK DKRYYCCEEC NFMAVTENEL ECHRGIAHGA VVKCPMVTSD IAQRKTQKKT FMKDSVVGSS KKSATYICKM CPFTTSAKSV LKKHTEYLHS SSCVDSFGSP LGLDKRKNDI LEEPVDSDST KTLTKQQSTT FPKNSALKQD VKRTFGSTSQ SSSFSKIHKR PHRIQKARKS IAQSGVNMCN QNSSPHKNVT IKSSVDQKPK YFHQAAKEKS NAKANSHYLY RHKYENYRMI KKSGESYPVH FKKEEASSLN SLHLFSSSSN SHNNFISDPH KPDAKRPESF KDHRRVAVKR VIKESKKESS VGGEDLDSYP DFLHKMTVVV LQKLNSAEKK DSYETEDESS WDNVELGDYT TQAIEDETYS DINQEHVNLF PLFKSKVEGQ EPGENATLSY DQNDGFYFEY YEDTGSNNFL HEIHDPQHLE TADASLSKHS SVFHWTDLSL EKKSCPYCPA TFETGVGLSN HVRGHLHRAG LSYEARHVVS PEQIATSDKM QHFKRTGTGT PVKRVRKAIE KSETTSEHTC QLCGGWFDTK IGLSNHVRGH LKRLGKTKWD AHKSPICVLN EMMQNEEKYE KILKALNSRR IIPRPFVAQK LASSDDFISQ NVIPLEAYRN GLKTEALSVS ASEEEGLNFL NEYDETKPEL PSGKKNQSLT LIELLKNKRM GEERNSAISP QKIHNQTARK RFVQKCVLPL NEDSPLMYQP QKMDLTMHSA LDCKQKKSRS RSGSKKKMLT LPHGADEVYI LRCRFCGLVF RGPLSVQEDW IKHLQRHIVN ANLPRTGAGM VEVTSLLKKP ASITETSFSL LMAEAAS
Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції , поліморфізм,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .111 : 12432—12437. PMID 25114211 doi :10.1073/pnas.1413825111 Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.Cell Rep .10 : 1778—1791. PMID 25772364 doi :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
