Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

ZNF638

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

ZNF638

Ідентифікатори

Символи

ZNF638, NP220, ZFML, Zfp638, zinc finger protein 638

Зовнішні ІД

OMIM:614349 MGI:1203484 HomoloGene:7447 GeneCards:ZNF638

Онтологія гена
Молекулярна функція	•зв’язування з іоном металу •DNA binding •zinc ion binding •зв’язування дволанцюгових ДНК •nucleic acid binding •RNA binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •nuclear speck •внутрішньоклітинна мембранна органела •клітинне ядро •нуклеоплазма
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •transcription, DNA-templated •Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


27332


18139

Ensembl


ENSG00000075292


ENSMUSG00000030016

UniProt


Q14966


Q61464

RefSeq (мРНК)


NM_001014972 NM_001252612 NM_001252613 NM_014497


NM_001166371 NM_008717 NM_001355284 NM_001355285 NM_001355286

RefSeq (білок)


NP_001014972 NP_001239541 NP_001239542 NP_055312

NP_001159843 NP_032743 NP_001342213 NP_001342214 NP_001342215
NP_001393000 NP_001393001 NP_001393002 NP_001393003 NP_001393004 NP_001393005 NP_001393006 NP_001393007 NP_001393008 NP_001393009 NP_001393010 NP_001393011 NP_001393012 NP_001393013

Локус (UCSC)

Хр. 2: 71.28 – 71.44 Mb

Хр. 6: 83.84 – 83.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF638 (англ.Zinc finger protein 638) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 978амінокислот, амолекулярна маса — 220 625^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRPRFNPRG	DFPLQRPRAP	NPSGMRPPGP	FMRPGSMGLP	RFYPAGRARG
IPHRFAGHES	YQNMGPQRMN	VQVTQHRTDP	RLTKEKLDFH	EAQQKKGKPH
GSRWDDEPHI	SASVAVKQSS	VTQVTEQSPK	VQSRYTKESA	SSILASFGLS
NEDLEELSRY	PDEQLTPENM	PLILRDIRMR	KMGRRLPNLP	SQSRNKETLG
SEAVSSNVID	YGHASKYGYT	EDPLEVRIYD	PEIPTDEVEN	EFQSQQNISA
SVPNPNVICN	SMFPVEDVFR	QMDFPGESSN	NRSFFSVESG	TKMSGLHISG
GQSVLEPIKS	VNQSINQTVS	QTMSQSLIPP	SMNQQPFSSE	LISSVSQQER
IPHEPVINSS	NVHVGSRGSK	KNYQSQADIP	IRSPFGIVKA	SWLPKFSHAD
AQKMKRLPTP	SMMNDYYAAS	PRIFPHLCSL	CNVECSHLKD	WIQHQNTSTH
IESCRQLRQQ	YPDWNPEILP	SRRNEGNRKE	NETPRRRSHS	PSPRRSRRSS
SSHRFRRSRS	PMHYMYRPRS	RSPRICHRFI	SRYRSRSRSR	SPYRIRNPFR
GSPKCFRSVS	PERMSRRSVR	SSDRKKALED	VVQRSGHGTE	FNKQKHLEAA
DKGHSPAQKP	KTSSGTKPSV	KPTSATKSDS	NLGGHSIRCK	SKNLEDDTLS
ECKQVSDKAV	SLQRKLRKEQ	SLHYGSVLLI	TELPEDGCTE	EDVRKLFQPF
GKVNDVLIVP	YRKEAYLEME	FKEAITAIMK	YIETTPLTIK	GKSVKICVPG
KKKAQNKEVK	KKTLESKKVS	ASTLKRDADA	SKAVEIVTST	SAAKTGQAKA
SVAKVNKSTG	KSASSVKSVV	TVAVKGNKAS	IKTAKSGGKK	SLEAKKTGNV
KNKDSNKPVT	IPENSEIKTS	IEVKATENCA	KEAISDAALE	ATENEPLNKE
TEEMCVMLVS	NLPNKGYSVE	EVYDLAKPFG	GLKDILILSS	HKKAYIEINR
KAAESMVKFY	TCFPVLMDGN	QLSISMAPEN	MNIKDEEAIF	ITLVKENDPE
ANIDTIYDRF	VHLDNLPEDG	LQCVLCVGLQ	FGKVDHHVFI	SNRNKAILQL
DSPESAQSMY	SFLKQNPQNI	GDHMLTCSLS	PKIDLPEVQI	EHDPELEKES
PGLKNSPIDE	SEVQTATDSP	SVKPNELEEE	STPSIQTETL	VQQEEPCEEE
AEKATCDSDF	AVETLELETQ	GEEVKEEIPL	VASASVSIEQ	FTENAEECAL
NQQMFNSDLE	KKGAEIINPK	TALLPSDSVF	AEERNLKGIL	EESPSEAEDF
ISGITQTMVE	AVAEVEKNET	VSEILPSTCI	VTLVPGIPTG	DEKTVDKKNI
SEKKGNMDEK	EEKEFNTKET	RMDLQIGTEK	AEKNEGRMDA	EKVEKMAAMK
EKPAENTLFK	AYPNKGVGQA	NKPDETSKTS	ILAVSDVSSS	KPSIKAVIVS
SPKAKATVSK	TENQKSFPKS	VPRDQINAEK	KLSAKEFGLL	KPTSARSGLA
ESSSKFKPTQ	SSLTRGGSGR	ISALQGKLSK	LDYRDITKQS	QETEARPSIM
KRDDSNNKTL	AEQNTKNPKS	TTGRSSKSKE	EPLFPFNLDE	FVTVDEVIEE
VNPSQAKQNP	LKGKRKETLK	NVPFSELNLK	KKKGKTSTPR	GVEGELSFVT
LDEIGEEEDA	AAHLAQALVT	VDEVIDEEEL	NMEEMVKNSN	SLFTLDELID
QDDCISHSEP	KDVTVLSVAE	EQDLLKQERL	VTVDEIGEVE	ELPLNESADI
TFATLNTKGN	EGDTVRDSIG	FISSQVPEDP	STLVTVDEIQ	DDSSDLHLVT
LDEVTEEDED	SLADFNNLKE	ELNFVTVDEV	GEEEDGDNDL	KVELAQSKND
HPTDKKGNRK	KRAVDTKKTK	LESLSQVGPV	NENVMEEDLK	TMIERHLTAK
TPTKRVRIGK	TLPSEKAVVT	EPAKGEEAFQ	MSEVDEESGL	KDSEPERKRK
KTEDSSSGKS	VASDVPEELD	FLVPKAGFFC	PICSLFYSGE	KAMTNHCKST
RHKQNTEKFM	AKQRKEKEQN	EAEERSSR

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, поліморфізм,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК,РНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006).A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.Nat. Biotechnol.24: 1285—1292.PMID 16964243doi:10.1038/nbt1240

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17894 (англ.) . Архіворигіналу за 10 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.[Архівовано 2017-05-10 уWayback Machine.]
↑UniProt, Q14966 (англ.) . Архіворигіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 2

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=ZNF638&oldid=46339449

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭