ZNF471 Ідентифікатори Символи ZNF471 Зовнішні ІД MGI: 107783 HomoloGene: 128524 GeneCards: ZNF471 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 19: 56.51 – 56.53 Mb Хр. 7: 6.37 – 6.39 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ZNF471 (англ. Zinc finger protein 471 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 73 009[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MNVEVVKVMP QDLVTFKDVA IDFSQEEWQW MNPAQKRLYR SMMLENYQSL VSLGLCISKP YVISLLEQGR EPWEMTSEMT RSPFSDWESI YVTQELPLKQ FMYDDACMEG ITSYGLECST FEENWKWEDL FEKQMGSHEM FSKKEIITHK ETITKETEFK YTKFGKCIHL ENIEESIYNH TSDKKSFSKN SMVIKHKKVY VGKKLFKCNE CDKTFTHSSS LTVHFRIHTG EKPYACEECG KAFKQRQHLA QHHRTHTGEK LFECKECRKA FKQSEHLIQH QRIHTGEKPY KCKECRKAFR QPAHLAQHQR IHTGEKPYEC KECGKAFSDG SSFARHQRCH TGKRPYECIE CGKAFRYNTS FIRHWRSYHT GEKPFNCIDC GKAFSVHIGL ILHRRIHTGE KPYKCGVCGK TFSSGSSRTV HQRIHTGEKP YECDICGKDF SHHASLTQHQ RVHSGEKPYE CKECGKAFRQ NVHLVSHLRI HTGEKPYECK ECGKAFRISS QLATHQRIHT GEKPYECIEC GNAFKQRSHL AQHQKTHTGE KPYECNECGK AFSQTSNLTQ HQRIHTGEKP YKCTECGKAF SDSSSCAQHQ RLHTGQRPYQ CFECGKAFRR KLSLICHQRS HTGEEP
Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.DNA Res .7 : 65—73. PMID 10718198 doi :10.1093/dnares/7.1.65
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
