ZNF3 Ідентифікатори Символи ZNF3 Зовнішні ІД OMIM :194510 MGI: 1929116 HomoloGene: 50027 GeneCards: ZNF3 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • identical protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес • multicellular organism development • leukocyte activation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 7: 100.06 – 100.08 Mb Хр. 5: 138.14 – 138.15 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ZNF3 (англ. Zinc finger protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 50 916[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 METQADLVSQ EPQALLDSAL PSKVPAFSDK DSLGDEMLAA ALLKAKSQEL VTFEDVAVYF IRKEWKRLEP AQRDLYRDVM LENYGNVFSL DRETRTENDQ EISEDTRSHG VLLGRFQKDI SQGLKFKEAY EREVSLKRPL GNSPGERLNR KMPDFGQVTV EEKLTPRGER SEKYNDFGNS FTVNSNLISH QRLPVGDRPH KCDECSKSFN RTSDLIQHQR IHTGEKPYEC NECGKAFSQS SHLIQHQRIH TGEKPYECSD CGKTFSCSSA LILHRRIHTG EKPYECNECG KTFSWSSTLT HHQRIHTGEK PYACNECGKA FSRSSTLIHH QRIHTGEKPY ECNECGKAFS QSSHLYQHQR IHTGEKPYEC MECGGKFTYS SGLIQHQRIH TGENPYECSE CGKAFRYSSA LVRHQRIHTG EKPLNGIGMS KSSLRVTTEL NIREST
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,білків розвитку ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Rosati M., Marino M., Franze A., Tramontano A., Grimaldi G. (1991).Members of the zinc finger protein gene family sharing a conserved N-terminal module .Nucleic Acids Res .19 : 5661—5667. PMID 1945843 doi :10.1093/nar/19.20.5661 Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.Cell Rep .10 : 1778—1791. PMID 25772364 doi :10.1016/j.celrep.2015.02.033 Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells.New Biol .2 : 363—374. PMID 2288909
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
