Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

ZNF281

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

ZNF281

Ідентифікатори

Символи

ZNF281, ZBP-99, ZNP-99, zinc finger protein 281, ZBP99, GZP1

Зовнішні ІД

MGI:3029290 HomoloGene:8270 GeneCards:ZNF281

Онтологія гена
Молекулярна функція	•sequence-specific DNA binding •DNA binding •GO:0001106 transcription corepressor activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •зв’язування з іоном металу •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •nucleic acid binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•нуклеоплазма •клітинне ядро
Біологічний процес	•диференціація клітин •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •embryonic body morphogenesis •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of gene expression •transcription, DNA-templated •stem cell differentiation •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23528


226442

Ensembl


ENSG00000162702


ENSMUSG00000041483

UniProt


Q9Y2X9


Q99LI5

RefSeq (мРНК)


NM_012482 NM_001281293 NM_001281294


NM_001160251 NM_177643

RefSeq (білок)


NP_001268222 NP_001268223 NP_036614


NP_001153723 NP_808311

Локус (UCSC)

Хр. 1: 200.4 – 200.41 Mb

Хр. 1: 136.55 – 136.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF281 (англ.Zinc finger protein 281) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 895амінокислот, амолекулярна маса — 96 915^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKIGSGFLSG	GGGTGSSGGS	GSGGGGSGGG	GGGGSSGRRA	EMEPTFPQGM
VMFNHRLPPV	TSFTRPAGSA	APPPQCVLSS	STSAAPAAEP	PPPPAPDMTF
KKEPAASAAA	FPSQRTSWGF	LQSLVSIKQE	KPADPEEQQS	HHHHHHHHYG
GLFAGAEERS	PGLGGGEGGS	HGVIQDLSIL	HQHVQQQPAQ	HHRDVLLSSS
SRTDDHHGTE	EPKQDTNVKK	AKRPKPESQG	IKAKRKPSAS	SKPSLVGDGE
GAILSPSQKP	HICDHCSAAF	RSSYHLRRHV	LIHTGERPFQ	CSQCSMGFIQ
KYLLQRHEKI	HSREKPFGCD	QCSMKFIQKY	HMERHKRTHS	GEKPYKCDTC
QQYFSRTDRL	LKHRRTCGEV	IVKGATSAEP	GSSNHTNMGN	LAVLSQGNTS
SSRRKTKSKS	IAIENKEQKT	GKTNESQISN	NINMQSYSVE	MPTVSSSGGI
IGTGIDELQK	RVPKLIFKKG	SRKNTDKNYL	NFVSPLPDIV	GQKSLSGKPS
GSLGIVSNNS	VETIGLLQST	SGKQGQISSN	YDDAMQFSKK	RRYLPTASSN
SAFSINVGHM	VSQQSVIQSA	GVSVLDNEAP	LSLIDSSALN	AEIKSCHDKS
GIPDEVLQSI	LDQYSNKSES	QKEDPFNIAE	PRVDLHTSGE	HSELVQEENL
SPGTQTPSND	KASMLQEYSK	YLQQAFEKST	NASFTLGHGF	QFVSLSSPLH
NHTLFPEKQI	YTTSPLECGF	GQSVTSVLPS	SLPKPPFGML	FGSQPGLYLS
ALDATHQQLT	PSQELDDLID	SQKNLETSSA	FQSSSQKLTS	QKEQKNLESS
TGFQIPSQEL	ASQIDPQKDI	EPRTTYQIEN	FAQAFGSQFK	SGSRVPMTFI
TNSNGEVDHR	VRTSVSDFSG	YTNMMSDVSE	PCSTRVKTPT	SQSYR

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, диференціація, поліморфізм,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Law D.J., Du M., Law G.L., Merchant J.L. (1999). ZBP-99 defines a conserved family of transcription factors and regulates ornithine decarboxylase gene expression.Biochem. Biophys. Res. Commun.262: 113—120.PMID 10448078doi:10.1006/bbrc.1999.1180
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Zhang X., Diab I.H., Zehner Z.E. (2003). ZBP-89 represses vimentin gene transcription by interacting with the transcriptional activator, Sp1.Nucleic Acids Res.31: 2900—2914.PMID 12771217doi:10.1093/nar/gkg380
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.Cell Rep.10: 1778—1791.PMID 25772364doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13075 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q9Y2X9 (англ.) . Архіворигіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 1

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=ZNF281&oldid=46339428

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭