ZNF148 Ідентифікатори Символи ZNF148 Зовнішні ІД OMIM :601897 MGI: 1332234 HomoloGene: 8003 GeneCards: ZNF148 Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • substantia nigra development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular defense response • gamete generation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) н/д Хр. 16: 33.2 – 33.32 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ZNF148 (англ. Zinc finger protein 148 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 88 976[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MNIDDKLEGL FLKCGGIDEM QSSRTMVVMG GVSGQSTVSG ELQDSVLQDR SMPHQEILAA DEVLQESEMR QQDMISHDEL MVHEETVKND EEQMETHERL PQGLQYALNV PISVKQEITF TDVSEQLMRD KKQIREPVDL QKKKKRKQRS PAKILTINED GSLGLKTPKS HVCEHCNAAF RTNYHLQRHV FIHTGEKPFQ CSQCDMRFIQ KYLLQRHEKI HTGEKPFRCD ECGMRFIQKY HMERHKRTHS GEKPYQCEYC LQYFSRTDRV LKHKRMCHEN HDKKLNRCAI KGGLLTSEED SGFSTSPKDN SLPKKKRQKT EKKSSGMDKE SALDKSDLKK DKNDYLPLYS SSTKVKDEYM VAEYAVEMPH SSVGGSHLED ASGEIHPPKL VLKKINSKRS LKQPLEQNQT ISPLSTYEES KVSKYAFELV DKQALLDSEG NADIDQVDNL QEGPSKPVHS STNYDDAMQF LKKKRYLQAA SNNSREYALN VGTIASQPSV TQAAVASVID ESTTASILES QALNVEIKSN HDKNVIPDEV LQTLLDHYSH KANGQHEISF SVADTEVTSS ISINSSEVPE VTPSENVGSS SQASSSDKAN MLQEYSKFLQ QALDRTSQND AYLNSPSLNF VTDNQTLPNQ PAFSSIDKQV YATMPINSFR SGMNSPLRTT PDKSHFGLIV GDSQHSFPFS GDETNHASAT STQDFLDQVT SQKKAEAQPV HQAYQMSSFE QPFRAPYHGS RAGIATQFST ANGQVNLRGP GTSAEFSEFP LVNVNDNRAG MTSSPDATTG QTFG
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції , ацетиляція,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
Law D.J., Tarle S.A., Merchant J.L. (1998). The human ZBP-89 homolog, located at chromosome 3q21, represses gastrin gene expression.Mamm. Genome .9 : 165—167. PMID 9457682 doi :10.1007/s003359900711 Ye S., Whatling C., Watkins H., Henney A. (1999).Human stromelysin gene promoter activity is modulated by transcription factor ZBP-89 .FEBS Lett .450 : 268—272. PMID 10359087 doi :10.1016/S0014-5793(99)00509-8 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006).A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization .Nat. Biotechnol .24 : 1285—1292. PMID 16964243 doi :10.1038/nbt1240 Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .111 : 12432—12437. PMID 25114211 doi :10.1073/pnas.1413825111
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
