YY1 Ідентифікатори Символи YY1 Зовнішні ІД OMIM :600013 MGI: 99150 HomoloGene: 2556 GeneCards: YY1 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • four-way junction DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • SMAD binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding
Клітинна компонента • Ino80 complex • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription regulator complex • цитоплазма • PcG protein complex
Біологічний процес • диференціація клітин • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to UV • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair via homologous recombination • Сперматогенез • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • negative regulation of interferon-beta production • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA localization • anterior/posterior pattern specification • response to UV-C • GO:1901313 positive regulation of gene expression • response to prostaglandin F • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • camera-type eye morphogenesis • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • cellular response to interleukin-1 • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 14: 100.24 – 100.28 Mb Хр. 12: 108.76 – 108.79 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
YY1 (англ. YY1 transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 44 713[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MASGDTLYIA TDGSEMPAEI VELHEIEVET IPVETIETTV VGEEEEEDDD DEDGGGGDHG GGGGHGHAGH HHHHHHHHHH PPMIALQPLV TDDPTQVHHH QEVILVQTRE EVVGGDDSDG LRAEDGFEDQ ILIPVPAPAG GDDDYIEQTL VTVAAAGKSG GGGSSSSGGG RVKKGGGKKS GKKSYLSGGA GAAGGGGADP GNKKWEQKQV QIKTLEGEFS VTMWSSDEKK DIDHETVVEE QIIGENSPPD YSEYMTGKKL PPGGIPGIDL SDPKQLAEFA RMKPRKIKED DAPRTIACPH KGCTKMFRDN SAMRKHLHTH GPRVHVCAEC GKAFVESSKL KRHQLVHTGE KPFQCTFEGC GKRFSLDFNL RTHVRIHTGD RPYVCPFDGC NKKFAQSTNL KSHILTHAKA KNNQ
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,активаторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , пошкодження ДНК,репарація ДНК ,рекомбінація ДНК ,диференціація клітин ,сперматогенез . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
Shi Y., Seto E., Chang L.-S., Shenk T. (1991). Transcriptional repression by YY1, a human GLI-Kruppel-related protein, and relief of repression by adenovirus E1A protein.Cell .67 : 377—388. PMID 1655281 doi :10.1016/0092-8674(91)90189-6 Park K., Atchison M. (1991). Isolation of a candidate repressor/activator, NF-E1 (YY-1, delta), that binds to the immunoglobulin kappa 3' enhancer and the immunoglobulin heavy-chain mu E1 site.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .88 : 9804—9808. PMID 1946405 doi :10.1073/pnas.88.21.9804 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.-J., Lee T.-C. (1997). Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1.Nucleic Acids Res .25 : 843—849. PMID 9016636 doi :10.1093/nar/25.4.843 Oei S.L., Shi Y. (2001). Poly(ADP-ribosyl)ation of transcription factor Yin Yang 1 under conditions of DNA damage.Biochem. Biophys. Res. Commun .285 : 27—31. PMID 11437367 doi :10.1006/bbrc.2001.5115 Satijn D.P.E., Hamer K.M., den Blaauwen J., Otte A.P. (2001).The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos .Mol. Cell. Biol .21 : 1360—1369. PMID 11158321 doi :10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
