Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

WT1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

WT1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1XF7,2JP9,2JPA,2PRT,3HPJ,3MYJ,4R2E,4R2P,4R2Q,4R2R,4R2S,4WUU

Ідентифікатори

Символи

WT1, AEWS-GUD, NPHS4, WAGR, WIT-2, WT33, Wilms tumor 1, WT1 transcription factor, WT-1

Зовнішні ІД

OMIM:607102 MGI:98968 HomoloGene:11536 GeneCards:WT1

Пов'язані генетичні захворювання

Frasier syndrome,Denys-Drash syndrome,Meacham syndrome,familial idiopathic steroid-resistant nephrotic syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•sequence-specific DNA binding •DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •zinc ion binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •C2H2 zinc finger domain binding •зв'язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •RNA binding •nucleic acid binding •double-stranded methylated DNA binding •hemi-methylated DNA-binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •nuclear speck •нуклеоплазма •ядерце •клітинне ядро •гіалоплазма
Біологічний процес	•germ cell development •adrenal cortex formation •ureteric bud development •negative regulation of translation •male gonad development •male genitalia development •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •epithelial cell differentiation •glomerular basement membrane development •diaphragm development •розвиток нирки •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •posterior mesonephric tubule development •visceral serous pericardium development •metanephric epithelium development •negative regulation of apoptotic process •glomerulus development •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •adrenal gland development •transcription, DNA-templated •positive regulation of metanephric ureteric bud development •васкулогенез •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of heart growth •heart development •negative regulation of female gonad development •branching involved in ureteric bud morphogenesis •regulation of animal organ formation •Детермінація статі •negative regulation of cell growth •Сплайсинг РНК •cardiac muscle cell fate commitment •гістогенез •positive regulation of apoptotic process •camera-type eye development •metanephric S-shaped body morphogenesis •thorax and anterior abdomen determination •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •gonad development •metanephric mesenchyme development •cellular response to gonadotropin stimulus •positive regulation of male gonad development •cellular response to cAMP •negative regulation of cell population proliferation •mesenchymal to epithelial transition •negative regulation of metanephric glomerular mesangial cell proliferation •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •glomerular visceral epithelial cell differentiation •GO:1901313 positive regulation of gene expression •positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II •positive regulation of DNA methylation
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7490


22431

Ensembl


ENSG00000184937


ENSMUSG00000016458

UniProt


P19544


P22561 Q199A7

RefSeq (мРНК)

NM_024426 NM_000378 NM_001198551 NM_001198552 NM_024424
NM_024425 NM_001367854


NM_144783

RefSeq (білок)

NP_000369 NP_001185480 NP_001185481 NP_077742 NP_077744
NP_001354783 NP_000369.3 NP_001185480.1 NP_001185481.1 NP_077742.2 NP_077744.3


NP_659032

Локус (UCSC)

Хр. 11: 32.39 – 32.44 Mb

Хр. 2: 104.96 – 105 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WT1 (англ.Wilms tumor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 449амінокислот, амолекулярна маса — 49 188^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSDVRDLNA	LLPAVPSLGG	GGGCALPVSG	AAQWAPVLDF	APPGASAYGS
LGGPAPPPAP	PPPPPPPPHS	FIKQEPSWGG	AEPHEEQCLS	AFTVHFSGQF
TGTAGACRYG	PFGPPPPSQA	SSGQARMFPN	APYLPSCLES	QPAIRNQGYS
TVTFDGTPSY	GHTPSHHAAQ	FPNHSFKHED	PMGQQGSLGE	QQYSVPPPVY
GCHTPTDSCT	GSQALLLRTP	YSSDNLYQMT	SQLECMTWNQ	MNLGATLKGV
AAGSSSSVKW	TEGQSNHSTG	YESDNHTTPI	LCGAQYRIHT	HGVFRGIQDV
RRVPGVAPTL	VRSASETSEK	RPFMCAYPGC	NKRYFKLSHL	QMHSRKHTGE
KPYQCDFKDC	ERRFSRSDQL	KRHQRRHTGV	KPFQCKTCQR	KFSRSDHLKT
HTRTHTGKTS	EKPFSCRWPS	CQKKFARSDE	LVRHHNMHQR	NMTKLQLAL

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК,РНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Gessler M., Konig A., Bruns G.A.P. (1992). The genomic organization and expression of the WT1 gene.Genomics.12: 807—813.PMID 1572653doi:10.1016/0888-7543(92)90313-H
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Hamilton T.B., Barilla K.C., Romaniuk P.J. (1995). High affinity binding sites for the Wilms' tumour suppressor protein WT1.Nucleic Acids Res.23: 277—284.PMID 7862533doi:10.1093/nar/23.2.277
Buckler A.J., Pelletier J., Haber D.A., Glaser T., Housman D.E. (1991).Isolation, characterization, and expression of the murine Wilms' tumor gene (WT1) during kidney development.Mol. Cell. Biol.11: 1707—1712.PMID 1671709doi:10.1128/MCB.11.3.1707
Sharma P.M., Bowman M., Madden S.L., Rauscher F.J. III, Sukumar S. (1994). RNA editing in the Wilms' tumor susceptibility gene, WT1.Genes Dev.8: 720—731.PMID 7926762doi:10.1101/gad.8.6.720
Bruening W., Pelletier J. (1996). A non-AUG translational initiation event generates novel WT1 isoforms.J. Biol. Chem.271: 8646—8654.PMID 8621495doi:10.1074/jbc.271.15.8646

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з WT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12796 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P19544 (англ.) . Архіворигіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 11

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=WT1&oldid=43458884

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭