TRAF6 Ідентифікатори Символи TRAF6 , MGC:3310, RNF85, TNF receptor associated factor 6Зовнішні ІД OMIM :602355 MGI: 108072 HomoloGene: 3395 GeneCards: TRAF6 Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • histone deacetylase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв’язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • protein kinase binding • protein kinase B binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding
Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • lipid droplet • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • cell cortex • endosome membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to interleukin-1 • toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • odontogenesis of dentin-containing tooth • animal organ morphogenesis • T-helper 1 type immune response • toll-like receptor 9 signaling pathway • regulation of apoptotic process • осифікація • cytokine-mediated signaling pathway • osteoclast differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • кісткова резорбція • JNK cascade • membrane protein intracellular domain proteolysis • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of T cell proliferation • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein autoubiquitination • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-2 production • positive regulation of T cell cytokine production • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • розвиток клітин • protein K63-linked ubiquitination • myeloid dendritic cell differentiation • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • neural tube closure • bone remodeling • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cellular response to lipopolysaccharide • T cell receptor signaling pathway • activation of protein kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 11: 36.48 – 36.51 Mb Хр. 2: 101.51 – 101.53 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
TRAF6 (англ. TNF receptor associated factor 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522амінокислот , амолекулярна маса — 59 573[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSLLNCENSC GSSQSESDCC VAMASSCSAV TKDDSVGGTA STGNLSSSFM EEIQGYDVEF DPPLESKYEC PICLMALREA VQTPCGHRFC KACIIKSIRD AGHKCPVDNE ILLENQLFPD NFAKREILSL MVKCPNEGCL HKMELRHLED HQAHCEFALM DCPQCQRPFQ KFHINIHILK DCPRRQVSCD NCAASMAFED KEIHDQNCPL ANVICEYCNT ILIREQMPNH YDLDCPTAPI PCTFSTFGCH EKMQRNHLAR HLQENTQSHM RMLAQAVHSL SVIPDSGYIS EVRNFQETIH QLEGRLVRQD HQIRELTAKM ETQSMYVSEL KRTIRTLEDK VAEIEAQQCN GIYIWKIGNF GMHLKCQEEE KPVVIHSPGF YTGKPGYKLC MRLHLQLPTA QRCANYISLF VHTMQGEYDS HLPWPFQGTI RLTILDQSEA PVRQNHEEIM DAKPELLAFQ RPTIPRNPKG FGYVTFMHLE ALRQRTFIKD DTLLVRCEVS TRFDMGSLRR EGFQPRSTDA GV
Кодований геном білок за функцією належить дотрансфераз . Задіяний у таких біологічних процесах, якімунітет , пошкодження ДНК, убіквітинування білків, остеогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі , ліпідних краплях.
Cao Z., Xiong J., Takeuchi M., Kurama T., Goeddel D.V. (1996).TRAF6 is a signal transducer for interleukin-1 .Nature .383 : 443—446. PMID 8837778 doi :10.1038/383443a0 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Malinin N.L., Boldin M.P., Kovalenko A.V., Wallach D. (1997).MAP3K-related kinase involved in NF-kappaB induction by TNF, CD95 and IL-1 .Nature .385 : 540—544. PMID 9020361 doi :10.1038/385540a0 Muzio M., Ni J., Feng P., Dixit V.M. (1997).IRAK (Pelle) family member IRAK-2 and MyD88 as proximal mediators of IL-1 signaling .Science .278 : 1612—1615. PMID 9374458 doi :10.1126/science.278.5343.1612 McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998).RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase .J. Biol. Chem .273 : 16968—16975. PMID 9642260 doi :10.1074/jbc.273.27.16968 Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999).Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6 .J. Biol. Chem .274 : 2597—2600. PMID 9915784 doi :10.1074/jbc.274.5.2597