Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

TP63

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

TP63

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
4A9Z,1RG6,2RMN,2Y9T,2Y9U,3QYM,3QYN,3US0,3US1,3US2,3ZY0,3ZY1

Ідентифікатори

Символи

TP63, AIS, B(p51A), B(p51B), EEC3, KET, LMS, NBP, OFC8, RHS, SHFM4, TP53CP, TP53L, TP73L, p40, p51, p53CP, p63, p73H, p73L, tumor protein p63

Зовнішні ІД

OMIM:603273 MGI:1330810 HomoloGene:31189 GeneCards:TP63

Пов'язані генетичні захворювання

Аденокарцинома легень,lymphoblastic leukemia,рак легень,ADULT syndrome,Limb–mammary syndrome,ankyloblepharon-ectodermal defects-cleft lip/palate syndrome,split hand-foot malformation 2^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •зв’язування з іоном металу •damaged DNA binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •WW domain binding •зв’язування дволанцюгових ДНК •DNA binding •sequence-specific DNA binding •identical protein binding •chromatin binding •p53 binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •MDM2/MDM4 family protein binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •protein domain specific binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •neuron projection •клітинне ядро •rough endoplasmic reticulum •transcription regulator complex •нуклеоплазма •дендрит (нейробіологія) •мітохондрія •комплекс Ґольджі •гіалоплазма •GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	•pattern specification process •skeletal system development •epithelial cell development •negative regulation of keratinocyte differentiation •epidermal cell division •anatomical structure formation involved in morphogenesis •prostate gland development •transcription by RNA polymerase II •squamous basal epithelial stem cell differentiation involved in prostate gland acinus development •ectoderm and mesoderm interaction •cellular response to DNA damage stimulus •female genitalia morphogenesis •odontogenesis of dentin-containing tooth •prostatic bud formation •positive regulation of cell cycle G1/S phase transition •positive regulation of mesenchymal cell proliferation •Сперматогенез •multicellular organism aging •smooth muscle tissue development •positive regulation of fibroblast apoptotic process •animal organ morphogenesis •hair follicle morphogenesis •positive regulation of Notch signaling pathway •GO:0097285 апоптоз •ремоделювання хроматину •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •regulation of neuron apoptotic process •positive regulation of apoptotic signaling pathway •regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process •transcription, DNA-templated •embryonic limb morphogenesis •negative regulation of mesoderm development •epidermis development •post-anal tail morphogenesis •response to gamma radiation •protein homotetramerization •Сигнальний шлях Notch •hair follicle development •neuron apoptotic process •polarized epithelial cell differentiation •proximal/distal pattern formation •диференціація клітин •positive regulation of keratinocyte proliferation •skin morphogenesis •epithelial cell differentiation •urinary bladder development •cellular response to UV •establishment of planar polarity •negative regulation of apoptotic process •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •protein tetramerization •keratinocyte proliferation •positive regulation of osteoblast differentiation •regulation of epidermal cell division •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •negative regulation of cellular senescence •intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator •sympathetic nervous system development •establishment of skin barrier •morphogenesis of a polarized epithelium •keratinocyte differentiation •multicellular organism development •mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling •cloacal septation •response to X-ray •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator •positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway •regulation of signal transduction by p53 class mediator •regulation of apoptotic process •GO:0010260 старіння людини •negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •positive regulation of somatic stem cell population maintenance •проліферація •epidermal cell differentiation •embryonic forelimb morphogenesis •embryonic hindlimb morphogenesis •skin epidermis development •cranial skeletal system development •GO:0007571 розвойовий процес
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8626


22061

Ensembl


ENSG00000073282


ENSMUSG00000022510

UniProt


Q9H3D4


O88898

RefSeq (мРНК)

NM_001114978 NM_001114979 NM_001114980 NM_001114981 NM_001114982
NM_003722 NM_001329144 NM_001329145 NM_001329146 NM_001329148 NM_001329149 NM_001329150 NM_001329964

NM_001127259 NM_001127260 NM_001127261 NM_001127262 NM_001127263
NM_001127264 NM_001127265 NM_011641

RefSeq (білок)

NP_001108450 NP_001108451 NP_001108452 NP_001108453 NP_001108454
NP_001316073 NP_001316074 NP_001316075 NP_001316077 NP_001316078 NP_001316079 NP_001316893 NP_003713

NP_001120731 NP_001120732 NP_001120733 NP_001120734 NP_001120735
NP_001120736 NP_001120737 NP_035771

Локус (UCSC)

Хр. 3: 189.63 – 189.9 Mb

Хр. 16: 25.5 – 25.71 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TP63 (англ.Tumor protein p63) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 680амінокислот, амолекулярна маса — 76 785^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNFETSRCAT	LQYCPDPYIQ	RFVETPAHFS	WKESYYRSTM	SQSTQTNEFL
SPEVFQHIWD	FLEQPICSVQ	PIDLNFVDEP	SEDGATNKIE	ISMDCIRMQD
SDLSDPMWPQ	YTNLGLLNSM	DQQIQNGSSS	TSPYNTDHAQ	NSVTAPSPYA
QPSSTFDALS	PSPAIPSNTD	YPGPHSFDVS	FQQSSTAKSA	TWTYSTELKK
LYCQIAKTCP	IQIKVMTPPP	QGAVIRAMPV	YKKAEHVTEV	VKRCPNHELS
REFNEGQIAP	PSHLIRVEGN	SHAQYVEDPI	TGRQSVLVPY	EPPQVGTEFT
TVLYNFMCNS	SCVGGMNRRP	ILIIVTLETR	DGQVLGRRCF	EARICACPGR
DRKADEDSIR	KQQVSDSTKN	GDGTKRPFRQ	NTHGIQMTSI	KKRRSPDDEL
LYLPVRGRET	YEMLLKIKES	LELMQYLPQH	TIETYRQQQQ	QQHQHLLQKQ
TSIQSPSSYG	NSSPPLNKMN	SMNKLPSVSQ	LINPQQRNAL	TPTTIPDGMG
ANIPMMGTHM	PMAGDMNGLS	PTQALPPPLS	MPSTSHCTPP	PPYPTDCSIV
SFLARLGCSS	CLDYFTTQGL	TTIYQIEHYS	MDDLASLKIP	EQFRHAIWKG
ILDHRQLHEF	SSPSHLLRTP	SSASTVSVGS	SETRGERVID	AVRFTLRQTI
SFPPRDEWND	FNFDMDARRN	KQQRIKEEGE

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах якапоптоз,транскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Augustin M., Bamberger C., Paul D., Schmale H. (1998). Cloning and chromosomal mapping of the human p53-related KET gene to chromosome 3q27 and its murine homolog Ket to mouse chromosome 16.Mamm. Genome.9: 899—902.PMID 9799841doi:10.1007/s003359900891
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Kim E.-J., Park J.-S., Um S.-J. (2002).Identification and characterization of HIPK2 interacting with p73 and modulating functions of the p53 family in vivo.J. Biol. Chem.277: 32020—32028.PMID 11925430doi:10.1074/jbc.M200153200
Zeng S.X., Dai M.-S., Keller D.M., Lu H. (2002).SSRP1 functions as a co-activator of the transcriptional activator p63.EMBO J.21: 5487—5497.PMID 12374749doi:10.1093/emboj/cdf540
Li Y., Zhou Z., Chen C. (2008). WW domain-containing E3 ubiquitin protein ligase 1 targets p63 transcription factor for ubiquitin-mediated proteasomal degradation and regulates apoptosis.Cell Death Differ.15: 1941—1951.PMID 18806757doi:10.1038/cdd.2008.134
Zheng M.Z., Zheng L.M., Zeng Y.X. (2008). SCC-112 gene is involved in tumor progression and promotes the cell proliferation in G2/M phase.J. Cancer Res. Clin. Oncol.134: 453—462.PMID 17846787doi:10.1007/s00432-007-0306-x

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з TP63 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15979 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q9H3D4 (англ.) . Архіворигіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 3

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=TP63&oldid=46339237

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭