Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

THRA

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

THRA

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1NAV,2H77,2H79,3HZF,3ILZ,3JZB,4LNW,4LNX

Ідентифікатори

Символи

THRA, AR7, CHNG6, EAR7, ERB-T-1, ERBA, ERBA1, NR1A1, THRA1, THRA2, c-ERBA-1, thyroid hormone receptor, alpha, thyroid hormone receptor alpha, TRalpha

Зовнішні ІД

OMIM:190120 MGI:98742 HomoloGene:37747 GeneCards:THRA

Пов'язані генетичні захворювання

congenital nongoitrous hypothryoidism 6^[1]

Реагує на сполуку

DL-3,3',5'-triiodothyronine,tiratricol,трийодтиронін,левотироксин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •single-stranded RNA binding •zinc ion binding •chromatin DNA binding •GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity •steroid receptor RNA activator RNA binding •transcription factor binding •TBP-class protein binding •steroid hormone receptor activity •DNA binding •protein domain specific binding •sequence-specific DNA binding •зв’язування з іоном металу •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •thyroid hormone binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0032403 protein-containing complex binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •nuclear receptor coactivator activity •signaling receptor activity
Клітинна компонента	•цитоплазма •нуклеоплазма •клітинне ядро •гіалоплазма •RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	•GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •response to cold •cytoplasmic sequestering of transcription factor •hormone-mediated signaling pathway •regulation of thyroid hormone mediated signaling pathway •thyroid gland development •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •осифікація •female courtship behavior •cartilage condensation •negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly •type I pneumocyte differentiation •transcription, DNA-templated •steroid hormone mediated signaling pathway •transcription by RNA polymerase II •regulation of lipid catabolic process •regulation of heart contraction •animal organ morphogenesis •positive regulation of female receptivity •learning or memory •regulation of myeloid cell apoptotic process •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription initiation from RNA polymerase II promoter •erythrocyte differentiation •negative regulation of DNA-templated transcription, initiation •positive regulation of myotube differentiation •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •intracellular receptor signaling pathway •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •thyroid hormone mediated signaling pathway •multicellular organism development •brain development •диференціація клітин •response to lipid •positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7067


21833

Ensembl


ENSG00000126351


ENSMUSG00000058756

UniProt


P10827


P63058

RefSeq (мРНК)


NM_199334 NM_001190918 NM_001190919 NM_003250


NM_178060 NM_001313983

RefSeq (білок)


NP_001177847 NP_001177848 NP_003241 NP_955366


NP_001300912 NP_835161

Локус (UCSC)

Хр. 17: 40.06 – 40.09 Mb

Хр. 11: 98.63 – 98.66 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

THRA (англ.Thyroid hormone receptor, alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490амінокислот, амолекулярна маса — 54 816^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQKPSKVEC	GSDPEENSAR	SPDGKRKRKN	GQCSLKTSMS	GYIPSYLDKD
EQCVVCGDKA	TGYHYRCITC	EGCKGFFRRT	IQKNLHPTYS	CKYDSCCVID
KITRNQCQLC	RFKKCIAVGM	AMDLVLDDSK	RVAKRKLIEQ	NRERRRKEEM
IRSLQQRPEP	TPEEWDLIHI	ATEAHRSTNA	QGSHWKQRRK	FLPDDIGQSP
IVSMPDGDKV	DLEAFSEFTK	IITPAITRVV	DFAKKLPMFS	ELPCEDQIIL
LKGCCMEIMS	LRAAVRYDPE	SDTLTLSGEM	AVKREQLKNG	GLGVVSDAIF
ELGKSLSAFN	LDDTEVALLQ	AVLLMSTDRS	GLLCVDKIEK	SQEAYLLAFE
HYVNHRKHNI	PHFWPKLLMK	EREVQSSILY	KGAAAEGRPG	GSLGVHPEGQ
QLLGMHVVQG	PQVRQLEQQL	GEAGSLQGPV	LQHQSPKSPQ	QRLLELLHRS
GILHARAVCG	EDDSSEADSP	SSSEEEPEVC	EDLAGNAASP

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дорецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Pfahl M., Benbrook D. (1987).Nucleotide sequence of cDNA encoding a novel human thyroid hormone receptor.Nucleic Acids Res.15: 9613—9613.PMID 3684612doi:10.1093/nar/15.22.9613
Nakai A., Sakurai A., Bell G.I., Degroot L.J. (1988). Characterization of a third human thyroid hormone receptor coexpressed with other thyroid hormone receptors in several tissues.Mol. Endocrinol.2: 1087—1092.PMID 2464749doi:10.1210/mend-2-11-1087
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Benbrook D., Pfahl M. (1987).A novel thyroid hormone receptor encoded by a cDNA clone from a human testis library.Science.238: 788—791.PMID 3672126doi:10.1126/science.3672126
Yang Y.Z., Burgos-Trinidad M., Wu Y., Koenig R.J. (1996).Thyroid hormone receptor variant alpha2. Role of the ninth heptad in dna binding, heterodimerization with retinoid X receptors, and dominant negative activity.J. Biol. Chem.271: 28235—28242.PMID 8910441doi:10.1074/jbc.271.45.28235

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з THRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Сполуки, які фізично взаємодіють з thyroid hormone receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11796 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P10827 (англ.) . Архіворигіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 17

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=THRA&oldid=46339164

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭