TAF7 Ідентифікатори Символи TAF7 Зовнішні ІД OMIM :600573 MGI: 1346348 HomoloGene: 133942 GeneCards: TAF7 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • thyroid hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • vitamin D receptor binding • protein heterodimerization activity • H3K27me3 modified histone binding • TFIIH-class transcription factor complex binding • P-TEFb complex binding
Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • transcription factor TFTC complex • MLL1 complex • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of protein kinase activity • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • spermine transport • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of histone acetylation • intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 5: 141.26 – 141.32 Mb Хр. 18: 37.77 – 37.78 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
TAF7 (англ. TATA-box binding protein associated factor 7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 40 259[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSKSKDDAPH ELESQFILRL PPEYASTVRR AVQSGHVNLK DRLTIELHPD GRHGIVRVDR VPLASKLVDL PCVMESLKTI DKKTFYKTAD ICQMLVSTVD GDLYPPVEEP VASTDPKASK KKDKDKEKKF IWNHGITLPL KNVRKRRFRK TAKKKYIESP DVEKEVKRLL STDAEAVSTR WEIIAEDETK EAENQGLDIS SPGMSGHRQG HDSLEHDELR EIFNDLSSSS EDEDETQHQD EEDINIIDTE EDLERQLQDK LNESDEQHQE NEGTNQLVMG IQKQIDNMKG KLQETQDRAK RQEDLIMKVE NLALKNRFQA VLDELKQKED REKEQLSSLQ EELESLLEK
Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , поліморфізм. Локалізований уядрі .
Chiang C.-M., Roeder R.G. (1995).Cloning of an intrinsic human TFIID subunit that interacts with multiple transcriptional activators .Science .267 : 531—536. PMID 7824954 doi :10.1126/science.7824954 Zhou T., Chiang C.-M. (2001).The intronless and TATA-less human TAFII55 gene contains a functional initiator and a downstream promoter element .J. Biol. Chem .276 : 25503—25511. PMID 11340078 doi :10.1074/jbc.M102875200 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Wu S.Y., Thomas M.C., Hou S.Y., Likhite V., Chiang C.M. (1999).Isolation of mouse TFIID and functional characterization of TBP and TFIID in mediating estrogen receptor and chromatin transcription .J. Biol. Chem .274 : 23480—23490. PMID 10438527 doi :10.1074/jbc.274.33.23480 Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9.Nat. Struct. Mol. Biol .13 : 140—146. PMID 16415881 doi :10.1038/nsmb1045 Kloet S.L., Whiting J.L., Gafken P., Ranish J., Wang E.H. (2012). Phosphorylation-dependent regulation of cyclin D1 and cyclin A gene transcription by TFIID subunits TAF1 and TAF7.Mol. Cell. Biol .32 : 3358—3369. PMID 22711989 doi :10.1128/MCB.00416-12
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
