TAF4B Ідентифікатори Символи TAF4B Зовнішні ІД OMIM :601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • NF-kappaB binding • protein heterodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • transcription factor TFIID complex
Біологічний процес • DNA-templated transcription, initiation • диференціація клітин • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • transcription, DNA-templated • Оогенез • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 18: 26.23 – 26.39 Mb Хр. 18: 14.92 – 15.03 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 91 091[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MPAGLTEPAG AAPPAAVSAS GTVTMAPAGA LPVRVESTPV ALGAVTKAPV SVCVEPTASQ PLRSPVGTLV TKVAPVSAPP KVSSGPRLPA PQIVAVKAPN TTTIQFPANL QLPPGTVLIK SNSGPLMLVS PQQTVTRAET TSNITSRPAV PANPQTVKIC TVPNSSSQLI KKVAVTPVKK LAQIGTTVVT TVPKPSSVQS VAVPTSVVTV TPGKPLNTVT TLKPSSLGAS STPSNEPNLK AENSAAVQIN LSPTMLENVK KCKNFLAMLI KLACSGSQSP EMGQNVKKLV EQLLDAKIEA EEFTRKLYVE LKSSPQPHLV PFLKKSVVAL RQLLPNSQSF IQQCVQQTSS DMVIATCTTT VTTSPVVTTT VSSSQSEKSI IVSGATAPRT VSVQTLNPLA GPVGAKAGVV TLHSVGPTAA TGGTTAGTGL LQTSKPLVTS VANTVTTVSL QPEKPVVSGT AVTLSLPAVT FGETSGAAIC LPSVKPVVSS AGTTSDKPVI GTPVQIKLAQ PGPVLSQPAG IPQAVQVKQL VVQQPSGGNE KQVTTISHSS TLTIQKCGQK TMPVNTIIPT SQFPPASILK QITLPGNKIL SLQASPTQKN RIKENVTSCF RDEDDINDVT SMAGVNLNEE NACILATNSE LVGTLIQSCK DEPFLFIGAL QKRILDIGKK HDITELNSDA VNLISQATQE RLRGLLEKLT AIAQHRMTTY KASENYILCS DTRSQLKFLE KLDQLEKQRK DLEEREMLLK AAKSRSNKED PEQLRLKQKA KELQQLELAQ IQHRDANLTA LAAIGPRKKR PLESGIEGLK DNLLASGTSS LTATKQLHRP RITRICLRDL IFCMEQEREM KYSRALYLAL LK
Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин ,сперматогенез ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line.J. Cell. Biochem .96 : 751—759. PMID 16088961 doi :10.1002/jcb.20577 Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130.Cell .87 : 137—146. PMID 8858156 doi :10.1016/S0092-8674(00)81330-6 Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000).Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription .J. Biol. Chem .275 : 16459—16465. PMID 10828057 doi :10.1074/jbc.275.22.16459 Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000).Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes .J. Biol. Chem .275 : 18180—18187. PMID 10849440 doi :10.1074/jbc.275.24.18180 Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001).A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105 .J. Biol. Chem .276 : 44963—44969. PMID 11567023 doi :10.1074/jbc.M106112200
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
