Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

TAF4

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

TAF4

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H3O,2P6V

Ідентифікатори

Символи

TAF4, TAF2C, TAF2C1, TAF4A, TAFII130, TAFII135, TATA-box binding protein associated factor 4, TAFII-135, TAFII-130, TAF(II)135, TAF(II)130

Зовнішні ІД

OMIM:601796 MGI:2152346 HomoloGene:55723 GeneCards:TAF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001105 transcription coactivator activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein heterodimerization activity •aryl hydrocarbon receptor binding •transcription factor binding •GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента	•transcription factor TFTC complex •transcription factor TFIID complex •нуклеоплазма •MLL1 complex •клітинне ядро •гіалоплазма •GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •DNA-templated transcription, initiation •ovarian follicle development •transcription initiation from RNA polymerase II promoter •regulation of signal transduction by p53 class mediator •GO:0022415 viral process •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •RNA polymerase II preinitiation complex assembly
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6874


228980

Ensembl


ENSG00000130699


ENSMUSG00000039117

UniProt


O00268


E9QAP7

RefSeq (мРНК)


NM_003185


NM_001081092

RefSeq (білок)


NP_003176


NP_001074561

Локус (UCSC)

Хр. 20: 61.95 – 62.07 Mb

Хр. 2: 179.55 – 179.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TAF4 (англ.TATA-box binding protein associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 085амінокислот, амолекулярна маса — 110 114^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGSDLLDE	VFFNSEVDEK	VVSDLVGSLE	SQLAASAAHH	HHLAPRTPEV
RAAAAGALGN	HVVSGSPAGA	AGAGPAAPAE	GAPGAAPEPP	PAGRARPGGG
GPQRPGPPSP	RRPLVPAGPA	PPAAKLRPPP	EGSAGSCAPV	PAAAAVAAGP
EPAPAGPAKP	AGPAALAARA	GPGPGPGPGP	GPGPGPGKPA	GPGAAQTLNG
SAALLNSHHA	AAPAVSLVNN	GPAALLPLPK	PAAPGTVIQT	PPFVGAAAPP
APAAPSPPAA	PAPAAPAAAP	PPPPPAPATL	ARPPGHPAGP	PTAAPAVPPP
AAAQNGGSAG	AAPAPAPAAG	GPAGVSGQPG	PGAAAAAPAP	GVKAESPKRV
VQAAPPAAQT	LAASGPASTA	ASMVIGPTMQ	GALPSPAAVP	PPAPGTPTGL
PKGAAGAVTQ	SLSRTPTATT	SGIRATLTPT	VLAPRLPQPP	QNPTNIQNFQ
LPPGMVLVRS	ENGQLLMIPQ	QALAQMQAQA	HAQPQTTMAP	RPATPTSAPP
VQISTVQAPG	TPIIARQVTP	TTIIKQVSQA	QTTVQPSATL	QRSPGVQPQL
VLGGAAQTAS	LGTATAVQTG	TPQRTVPGAT	TTSSAATETM	ENVKKCKNFL
STLIKLASSG	KQSTETAANV	KELVQNLLDG	KIEAEDFTSR	LYRELNSSPQ
PYLVPFLKRS	LPALRQLTPD	SAAFIQQSQQ	QPPPPTSQAT	TALTAVVLSS
SVQRTAGKTA	ATVTSALQPP	VLSLTQPTQV	GVGKQGQPTP	LVIQQPPKPG
ALIRPPQVTL	TQTPMVALRQ	PHNRIMLTTP	QQIQLNPLQP	VPVVKPAVLP
GTKALSAVSA	QAAAAQKNKL	KEPGGGSFRD	DDDINDVASM	AGVNLSEESA
RILATNSELV	GTLTRSCKDE	TFLLQAPLQR	RILEIGKKHG	ITELHPDVVS
YVSHATQQRL	QNLVEKISET	AQQKNFSYKD	DDRYEQASDV	RAQLKFFEQL
DQIEKQRKDE	QEREILMRAA	KSRSRQEDPE	QLRLKQKAKE	MQQQELAQMR
QRDANLTALA	AIGPRKKRKV	DCPGPGSGAE	GSGPGSVVPG	SSGVGTPRQF
TRQRITRVNL	RDLIFCLENE	RETSHSLLLY	KAFLK

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус,транскрипція, регуляціятранскрипції. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Mengus G., May M., Carre L., Chambon P., Davidson I. (1997).Human TAF(II)135 potentiates transcriptional activation by the AF-2s of the retinoic acid, vitamin D3, and thyroid hormone receptors in mammalian cells.Genes Dev.11: 1381—1395.PMID 9192867doi:10.1101/gad.11.11.1381
Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., Chen J.-L., Admon A. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFII130 and hTAFII100.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.93: 13611—13616.PMID 8942982doi:10.1073/pnas.93.24.13611
Damania B., Alwine J.C. (1996).TAF-like function of SV40 large T antigen.Genes Dev.10: 1369—1381.PMID 8647434doi:10.1101/gad.10.11.1369
Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999).Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction.J. Biol. Chem.274: 18285—18289.PMID 10373431doi:10.1074/jbc.274.26.18285
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis.Proteomics.3: 217—223.PMID 12601814doi:10.1002/pmic.200390030

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11537 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, O00268 (англ.) . Архіворигіналу за 23 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 20

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=TAF4&oldid=46339060

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭