Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

TAF2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

TAF2

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
5FUR

Ідентифікатори

Символи

TAF2, CIF150, MRT40, TAF2B, TAFII150, TATA-box binding protein associated factor 2

Зовнішні ІД

OMIM:604912 MGI:2443028 HomoloGene:31137 GeneCards:TAF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	•sequence-specific DNA binding •chromatin binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •TFIID-class transcription factor complex binding •GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента	•transcription factor TFTC complex •transcription factor TFIID complex •нуклеоплазма •клітинне ядро
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:1904578 response to organic cyclic compound •transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •G2/M transition of mitotic cell cycle •transcription initiation from RNA polymerase II promoter •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •RNA polymerase II preinitiation complex assembly •regulation of signal transduction by p53 class mediator
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6873


319944

Ensembl


ENSG00000064313


ENSMUSG00000037343

UniProt


Q6P1X5


Q8C176

RefSeq (мРНК)


NM_003184


NM_001081288 NM_177040

RefSeq (білок)


NP_003175


NP_001074757

Локус (UCSC)

Хр. 8: 119.73 – 119.83 Mb

Хр. 15: 54.88 – 54.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TAF2 (англ.TATA-box binding protein associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 199амінокислот, амолекулярна маса — 136 971^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLTGVEPAR	MNRKKGDKGF	ESPRPYKLTH	QVVCINNINF	QRKSVVGFVE
LTIFPTVANL	NRIKLNSKQC	RIYRVRINDL	EAAFIYNDPT	LEVCHSESKQ
RNLNYFSNAY	AAAVSAVDPD	AGNGELCIKV	PSELWKHVDE	LKVLKIHINF
SLDQPKGGLH	FVVPSVEGSM	AERGAHVFSC	GYQNSTRFWF	PCVDSYSELC
TWKLEFTVDA	AMVAVSNGDL	VETVYTHDMR	KKTFHYMLTI	PTAASNISLA
IGPFEILVDP	YMHEVTHFCL	PQLLPLLKHT	TSYLHEVFEF	YEEILTCRYP
YSCFKTVFID	EAYVEVAAYA	SMSIFSTNLL	HSAMIIDETP	LTRRCLAQSL
AQQFFGCFIS	RMSWSDEWVL	KGISGYIYGL	WMKKTFGVNE	YRHWIKEELD
KIVAYELKTG	GVLLHPIFGG	GKEKDNPASH	LHFSIKHPHT	LSWEYYSMFQ
CKAHLVMRLI	ENRISMEFML	QVFNKLLSLA	STASSQKFQS	HMWSQMLVST
SGFLKSISNV	SGKDIQPLIK	QWVDQSGVVK	FYGSFAFNRK	RNVLELEIKQ
DYTSPGTQKY	VGPLKVTVQE	LDGSFNHTLQ	IEENSLKHDI	PCHSKSRRNK
KKKIPLMNGE	EVDMDLSAMD	ADSPLLWIRI	DPDMSVLRKV	EFEQADFMWQ
YQLRYERDVV	AQQESILALE	KFPTPASRLA	LTDILEQEQC	FYRVRMSACF
CLAKIANSMV	STWTGPPAMK	SLFTRMFCCK	SCPNIVKTNN	FMSFQSYFLQ
KTMPVAMALL	RDVHNLCPKE	VLTFILDLIK	YNDNRKNKFS	DNYYRAEMID
ALANSVTPAV	SVNNEVRTLD	NLNPDVRLIL	EEITRFLNME	KLLPSYRHTI
TVSCLRAIRV	LQKNGHVPSD	PALFKSYAEY	GHFVDIRIAA	LEAVVDYTKV
DRSYEELQWL	LNMIQNDPVP	YVRHKILNML	TKNPPFTKNM	ESPLCNEALV
DQLWKLMNSG	TSHDWRLRCG	AVDLYFTLFG	LSRPSCLPLP	ELGLVLNLKE
KKAVLNPTII	PESVAGNQEA	ANNPSSHPQL	VGFQNPFSSS	QDEEEIDMDT
VHDSQAFISH	HLNMLERPST	PGLSKYRPAS	SRSALIPQHS	AGCDSTPTTK
PQWSLELARK	GTGKEQAPLE	MSMHPAASAP	LSVFTKESTA	SKHSDHHHHH
HHEHKKKKKK	HKHKHKHKHK	HDSKEKDKEP	FTFSSPASGR	SIRSPSLSD

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Kaufmann J., Ahrens K., Koop R., Smale S.T., Muller R. (1998).CIF150, a human cofactor for transcription factor IID-dependent initiator function.Mol. Cell. Biol.18: 233—239.PMID 9418870doi:10.1128/MCB.18.1.233
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis.Proteomics.3: 217—223.PMID 12601814doi:10.1002/pmic.200390030

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11536 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q6P1X5 (англ.) . Архіворигіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 8

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=TAF2&oldid=46339058

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭