SREBF2 Ідентифікатори Символи SREBF2 Зовнішні ІД OMIM :600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2 Онтологія гена Молекулярна функція • C-8 sterol isomerase activity • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • SREBP-SCAP-Insig complex • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 цитоплазматичний міхур • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес • steroid metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • Обмін жирів • positive regulation of cholesterol storage • cellular response to laminar fluid shear stress • cellular response to starvation • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of autophagy of mitochondrion • negative regulation of cholesterol efflux • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 22: 41.83 – 41.91 Mb Хр. 15: 82.03 – 82.09 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 123 688[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MDDSGELGGL ETMETLTELG DELTLGDIDE MLQFVSNQVG EFPDLFSEQL CSSFPGSGGS GSSSGSSGSS SSSSNGRGSS SGAVDPSVQR SFTQVTLPSF SPSAASPQAP TLQVKVSPTS VPTTPRATPI LQPRPQPQPQ PQTQLQQQTV MITPTFSTTP QTRIIQQPLI YQNAATSFQV LQPQVQSLVT SSQVQPVTIQ QQVQTVQAQR VLTQTANGTL QTLAPATVQT VAAPQVQQVP VLVQPQIIKT DSLVLTTLKT DGSPVMAAVQ NPALTALTTP IQTAALQVPT LVGSSGTILT TMPVMMGQEK VPIKQVPGGV KQLEPPKEGE RRTTHNIIEK RYRSSINDKI IELKDLVMGT DAKMHKSGVL RKAIDYIKYL QQVNHKLRQE NMVLKLANQK NKLLKGIDLG SLVDNEVDLK IEDFNQNVLL MSPPASDSGS QAGFSPYSID SEPGSPLLDD AKVKDEPDSP PVALGMVDRS RILLCVLTFL CLSFNPLTSL LQWGGAHDSD QHPHSGSGRS VLSFESGSGG WFDWMMPTLL LWLVNGVIVL SVFVKLLVHG EPVIRPHSRS SVTFWRHRKQ ADLDLARGDF AAAAGNLQTC LAVLGRALPT SRLDLACSLS WNVIRYSLQK LRLVRWLLKK VFQCRRATPA TEAGFEDEAK TSARDAALAY HRLHQLHITG KLPAGSACSD VHMALCAVNL AECAEEKIPP STLVEIHLTA AMGLKTRCGG KLGFLASYFL SRAQSLCGPE HSAVPDSLRW LCHPLGQKFF MERSWSVKSA AKESLYCAQR NPADPIAQVH QAFCKNLLER AIESLVKPQA KKKAGDQEEE SCEFSSALEY LKLLHSFVDS VGVMSPPLSR SSVLKSALGP DIICRWWTSA ITVAISWLQG DDAAVRSHFT KVERIPKALE VTESPLVKAI FHACRAMHAS LPGKADGQQS SFCHCERASG HLWSSLNVSG ATSDPALNHV VQLLTCDLLL SLRTALWQKQ ASASQAVGET YHASGAELAG FQRDLGSLRR LAHSFRPAYR KVFLHEATVR LMAGASPTRT HQLLEHSLRR RTTQSTKHGE VDAWPGQRER ATAILLACRH LPLSFLSSPG QRAVLLAEAA RTLEKVGDRR SCNDCQQMIV KLGGGTAIAA S
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , метаболізмліпідів , метаболізмхолестеролу , метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі , мембрані,ендоплазматичному ретикулумі ,цитоплазматичних везикулах ,апараті гольджі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996).Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane .J. Biol. Chem .271 : 10379—10384. PMID 8626610 doi :10.1074/jbc.271.17.10379 Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .93 : 5437—5442. PMID 8643593 doi :10.1073/pnas.93.11.5437 Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998).Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning .J. Biol. Chem .273 : 17801—17809. PMID 9651382 doi :10.1074/jbc.273.28.17801 Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .97 : 5123—5128. PMID 10805775 doi :10.1073/pnas.97.10.5123 Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009).The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage .J. Biol. Chem .284 : 28995—29004. PMID 19706601 doi :10.1074/jbc.M109.041376
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
