Movatterモバイル変換

[0]ホーム
URL:

Перейти до вмісту
Вікіпедія
Пошук

SOX8

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SOX8
Ідентифікатори
СимволиSOX8, SRY-box 8, SRY-box transcription factor 8
Зовнішні ІДOMIM:605923MGI:98370HomoloGene:7950GeneCards:SOX8
Онтологія гена
Молекулярна функція

•DNA binding
•sequence-specific DNA binding
•GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
•transcription factor binding
•protein heterodimerization activity
•RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
•GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
•GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

•цитоплазма
•клітинне ядро

Біологічний процес

•positive regulation of osteoblast proliferation
•cell fate commitment
•negative regulation of myoblast differentiation
•positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
•male gonad development
•peripheral nervous system development
•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
•morphogenesis of a branching epithelium
•ureter morphogenesis
•regulation of hormone levels
•oligodendrocyte differentiation
•negative regulation of apoptotic process
•in utero embryonic development
•cell maturation
•Sertoli cell development
•transcription, DNA-templated
•metanephric nephron tubule formation
•GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна
•negative regulation of photoreceptor cell differentiation
•enteric nervous system development
•renal vesicle induction
•positive regulation of kidney development
•GO:1901313 positive regulation of gene expression
•retina development in camera-type eye
•astrocyte fate commitment
•osteoblast differentiation
•neural crest cell migration
•Сперматогенез
•retinal rod cell differentiation
•skeletal muscle cell differentiation
•adipose tissue development
•GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
•fat cell differentiation
•GO:0072468 сигнальна трансдукція
•GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
•positive regulation of gliogenesis
•morphogenesis of an epithelium
•central nervous system development

Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи
ВидиЛюдинаМиша
Entrez
30812
20681
Ensembl
ENSG00000005513
ENSMUSG00000024176
UniProt
P57073
Q04886
RefSeq (мРНК)
NM_014587
NM_011447
RefSeq (білок)
NP_055402
NP_035577
Локус (UCSC)Хр. 16: 0.98 – 0.99 MbХр. 17: 25.78 – 25.79 Mb
PubMed search[1][2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SOX8 (англ.SRY-box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446амінокислот, амолекулярна маса — 47 314[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLDMSEARSQPPCSPSGTASSMSHVEDSDSDAPPSPAGSEGLGRAGVAVG
GARGDPAEAADERFPACIRDAVSQVLKGYDWSLVPMPVRGGGGGALKAKP
HVKRPMNAFMVWAQAARRKLADQYPHLHNAELSKTLGKLWRLLSESEKRP
FVEEAERLRVQHKKDHPDYKYQPRRRKSAKAGHSDSDSGAELGPHPGGGA
VYKAEAGLGDGHHHGDHTGQTHGPPTPPTTPKTELQQAGAKPELKLEGRR
PVDSGRQNIDFSNVDISELSSEVMGTMDAFDVHEFDQYLPLGGPAPPEPG
QAYGGAYFHAGASPVWAHKSAPSASASPTETGPPRPHIKTEQPSPGHYGD
QPRGSPDYGSCSGQSSATPAAPAGPFAGSQGDYGDLQASSYYGAYPGYAP
GLYQYPCFHSPRRPYASPLLNGLALPPAHSPTSHWDQPVYTTLTRP

Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
  • Pfeifer D., Poulat F., Holinski-Feder E., Kooy F., Scherer G. (2000). The SOX8 gene is located within 700 kb of the tip of chromosome 16p and is deleted in a patient with ATR-16 syndrome.Genomics.63: 108—116.PMID 10662550doi:10.1006/geno.1999.6060

Примітки

[ред. |ред. код]
  1. ↑Human PubMed Reference:.
  2. ↑Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11203 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑UniProt, P57073 (англ.) . Архіворигіналу за 13 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]
Молекула міоглобінуЦе незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1)Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші
Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=SOX8&oldid=46338945
Категорії:
Приховані категорії:
[8]ページ先頭
©2009-2026 Movatter.jp