SOX1 Ідентифікатори Символи SOX1 Зовнішні ІД OMIM :602148 MGI: 98357 HomoloGene: 133765 GeneCards: SOX1 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • forebrain neuron development • ventral spinal cord interneuron specification • forebrain development • neuron migration • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • lens morphogenesis in camera-type eye • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • forebrain neuron differentiation • cellular response to leukemia inhibitory factor • диференціація клітин • central nervous system development • neuron differentiation
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 13: 112.07 – 112.07 Mb Хр. 8: 12.45 – 12.45 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SOX1 (англ. SRY-box 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.[ 3] амінокислоту , амолекулярна маса — 39 023[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MYSMMMETDL HSPGGAQAPT NLSGPAGAGG GGGGGGGGGG GGGAKANQDR VKRPMNAFMV WSRGQRRKMA QENPKMHNSE ISKRLGAEWK VMSEAEKRPF IDEAKRLRAL HMKEHPDYKY RPRRKTKTLL KKDKYSLAGG LLAAGAGGGG AAVAMGVGVG VGAAAVGQRL ESPGGAAGGG YAHVNGWANG AYPGSVAAAA AAAAMMQEAQ LAYGQHPGAG GAHPHAHPAH PHPHHPHAHP HNPQPMHRYD MGALQYSPIS NSQGYMSASP SGYGGLPYGA AAAAAAAAGG AHQNSAVAAA AAAAAASSGA LGALGSLVKS EPSGSPPAPA HSRAPCPGDL REMISMYLPA GEGGDPAAAA AAAAQSRLHS LPQHYQGAGA GVNGTVPLTH I
Кодований геном білок за функцією належить доактиваторів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Malas S., Duthie S.M., Mohri F., Lovell-Badge R., Episkopou V. (1997). Cloning and mapping of the human SOX1: a highly conserved gene expressed in the developing brain.Mamm. Genome .8 : 866—868. PMID 9337405 doi :10.1007/s003359900597
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
