Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

SMAD2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

SMAD2

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1DEV,1KHX,1U7V,2LB3

Ідентифікатори

Символи

SMAD2, JV18, JV18-1, MADH2, MADR2, hMAD-2, hSMAD family member 2, LDS6, CHTD8

Зовнішні ІД

OMIM:601366 MGI:108051 HomoloGene:21197 GeneCards:SMAD2

Онтологія гена
Молекулярна функція	•phosphatase binding •I-SMAD binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •R-SMAD binding •co-SMAD binding •transcription factor binding •зв’язування з іоном металу •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •transforming growth factor beta receptor binding •type I transforming growth factor beta receptor binding •protein homodimerization activity •chromatin binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •зв’язування дволанцюгових ДНК •SMAD binding •DNA binding •protein heterodimerization activity •ubiquitin protein ligase binding •primary miRNA binding •disordered domain specific binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •tau protein binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •гіалоплазма •клітинне ядро •heteromeric SMAD protein complex •SMAD protein complex •transcription regulator complex •внутрішньоклітинний •нуклеоплазма •activin responsive factor complex •GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	•pattern specification process •ureteric bud development •endoderm development •response to cholesterol •organ growth •embryonic pattern specification •zygotic specification of dorsal/ventral axis •Післязародковий розвиток •protein phosphorylation •pericardium development •regulation of binding •transforming growth factor beta receptor signaling pathway •negative regulation of cell population proliferation •cell fate commitment •common-partner SMAD protein phosphorylation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •SMAD protein signal transduction •lung development •signal transduction involved in regulation of gene expression •insulin secretion •in utero embryonic development •negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway •negative regulation of gene expression •nodal signaling pathway •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •development of the heart •pancreas development •endoderm formation •activin receptor signaling pathway •SMAD protein complex assembly •positive regulation of nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry •embryonic foregut morphogenesis •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •response to glucose •positive regulation of epithelial to mesenchymal transition •developmental growth •гаструляція •GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing •positive regulation of BMP signaling pathway •embryonic cranial skeleton morphogenesis •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •paraxial mesoderm morphogenesis •GO:0007243 intracellular signal transduction •somatic stem cell population maintenance •mesoderm formation •regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway •GO:1901313 positive regulation of gene expression •anterior/posterior pattern specification •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •transcription by RNA polymerase II •protein deubiquitination •Загоєння ран •adrenal gland development •secondary palate development
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4087


17126

Ensembl


ENSG00000175387


ENSMUSG00000024563

UniProt


Q15796


Q62432

RefSeq (мРНК)


NM_001003652 NM_001135937 NM_005901


NM_001252481 NM_010754 NM_001311070

RefSeq (білок)


NP_001003652 NP_001129409 NP_005892


NP_001239410 NP_001297999 NP_034884

Локус (UCSC)

Хр. 18: 47.81 – 47.93 Mb

Хр. 18: 76.37 – 76.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMAD2 (англ.SMAD family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467амінокислот, амолекулярна маса — 52 306^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSILPFTPP	VVKRLLGWKK	SAGGSGGAGG	GEQNGQEEKW	CEKAVKSLVK
KLKKTGRLDE	LEKAITTQNC	NTKCVTIPST	CSEIWGLSTP	NTIDQWDTTG
LYSFSEQTRS	LDGRLQVSHR	KGLPHVIYCR	LWRWPDLHSH	HELKAIENCE
YAFNLKKDEV	CVNPYHYQRV	ETPVLPPVLV	PRHTEILTEL	PPLDDYTHSI
PENTNFPAGI	EPQSNYIPET	PPPGYISEDG	ETSDQQLNQS	MDTGSPAELS
PTTLSPVNHS	LDLQPVTYSE	PAFWCSIAYY	ELNQRVGETF	HASQPSLTVD
GFTDPSNSER	FCLGLLSNVN	RNATVEMTRR	HIGRGVRLYY	IGGEVFAECL
SDSAIFVQSP	NCNQRYGWHP	ATVCKIPPGC	NLKIFNNQEF	AALLAQSVNQ
GFEAVYQLTR	MCTIRMSFVK	GWGAEYRRQT	VTSTPCWIEL	HLNGPLQWLD
KVLTQMGSPS	VRCSSMS

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,ацетилювання,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996).Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response.Nature.383: 168—172.PMID 8774881doi:10.1038/383168a0
Liu F., Pouponnot C., Massague J. (1997).Dual role of the Smad4/DPC4 tumor suppressor in TGFbeta-inducible transcriptional complexes.Genes Dev.11: 3157—3167.PMID 9389648doi:10.1101/gad.11.23.3157
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Tsukazaki T., Chiang T.A., Davison A.F., Attisano L., Wrana J.L. (1998). SARA, a FYVE domain protein that recruits Smad2 to the TGFbeta receptor.Cell.95: 779—791.PMID 9865696doi:10.1016/S0092-8674(00)81701-8
Kawabata M., Inoue H., Hanyu A., Imamura T., Miyazono K. (1998).Smad proteins exist as monomers in vivo and undergo homo- and hetero-oligomerization upon activation by serine/threonine kinase receptors.EMBO J.17: 4056—4065.PMID 9670020doi:10.1093/emboj/17.14.4056
Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997).The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase.Genes Dev.11: 984—995.PMID 9136927doi:10.1101/gad.11.8.984

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6768 (англ.) . Архіворигіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.[Архівовано 2017-09-26 уWayback Machine.]
↑UniProt, Q15796 (англ.) . Архіворигіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 18

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=SMAD2&oldid=46338898

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭