SIX4 Ідентифікатори Символи SIX4 Зовнішні ІД OMIM :606342 MGI: 106034 HomoloGene: 69089 GeneCards: SIX4 Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес • tongue development • trigeminal ganglion development • sarcomere organization • generation of neurons • regulation of branch elongation involved in ureteric bud branching • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • negative regulation of satellite cell differentiation • pharyngeal system development • anatomical structure morphogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • inner ear morphogenesis • myotome development • fungiform papilla morphogenesis • skeletal muscle fiber differentiation • positive regulation of ureteric bud formation • регуляція експресії генів • embryonic cranial skeleton morphogenesis • GO:1903374 anatomical structure development • regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction • olfactory placode formation • myoblast migration • thymus development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • regulation of epithelial cell proliferation • metanephric mesenchyme development • male sex determination • skeletal muscle tissue development • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • regulation of protein localization • диференціація чоловічої статі • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • male gonad development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein localization to nucleus
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 14: 60.71 – 60.72 Mb Хр. 12: 73.15 – 73.16 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SIX4 (англ. SIX homeobox 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 82 933[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSSSSPTGQI ASAADIKQEN GMESASEGQE AHREVAGGAA VGLSPPAPAP FPLEPGDAAT AAARVSGEEG AVAAAAAGAA ADQVQLHSEL LGRHHHAAAA AAQTPLAFSP DHVACVCEAL QQGGNLDRLA RFLWSLPQSD LLRGNESLLK ARALVAFHQG IYPELYSILE SHSFESANHP LLQQLWYKAR YTEAERARGR PLGAVDKYRL RRKFPLPRTI WDGEETVYCF KEKSRNALKE LYKQNRYPSP AEKRHLAKIT GLSLTQVSNW FKNRRQRDRN PSETQSKSES DGNPSTEDES SKGHEDLSPH PLSSSSDGIT NLSLSSHMEP VYMQQIGNAK ISLSSSGVLL NGSLVPASTS PVFLNGNSFI QGPSGVILNG LNVGNTQAVA LNPPKMSSNI VSNGISMTDI LGSTSQDVKE FKVLQSSANS ATTTSYSPSV PVSFPGLIPS TEVKREGIQT VASQDGGSVV TFTTPVQINQ YGIVQIPNSG ANSQFLNGSI GFSPLQLPPV SVAASQGNIS VSSSTSDGST FTSESTTVQQ GKVFLSSLAP SAVVYTVPNT GQTIGSVKQE GLERSLVFSQ LMPVNQNAQV NANLSSENIS GSGLHPLASS LVNVSPTHNF SLSPSTLLNP TELNRDIADS QPMSAPVASK STVTSVSNTN YATLQNCSLI TGQDLLSVPM TQAALGEIVP TAEDQVGHPS PAVHQDFVQE HRLVLQSVAN MKENFLSNSE SKATSSLMML DSKSKYVLDG MVDTVCEDLE TDKKELAKLQ TVQLDEDMQD L
Кодований геном білок за функціями належить добілків розвитку ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,ацетилювання . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
