SIM1 Ідентифікатори Символи SIM1 , bHLHe14, single-minded family bHLH transcription factor 1, SIM bHLH transcription factor 1Зовнішні ІД OMIM :603128 MGI: 98306 HomoloGene: 3715 GeneCards: SIM1 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • protein dimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • диференціація клітин • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 6: 100.39 – 100.46 Mb Хр. 10: 50.77 – 50.87 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SIM1 (англ. Single-minded family bHLH transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766амінокислот , амолекулярна маса — 85 515[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MKEKSKNAAR TRREKENSEF YELAKLLPLP SAITSQLDKA SIIRLTTSYL KMRVVFPEGL GEAWGHSSRT SPLDNVGREL GSHLLQTLDG FIFVVAPDGK IMYISETASV HLGLSQVELT GNSIYEYIHP ADHDEMTAVL TAHQPYHSHF VQEYEIERSF FLRMKCVLAK RNAGLTCGGY KVIHCSGYLK IRQYSLDMSP FDGCYQNVGL VAVGHSLPPS AVTEIKLHSN MFMFRASLDM KLIFLDSRVA ELTGYEPQDL IEKTLYHHVH GCDTFHLRCA HHLLLVKGQV TTKYYRFLAK HGGWVWVQSY ATIVHNSRSS RPHCIVSVNY VLTDTEYKGL QLSLDQISAS KPAFSYTSSS TPTMTDNRKG AKSRLSSSKS KSRTSPYPQY SGFHTERSES DHDSQWGGSP LTDTASPQLL DPADRPGSQH DASCAYRQFS DRSSLCYGFA LDHSRLVEER HFHTQACEGG RCEAGRYFLG TPQAGREPWW GSRAALPLTK ASPESREAYE NSMPHIASVH RIHGRGHWDE DSVVSSPDPG SASESGDRYR TEQYQSSPHE PSKIETLIRA TQQMIKEEEN RLQLRKAPSD QLASINGAGK KHSLCFANYQ QPPPTGEVCH GSALANTSPC DHIQQREGKM LSPHENDYDN SPTALSRISS PNSDRISKSS LILAKDYLHS DISPHQTAGD HPTVSPNCFG SHRQYFDKHA YTLTGYALEH LYDSETIRNY SLGCNGSHFD VTSHLRMQPD PAQGHKGTSV IITNGS
Кодований геном білок за функцією належить добілків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин ,нейрогенез . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Yamaki A., Kudoh J., Shimizu N., Shimizu Y. (2004). A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2.Biochem. Biophys. Res. Commun .313 : 482—488. PMID 14697214 doi :10.1016/j.bbrc.2003.11.168
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші