SALL2 Ідентифікатори Символи SALL2 , COLB, HSAL2, Sal-2, ZNF795, p150(Sal2), spalt-like transcription factor 2, spalt like transcription factor 2Зовнішні ІД OMIM :602219 MGI: 1354373 HomoloGene: 9269 GeneCards: SALL2 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента • NuRD complex • клітинне ядро
Біологічний процес • розвиток ока • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • neural tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 14: 21.52 – 21.54 Mb Хр. 14: 52.55 – 52.57 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SALL2 (англ. Spalt like transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007амінокислот , амолекулярна маса — 105 309[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSRRKQRKPQ QLISDCEGPS ASENGDASEE DHPQVCAKCC AQFTDPTEFL AHQNACSTDP PVMVIIGGQE NPNNSSASSE PRPEGHNNPQ VMDTEHSNPP DSGSSVPTDP TWGPERRGEE SPGHFLVAAT GTAAGGGGGL ILASPKLGAT PLPPESTPAP PPPPPPPPPP GVGSGHLNIP LILEELRVLQ QRQIHQMQMT EQICRQVLLL GSLGQTVGAP ASPSELPGTG TASSTKPLLP LFSPIKPVQT SKTLASSSSS SSSSSGAETP KQAFFHLYHP LGSQHPFSAG GVGRSHKPTP APSPALPGST DQLIASPHLA FPSTTGLLAA QCLGAARGLE ATASPGLLKP KNGSGELSYG EVMGPLEKPG GRHKCRFCAK VFGSDSALQI HLRSHTGERP YKCNVCGNRF TTRGNLKVHF HRHREKYPHV QMNPHPVPEH LDYVITSSGL PYGMSVPPEK AEEEAATPGG GVERKPLVAS TTALSATESL TLLSTSAGTA TAPGLPAFNK FVLMKAVEPK NKADENTPPG SEGSAISGVA ESSTATRMQL SKLVTSLPSW ALLTNHFKST GSFPFPYVLE PLGASPSETS KLQQLVEKID RQGAVAVTSA ASGAPTTSAP APSSSASSGP NQCVICLRVL SCPRALRLHY GQHGGERPFK CKVCGRAFST RGNLRAHFVG HKASPAARAQ NSCPICQKKF TNAVTLQQHV RMHLGGQIPN GGTALPEGGG AAQENGSEQS TVSGAGSFPQ QQSQQPSPEE ELSEEEEEED EEEEEDVTDE DSLAGRGSES GGEKAISVRG DSEEASGAEE EVGTVAAAAT AGKEMDSNEK TTQQSSLPPP PPPDSLDQPQ PMEQGSSGVL GGKEEGGKPE RSSSPASALT PEGEATSVTL VEELSLQEAM RKEPGESSSR KACEVCGQAF PSQAALEEHQ KTHPKEGPLF TCVFCRQGFL ERATLKKHML LAHHQVQPFA PHGPQNIAAL SLVPGCSPSI TSTGLSPFPR KDDPTIP
Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші