RFX4 Ідентифікатори Символи RFX4 Зовнішні ІД OMIM :603958 MGI: 1918387 HomoloGene: 31119 GeneCards: RFX4 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • forebrain development • telencephalon development • dorsal spinal cord development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning • cerebellar cortex morphogenesis • midbrain development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of protein processing • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • cilium assembly
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 12: 106.58 – 106.76 Mb Хр. 10: 84.59 – 84.74 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
RFX4 (англ. Regulatory factor X4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 83 368[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MHCGLLEEPD MDSTESWIER CLNESENKRY SSHTSLGNVS NDENEEKENN RASKPHSTPA TLQWLEENYE IAEGVCIPRS ALYMHYLDFC EKNDTQPVNA ASFGKIIRQQ FPQLTTRRLG TRGQSKYHYY GIAVKESSQY YDVMYSKKGA AWVSETGKKE VSKQTVAYSP RSKLGTLLPE FPNVKDLNLP ASLPEEKVST FIMMYRTHCQ RILDTVIRAN FDEVQSFLLH FWQGMPPHML PVLGSSTVVN IVGVCDSILY KAISGVLMPT VLQALPDSLT QVIRKFAKQL DEWLKVALHD LPENLRNIKF ELSRRFSQIL RRQTSLNHLC QASRTVIHSA DITFQMLEDW RNVDLNSITK QTLYTMEDSR DEHRKLITQL YQEFDHLLEE QSPIESYIEW LDTMVDRCVV KVAAKRQGSL KKVAQQFLLM WSCFGTRVIR DMTLHSAPSF GSFHLIHLMF DDYVLYLLES LHCQERANEL MRAMKGEGST AEVREEIILT EAAAPTPSPV PSFSPAKSAT SVEVPPPSSP VSNPSPEYTG LSTTGAMQSY TWSLTYTVTT AAGSPAENSQ QLPCMRNTHV PSSSVTHRIP VYPHREEHGY TGSYNYGSYG NQHPHPMQSQ YPALPHDTAI SGPLHYAPYH RSSAQYPFNS PTSRMEPCLM SSTPRLHPTP VTPRWPEVPS ANTCYTSPSV HSARYGNSSD MYTPLTTRRN SEYEHMQHFP GFAYINGEAS TGWAK
Кодований геном білок за функцією належить доактиваторів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
