| RELB |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів:PDBeRCSB |
|---|
| Список кодів PDB |
|---|
1ZK9,1ZKA,2V2T,3DO7,3JSS,3JUZ,3JV0,3JV4,3JV6,4JGM,4JHB |
|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | RELB, I-REL, IREL, REL-B, RELB proto-oncogene, NF-kB subunit, IMD53 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM:604758MGI:103289HomoloGene:4747GeneCards:RELB |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | •DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001106 transcription corepressor activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •chromatin binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein kinase binding •identical protein binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента | •I-kappaB/NF-kappaB complex •нуклеоплазма •центр організації мікротрубочок •цитоскелет •клітинне ядро •цитоплазма •гіалоплазма •центросома •GO:0009327 protein-containing complex •transcription repressor complex
|
|---|
| Біологічний процес | •response to cytokine •antigen processing and presentation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •ритмічний процес •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •myeloid dendritic cell differentiation •stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •T-helper 1 cell differentiation •negative regulation of interferon-beta production •circadian regulation of gene expression •transcription, DNA-templated •cellular response to osmotic stress •GO:1901313 positive regulation of gene expression •NIK/NF-kappaB signaling •T-helper 1 type immune response •inflammatory response •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •вроджений імунітет •lymphocyte differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo /QuickGO |
|
| Шаблонекспресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 45 – 45.04 Mb | Хр. 7: 19.34 – 19.36 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
|
RELB (англ.RELB proto-oncogene, NF-kB subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579амінокислот, амолекулярна маса — 62 134[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
| MLRSGPASGP | | SVPTGRAMPS | | RRVARPPAAP | | ELGALGSPDL | | SSLSLAVSRS |
| TDELEIIDEY | | IKENGFGLDG | | GQPGPGEGLP | | RLVSRGAASL | | STVTLGPVAP |
| PATPPPWGCP | | LGRLVSPAPG | | PGPQPHLVIT | | EQPKQRGMRF | | RYECEGRSAG |
| SILGESSTEA | | SKTLPAIELR | | DCGGLREVEV | | TACLVWKDWP | | HRVHPHSLVG |
| KDCTDGICRV | | RLRPHVSPRH | | SFNNLGIQCV | | RKKEIEAAIE | | RKIQLGIDPY |
| NAGSLKNHQE | | VDMNVVRICF | | QASYRDQQGQ | | MRRMDPVLSE | | PVYDKKSTNT |
| SELRICRINK | | ESGPCTGGEE | | LYLLCDKVQK | | EDISVVFSRA | | SWEGRADFSQ |
| ADVHRQIAIV | | FKTPPYEDLE | | IVEPVTVNVF | | LQRLTDGVCS | | EPLPFTYLPR |
| DHDSYGVDKK | | RKRGMPDVLG | | ELNSSDPHGI | | ESKRRKKKPA | | ILDHFLPNHG |
| SGPFLPPSAL | | LPDPDFFSGT | | VSLPGLEPPG | | GPDLLDDGFA | | YDPTAPTLFT |
| MLDLLPPAPP | | HASAVVCSGG | | AGAVVGETPG | | PEPLTLDSYQ | | APGPGDGGTA |
| SLVGSNMFPN | | HYREAAFGGG | | LLSPGPEAT |
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,активаторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уцитоплазмі,цитоскелеті,ядрі.
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1)Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|