REL Ідентифікатори Символи REL Зовнішні ІД OMIM :164910 MGI: 97897 HomoloGene: 2182 GeneCards: REL Пов'язані генетичні захворювання ревматоїдний артрит ,psoriatic arthritis [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • I-kappaB/NF-kappaB complex • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of neuron death • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 2: 60.88 – 60.93 Mb Хр. 11: 23.69 – 23.72 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
REL (англ. REL proto-oncogene, NF-kB subunit ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 68 520[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MASGAYNPYI EIIEQPRQRG MRFRYKCEGR SAGSIPGEHS TDNNRTYPSI QIMNYYGKGK VRITLVTKND PYKPHPHDLV GKDCRDGYYE AEFGQERRPL FFQNLGIRCV KKKEVKEAII TRIKAGINPF NVPEKQLNDI EDCDLNVVRL CFQVFLPDEH GNLTTALPPV VSNPIYDNRA PNTAELRICR VNKNCGSVRG GDEIFLLCDK VQKDDIEVRF VLNDWEAKGI FSQADVHRQV AIVFKTPPYC KAITEPVTVK MQLRRPSDQE VSESMDFRYL PDEKDTYGNK AKKQKTTLLF QKLCQDHVET GFRHVDQDGL ELLTSGDPPT LASQSAGITV NFPERPRPGL LGSIGEGRYF KKEPNLFSHD AVVREMPTGV SSQAESYYPS PGPISSGLSH HASMAPLPSS SWSSVAHPTP RSGNTNPLSS FSTRTLPSNS QGIPPFLRIP VGNDLNASNA CIYNNADDIV GMEASSMPSA DLYGISDPNM LSNCSVNMMT TSSDSMGETD NPRLLSMNLE NPSCNSVLDP RDLRQLHQMS SSSMSAGANS NTTVFVSQSD AFEGSDFSCA DNSMINESGP SNSTNPNSHG FVQDSQYSGI GSMQNEQLSD SFPYEFFQV
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції , ацетиляція,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Brownell E., O'Brien S.J., Nash W.G., Rice N.R. (1985).Genetic characterization of human c-rel sequences .Mol. Cell. Biol .5 : 2826—2831. PMID 3016517 doi :10.1128/MCB.5.10.2826 Li Z., Nabel G.J. (1997).A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription .Mol. Cell. Biol .17 : 6184—6190. PMID 9315679 doi :10.1128/MCB.17.10.6184 Martin A.G., Fresno M. (2000). Tumor necrosis factor-alpha activation of NF-kappa B requires the phosphorylation of Ser-471 in the transactivation domain of c-Rel.J. Biol. Chem .275 : 24383—24391. PMID 10823840 doi :10.1074/jbc.M909396199 Guizani-Tabbane L., Ben-Aissa K., Belghith M., Sassi A., Dellagi K. (2004).Leishmania major amastigotes induce p50/c-Rel NF-kappa B transcription factor in human macrophages: involvement in cytokine synthesis .Infect. Immun .72 : 2582—2589. PMID 15102766 doi :10.1128/IAI.72.5.2582-2589.2004 Brownell E., Mittereder N., Rice N.R. (1989).A human rel proto-oncogene cDNA containing an Alu fragment as a potential coding exon .Oncogene .4 : 935—942. PMID 2666912
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
