RARA Ідентифікатори Символи RARA Зовнішні ІД OMIM :180240 MGI: 97856 HomoloGene: 20262 GeneCards: RARA Реагує на сполуку adapalene ,alitretinoin ,tamibarotene ,tazarotene ,третиноїн [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • retinoic acid binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • mRNA 5'-UTR binding • signaling receptor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • retinoic acid-responsive element binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • enzyme binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • protein kinase A binding • protein kinase B binding • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • alpha-actinin binding • protein heterodimerization activity • chromatin DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента • цитоплазма • actin cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • клітинне ядро • cell surface • нуклеоплазма • soma • дендрит (нейробіологія) • гіалоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес • growth plate cartilage development • germ cell development • cellular response to retinoic acid • ureteric bud development • positive regulation of interleukin-5 production • prostate gland development • limb development • apoptotic cell clearance • chondroblast differentiation • regulation of granulocyte differentiation • protein phosphorylation • response to vitamin A • face development • Сперматогенез • response to ethanol • negative regulation of cell population proliferation • steroid hormone mediated signaling pathway • regulation of apoptotic process • response to cytokine • negative regulation of translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell differentiation • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to estrogen stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell cycle • regulation of myelination • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of tumor necrosis factor production • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • trachea cartilage development • glandular epithelial cell development • male gonad development • negative regulation of cartilage development • response to retinoic acid • negative regulation of granulocyte differentiation • multicellular organism growth • жіноча вагітність • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interleukin-4 production • regulation of synaptic plasticity • outflow tract septum morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of interferon-gamma production • response to estradiol • negative regulation of translational initiation • embryonic camera-type eye development • positive regulation of interleukin-13 production • neural tube closure • positive regulation of binding • retinoic acid receptor signaling pathway • GO:1901313 positive regulation of gene expression • Sertoli cell fate commitment • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of T-helper 2 cell differentiation • ventricular cardiac muscle cell differentiation • liver development • cellular response to lipopolysaccharide • bone development • hippocampus development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • response to lipid • gland development • bone morphogenesis • epithelium development
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 17: 40.31 – 40.36 Mb Хр. 11: 98.82 – 98.87 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
RARA (англ. Retinoic acid receptor alpha ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 50 771[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MASNSSSCPT PGGGHLNGYP VPPYAFFFPP MLGGLSPPGA LTTLQHQLPV SGYSTPSPAT IETQSSSSEE IVPSPPSPPP LPRIYKPCFV CQDKSSGYHY GVSACEGCKG FFRRSIQKNM VYTCHRDKNC IINKVTRNRC QYCRLQKCFE VGMSKESVRN DRNKKKKEVP KPECSESYTL TPEVGELIEK VRKAHQETFP ALCQLGKYTT NNSSEQRVSL DIDLWDKFSE LSTKCIIKTV EFAKQLPGFT TLTIADQITL LKAACLDILI LRICTRYTPE QDTMTFSDGL TLNRTQMHNA GFGPLTDLVF AFANQLLPLE MDDAETGLLS AICLICGDRQ DLEQPDRVDM LQEPLLEALK VYVRKRRPSR PHMFPKMLMK ITDLRSISAK GAERVITLKM EIPGSMPPLI QEMLENSEGL DTLSGQPGGG GRDGGGLAPP PGSCSPSLSP SSNRSSPATH SP
Кодований геном білок за функціями належить дорецепторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
Giguere V., Ong E.S., Segui P., Evans R.M. (1987). Identification of a receptor for the morphogen retinoic acid.Nature .330 : 624—629. PMID 2825036 doi :10.1038/330624a0 Hjalt T.A.H., Murray J.C. (1999). Genomic structure of the human retinoic acid receptor-alpha1 gene.Mamm. Genome .10 : 528—529. PMID 10337631 doi :10.1007/s003359901036 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Brand N.J., Petkovich M., Chambon P. (1990). Characterization of a functional promoter for the human retinoic acid receptor-alpha (hRAR-alpha).Nucleic Acids Res .18 : 6799—6806. PMID 2175878 doi :10.1093/nar/18.23.6799 Petkovich M., Brand N.J., Krust A., Chambon P. (1987). A human retinoic acid receptor which belongs to the family of nuclear receptors.Nature .330 : 444—450. PMID 2825025 doi :10.1038/330444a0 Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002).ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator .Mol. Cell. Biol .22 : 3358—3372. PMID 11971969 doi :10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
