Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

PTAFR

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

PTAFR

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
2B0X

Ідентифікатори

Символи

PTAFR, PAFR, platelet activating factor receptor

Зовнішні ІД

OMIM:173393 MGI:106066 HomoloGene:20260 GeneCards:PTAFR

Реагує на сполуку

Фактор активації тромбоцитів^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•G protein-coupled receptor activity •G protein-coupled purinergic nucleotide receptor activity •lipopolysaccharide binding •signal transducer activity •mitogen-activated protein kinase binding •platelet activating factor receptor activity •phospholipid binding •lipopolysaccharide immune receptor activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	•integral component of membrane •мембрана •integral component of plasma membrane •клітинна мембрана •secretory granule membrane •tertiary granule membrane
Біологічний процес	•G protein-coupled receptor signaling pathway •positive regulation of leukocyte tethering or rolling •inositol trisphosphate biosynthetic process •positive regulation of voltage-gated chloride channel activity •positive regulation of phospholipase C activity •negative regulation of blood pressure •interferon-gamma-mediated signaling pathway •positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •positive regulation of transcytosis •GO:0032617 творба цитокінів •response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine •response to symbiotic bacterium •Цитопемпсис •positive regulation of translation •cellular response to gravity •response to dexamethasone •positive regulation of cellular extravasation •positive regulation of maternal process involved in parturition •хемотаксис •cellular response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine •positive regulation of sensory perception of pain •response to lipopolysaccharide •cellular response to fatty acid •response to organophosphorus •народження •positive regulation of vasoconstriction •GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь •positive regulation of gastro-intestinal system smooth muscle contraction •positive regulation of tumor necrosis factor production •inflammatory response •positive regulation of smooth muscle contraction •positive regulation of neutrophil degranulation •positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion •phosphatidylinositol-mediated signaling •lipopolysaccharide-mediated signaling pathway •cellular response to cAMP •GO:0072468 сигнальна трансдукція •positive regulation of smooth muscle cell proliferation •G protein-coupled purinergic nucleotide receptor signaling pathway •neutrophil degranulation •cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5724


19204

Ensembl


ENSG00000169403


ENSMUSG00000056529

UniProt


P25105


Q62035

RefSeq (мРНК)


NM_001164723 NM_000952 NM_001164721 NM_001164722


NM_001081211

RefSeq (білок)


NP_000943 NP_001158193 NP_001158194 NP_001158195


NP_001074680

Локус (UCSC)

Хр. 1: 28.15 – 28.19 Mb

Хр. 4: 132.29 – 132.31 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTAFR (англ.Platelet activating factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342амінокислот, амолекулярна маса — 39 203^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPHDSSHMD	SEFRYTLFPI	VYSIIFVLGV	IANGYVLWVF	ARLYPCKKFN
EIKIFMVNLT	MADMLFLITL	PLWIVYYQNQ	GNWILPKFLC	NVAGCLFFIN
TYCSVAFLGV	ITYNRFQAVT	RPIKTAQANT	RKRGISLSLV	IWVAIVGAAS
YFLILDSTNT	VPDSAGSGNV	TRCFEHYEKG	SVPVLIIHIF	IVFSFFLVFL
IILFCNLVII	RTLLMQPVQQ	QRNAEVKRRA	LWMVCTVLAV	FIICFVPHHV
VQLPWTLAEL	GFQDSKFHQA	INDAHQVTLC	LLSTNCVLDP	VIYCFLTKKF
RKHLTEKFYS	MRSSRKCSRA	TTDTVTEVVV	PFNQIPGNSL	KN

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорецепторів,g-білокспряжених рецепторів,білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі якхемотаксис. Локалізований уклітинній мембрані, мембрані.

Література

[ред. |ред. код]

Ye R.D., Prossnitz E.R., Zou A., Cochrane C.G. (1991). Characterization of a human cDNA that encodes a functional receptor for platelet activating factor.Biochem. Biophys. Res. Commun.180: 105—111.PMID 1656963doi:10.1016/S0006-291X(05)81261-6
Seyfried C.E., Schweickart V.L., Godiska R., Gray P.W. (1992). The human platelet-activating factor receptor gene (PTAFR) contains no introns and maps to chromosome 1.Genomics.13: 832—834.PMID 1322356doi:10.1016/0888-7543(92)90162-L
Chase P.B., Halonen M., Regan J.W. (1993). Cloning of a human platelet-activating factor receptor gene: evidence for an intron in the 5'-untranslated region.Am. J. Respir. Cell Mol. Biol.8: 240—244.PMID 8383507doi:10.1165/ajrcmb/8.3.240
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Kunz D., Gerard N.P., Gerard C. (1992).The human leukocyte platelet-activating factor receptor. cDNA cloning, cell surface expression, and construction of a novel epitope-bearing analog.J. Biol. Chem.267: 9101—9106.PMID 1374385

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet activating factor receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9582 (англ.) . Архіворигіналу за 17 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.[Архівовано 2016-03-17 уWayback Machine.]
↑UniProt, P25105 (англ.) . Архіворигіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 1

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Трансмембранні рецептори:G-білокспряжені рецептори

Клас A:Родопсин-подібні

Рецептори нейромедіаторів

Адренорецептори	α1 A B D α2 A B C β1 β2 β3
Пуринові рецептори	Аденозинові рецептори A1 A2A A2B A3 P2Y 1 2 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14
Серотонінові рецептори	(крім 5-HT3) 5-HT1 A B D E F) 5-HT2 A B C 5-HT 4 5A 6 7)
Інші	Мускариновий ацетилхоліновий рецептор M1 M2 M3 M4 M5 Дофамінові рецептори D1 D2 D3 D4 D5 GHB-рецептор Гістамінові рецептори H1 H2 H3 H4 Мелатонінові рецептори 1A 1B 1C TAAR 1 2 5 6 8 9

Метаболіти та
сигнальні молекули

Ейкозаноїдні рецептори	CysLT 1 2 LTB4 1 2 FPR2 OXER1 Простагландинові рецептори DP 1 2 EP 1 2 3 4) FP PTGIR TBXA2R
Інші	Жовчні кислоти Канабіноїдні рецептори CB1 CB2 GPR 18 55 119 EBI2 Естроген Рецептори вільних жирних кислот 1 2 3 4 HCAR 1 2 3 LPAR 1 2 3 4 5 6 S1PR 1 2 3 4 5 OXGR1 PTAFR SUCNR1

Пептиди

Рецептори нейропептидів

B/W
- 1
- 2
FF
- 1
- 2
S
Y
- 1
- 2
- 4
- 5
Нейромедин
- B
- U
  - 1
  - 2
Нейротенсин
- 1
- 2

Інші

Анафілатоксин
- C3a
- C5a
  - 1
  - 2
Ангіатонзин
- 1
- 2
Апелін
Бомбезин
- BRS3
- GRPR
- NMBR
Брадикинін
- B1
- B2
Хемокиновий рецептор
Холецистокинін
- A
- B
Ендотилін
- A
- B
FPR
- 1
- 2
- 3
FSHR
Галанін
- 1
- 2
- 3
GNRHR
- 1
- 2
GHSR
KISS1R
LHCGR
MAS
- 1
- 1L
- D
- E
- F
- G
- X1
- X2
- X3
- X4
Меланокортин
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
MCHR
- 1
- 2
MLNR
Опіати
- Δ
- Κ
- Μ
- OPRL1
- OGFR
Орексин
- 1
- 2
Окситоцин
Прокінетецин
- 1
- 2
PRLHR
Релаксин
- 1
- 2
- 3
- 4
Рецептори соматостатинів
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
Тахінін
- 1
- 2
- 3
Рецептор тиреотропного гормону
TRHR
UTS2R
Рецептори вазопресину
- 1A
- 1B
- 2

Різні

Смак, гірке	TAS2R 1 3 4 5 7 8 9 10 13 14 16 19 20 30 31 38 39 40 41 42 43 45 46 50 60 VN1R 1 2 3 4 5
Орфанні	GPR (1 3 4 6 12 15 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 31 32 33 34 35 37 39 42 44 45 50 52 55 61 62 63 65 68 75 77 78 81 82 83 84 85 87 88 92 101 103 109A 109B 119 120 132 135 137B 139 141 142 146 148 149 150 151 152 153 160 161 162 171 173 174 176 177 182 183)
Інші	GPR182 Запах Опсин 3 4 5 1LW 1MW 1SW RGR RRH F2R 1 2 3 4 SREB 1 2 3

Клас B:Секретин-подібні

Адгезивні	ADGRG 1 2 3 4 5 6 7
Орфанні	GPR (56 64 97 98 110 111 112 113 114 115 116 123 124 125 126 128 133 143 144 155 157)
Інші	ADGRB 1 2 3 CELSR 1 2 3 Кальцитонін CALCRL ADGRE5 CRHR 1 2 EMR 1 2 3 Глюкагон GR GIPR GLP1R GLP2R GHRHR PACAPR1 Латрофілін 1 2 3 4 PTH 1 2 SCTR VIPR 1 2

Клас C:Метаботропні глутаматні рецептори /феромони

Смак, солодке	TAS1R 1 2 3 VN2R
Other	CASR ГАМК-рецептори 1 2 Глутаматні рецептори Метаботропні глутаматні 1 2 3 4 5 6 7 8 GPRC6A GPR 156 158 179 RAIG 1 2 3 4

Клас F: FZD & SMO

FZD	FZD 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
SMO	SMO

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=PTAFR&oldid=46338564

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭