PPARA Наявні структури PDB Пошук ортологів:PDBe RCSB Список кодів PDB 1I7G ,1K7L ,1KKQ ,2NPA ,2P54 ,2REW ,2ZNN ,3ET1 ,3FEI ,3G8I ,3KDT ,3KDU ,3SP6 ,3VI8 ,4BCR ,4CI4 ,5AZT
Ідентифікатори Символи PPARA Зовнішні ІД MGI: 104740 HomoloGene: 21047 GeneCards: PPARA Реагує на сполуку bezafibrate ,ciprofibrate ,Клофібрат ,farglitazar ,Фенофібрат ,gemfibrozil ,oleic monoethanolamide ,pirinixic acid [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • lipid binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signaling receptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • transcription coactivator binding • phosphatase binding • NFAT protein binding • MDM2/MDM4 family protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • fatty acid binding • nuclear receptor coactivator activity
Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес • lipoprotein metabolic process • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of fatty acid beta-oxidation • negative regulation of glycolytic process • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of blood pressure • Обмін жирів • ритмічний процес • Загоєння ран • negative regulation of leukocyte cell-cell adhesion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • fatty acid transport • negative regulation of protein binding • negative regulation of appetite • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • fatty acid metabolic process • behavioral response to nicotine • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • negative regulation of cholesterol storage • response to insulin • development of the heart • intracellular receptor signaling pathway • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • negative regulation of sequestering of triglyceride • regulation of circadian rhythm • regulation of fatty acid metabolic process • epidermis development • регуляція експресії генів • enamel mineralization • positive regulation of gluconeogenesis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • negative regulation of neuron death • positive regulation of fatty acid oxidation • regulation of lipid metabolic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • response to lipid • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 22: 46.15 – 46.24 Mb Хр. 15: 85.62 – 85.69 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
PPARA (англ. Peroxisome proliferator activated receptor alpha ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 52 225[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MVDTESPLCP LSPLEAGDLE SPLSEEFLQE MGNIQEISQS IGEDSSGSFG FTEYQYLGSC PGSDGSVITD TLSPASSPSS VTYPVVPGSV DESPSGALNI ECRICGDKAS GYHYGVHACE GCKGFFRRTI RLKLVYDKCD RSCKIQKKNR NKCQYCRFHK CLSVGMSHNA IRFGRMPRSE KAKLKAEILT CEHDIEDSET ADLKSLAKRI YEAYLKNFNM NKVKARVILS GKASNNPPFV IHDMETLCMA EKTLVAKLVA NGIQNKEAEV RIFHCCQCTS VETVTELTEF AKAIPGFANL DLNDQVTLLK YGVYEAIFAM LSSVMNKDGM LVAYGNGFIT REFLKSLRKP FCDIMEPKFD FAMKFNALEL DDSDISLFVA AIICCGDRPG LLNVGHIEKM QEGIVHVLRL HLQSNHPDDI FLFPKLLQKM ADLRQLVTEH AQLVQIIKKT ESDAALHPLL QEIYRDMY
Кодований геном білок за функціями належить дорецепторів ,активаторів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , біологічні ритми,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зліпідами , іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
Sher T., Yi H.F., McBride O.W., Gonzales F.J. (1993). cDNA cloning, chromosomal mapping, and functional characterization of the human peroxisome proliferator activated receptor.Biochemistry .32 : 5598—5604. PMID 7684926 doi :10.1021/bi00072a015 Mukherjee R., Jow L., Noonan D., McDonnell D.P. (1994).Human and rat peroxisome proliferator activated receptors (PPARs) demonstrate similar tissue distribution but different responsiveness to PPAR activators .J. Steroid Biochem. Mol. Biol .51 : 157—166. PMID 7981125 doi :10.1016/0960-0760(94)90089-2 Tugwood J.D., Aldridge T.C., Lambe K.G., Macdonald N., Woodyatt N.J. (1996).Peroxisome proliferator-activated receptors: structures and function .Ann. N. Y. Acad. Sci .804 : 252—265. PMID 8993548 doi :10.1111/j.1749-6632.1996.tb18620.x Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system.FEBS Lett .582 : 2737—2744. PMID 18619963 doi :10.1016/j.febslet.2008.07.003 Li H., Gomes P.J., Chen J.D. (1997). RAC3, a steroid/nuclear receptor-associated coactivator that is related to SRC-1 and TIF2.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .94 : 8479—8484. PMID 9238002 doi :10.1073/pnas.94.16.8479 Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999).Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR .Mol. Cell. Endocrinol .147 : 37—47. PMID 10195690 doi :10.1016/S0303-7207(98)00217-2
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
