POU4F2 Ідентифікатори Символи POU4F2 Зовнішні ІД OMIM :113725 MGI: 102524 HomoloGene: 20959 GeneCards: POU4F2 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • p53 binding
Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • transcription regulator complex
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • аксоноґенеза • neuromuscular process controlling balance • слух • transcription, DNA-templated • MAPK cascade • axon guidance • retina development in camera-type eye • positive regulation of cell differentiation • Сперматогенез • neuron differentiation • axon extension • intracellular estrogen receptor signaling pathway • retinal ganglion cell axon guidance • regulation of signal transduction by p53 class mediator • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of programmed cell death • negative regulation of cell differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • positive regulation of axon extension • regulation of DNA-binding transcription factor activity • cellular response to cytokine stimulus • cellular response to estradiol stimulus • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • regulation of retinal ganglion cell axon guidance • negative regulation of amacrine cell differentiation • dorsal root ganglion development • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • GO:0097285 апоптоз • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • development of the heart • регуляція експресії генів • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • cellular response to insulin stimulus • positive regulation of glucose import • cellular response to oxygen levels • negative regulation of adipose tissue development
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 4: 146.64 – 146.64 Mb н/д PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
POU4F2 (англ. POU class 4 homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 43 087[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MMMMSLNSKQ AFSMPHGGSL HVEPKYSALH STSPGSSAPI APSASSPSSS SNAGGGGGGG GGGGGGGGRS SSSSSSGSSG GGGSEAMRRA CLPTPPSNIF GGLDESLLAR AEALAAVDIV SQSKSHHHHP PHHSPFKPDA TYHTMNTIPC TSAASSSSVP ISHPSALAGT HHHHHHHHHH HHQPHQALEG ELLEHLSPGL ALGAMAGPDG AVVSTPAHAP HMATMNPMHQ AALSMAHAHG LPSHMGCMSD VDADPRDLEA FAERFKQRRI KLGVTQADVG SALANLKIPG VGSLSQSTIC RFESLTLSHN NMIALKPILQ AWLEEAEKSH REKLTKPELF NGAEKKRKRT SIAAPEKRSL EAYFAIQPRP SSEKIAAIAE KLDLKKNVVR VWFCNQRQKQ KRMKYSAGI
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,активаторів ,білків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах якапоптоз ,транскрипція , регуляціятранскрипції , диференціація, поліморфізм,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уклітинній мембрані ,цитоплазмі ,ядрі , мембрані.
Ring C.J.A., Latchman D.S. (1993).The human Brn-3b POU transcription factor shows only limited homology to the Brn-3a/RDC-1 factor outside the conserved POU domain .Nucleic Acids Res .21 : 2946—2946. PMID 8332509 doi :10.1093/nar/21.12.2946 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Salichs E., Ledda A., Mularoni L., Alba M.M., de la Luna S. (2009). Genome-wide analysis of histidine repeats reveals their role in the localization of human proteins to the nuclear speckles compartment.PLoS Genet .5 : E1000397—E1000397. PMID 19266028 doi :10.1371/journal.pgen.1000397 Bhargava A.K., Li Z., Weissman S.M. (1993). Differential expression of four members of the POU family of proteins in activated and phorbol 12-myristate 13-acetate-treated Jurkat T cells.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .90 : 10260—10264. PMID 8234287 doi :10.1073/pnas.90.21.10260 Dennis J.H., Budhram-Mahadeo V., Latchman D.S. (2001). The Brn-3b POU family transcription factor regulates the cellular growth, proliferation, and anchorage dependence of MCF7 human breast cancer cells.Oncogene .20 : 4961—4971. PMID 11526481 doi :10.1038/sj.onc.1204491
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
