Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

PHF3

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

PHF3

Наявні структури

PDB

Пошук для людей:PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DME

Ідентифікатори

Символи

PHF3, PHD finger protein 3

Зовнішні ІД

OMIM:607789 MGI:2446126 HomoloGene:9040 GeneCards:PHF3

Онтологія гена
Молекулярна функція	•зв’язування з іоном металу •молекулярна функція
Клітинна компонента	•компонент клітини
Біологічний процес	•multicellular organism development •transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23469


213109

Ensembl


ENSG00000118482


ENSMUSG00000048874

UniProt


Q92576


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001290259 NM_001290260 NM_015153 NM_001370348 NM_001370349
NM_001370350


NM_001081080 NM_025871

RefSeq (білок)

NP_001277188 NP_001277189 NP_055968 NP_001357277 NP_001357278
NP_001357279


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 63.64 – 63.78 Mb

Хр. 1: 30.84 – 30.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PHF3 (англ.PHD finger protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 039амінокислот, амолекулярна маса — 229 481^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDIVDTFNHL	IPTEHLDDAL	FLGSNLENEV	CEDFSASQNV	LEDSLKNMLS
DKDPMLGSAS	NQFCLPVLDS	NDPNFQMPCS	TVVGLDDIMD	EGVVKESGND
TIDEEELILP	NRNLRDKVEE	NSVRSPRKSP	RLMAQEQVRS	LRQSTIAKRS
NAAPLSNTKK	ASGKTVSTAK	AGVKQPERSQ	VKEEVCMSLK	PEYHKENRRC
SRNSGQIEVV	PEVSVSSSHS	SVSSCLEMKD	EDGLDSKHKC	NNPGEIDVPS
HELNCSLLSE	TCVTIGEKKN	EALMECKAKP	VGSPLFKFSD	KEEHEQNDSI
SGKTGETVVE	EMIATRKVEQ	DSKETVKLSH	EDDHILEDAG	SSDISSDAAC
TNPNKTENSL	VGLPSCVDEV	TECNLELKDT	MGIADKTENT	LERNKIEPLG
YCEDAESNRQ	LESTEFNKSN	LEVVDTSTFG	PESNILENAI	CDVPDQNSKQ
LNAIESTKIE	SHETANLQDD	RNSQSSSVSY	LESKSVKSKH	TKPVIHSKQN
MTTDAPKKIV	AAKYEVIHSK	TKVNVKSVKR	NTDVPESQQN	FHRPVKVRKK
QIDKEPKIQS	CNSGVKSVKN	QAHSVLKKTL	QDQTLVQIFK	PLTHSLSDKS
HAHPGCLKEP	HHPAQTGHVS	HSSQKQCHKP	QQQAPAMKTN	SHVKEELEHP
GVEHFKEEDK	LKLKKPEKNL	QPRQRRSSKS	FSLDEPPLFI	PDNIATIRRE
GSDHSSSFES	KYMWTPSKQC	GFCKKPHGNR	FMVGCGRCDD	WFHGDCVGLS
LSQAQQMGEE	DKEYVCVKCC	AEEDKKTEIL	DPDTLENQAT	VEFHSGDKTM
ECEKLGLSKH	TTNDRTKYID	DTVKHKVKIL	KRESGEGRNS	SDCRDNEIKK
WQLAPLRKMG	QPVLPRRSSE	EKSEKIPKES	TTVTCTGEKA	SKPGTHEKQE
MKKKKVEKGV	LNVHPAASAS	KPSADQIRQS	VRHSLKDILM	KRLTDSNLKV
PEEKAAKVAT	KIEKELFSFF	RDTDAKYKNK	YRSLMFNLKD	PKNNILFKKV
LKGEVTPDHL	IRMSPEELAS	KELAAWRRRE	NRHTIEMIEK	EQREVERRPI
TKITHKGEIE	IESDAPMKEQ	EAAMEIQEPA	ANKSLEKPEG	SEKQKEEVDS
MSKDTTSQHR	QHLFDLNCKI	CIGRMAPPVD	DLSPKKVKVV	VGVARKHSDN
EAESIADALS	STSNILASEF	FEEEKQESPK	STFSPAPRPE	MPGTVEVEST
FLARLNFIWK	GFINMPSVAK	FVTKAYPVSG	SPEYLTEDLP	DSIQVGGRIS
PQTVWDYVEK	IKASGTKEIC	VVRFTPVTEE	DQISYTLLFA	YFSSRKRYGV
AANNMKQVKD	MYLIPLGATD	KIPHPLVPFD	GPGLELHRPN	LLLGLIIRQK
LKRQHSACAS	TSHIAETPES	APPIALPPDK	KSKIEVSTEE	APEEENDFFN
SFTTVLHKQR	NKPQQNLQED	LPTAVEPLME	VTKQEPPKPL	RFLPGVLIGW
ENQPTTLELA	NKPLPVDDIL	QSLLGTTGQV	YDQAQSVMEQ	NTVKEIPFLN
EQTNSKIEKT	DNVEVTDGEN	KEIKVKVDNI	SESTDKSAEI	ETSVVGSSSI
SAGSLTSLSL	RGKPPDVSTE	AFLTNLSIQS	KQEETVESKE	KTLKRQLQED
QENNLQDNQT	SNSSPCRSNV	GKGNIDGNVS	CSENLVANTA	RSPQFINLKR
DPRQAAGRSQ	PVTTSESKDG	DSCRNGEKHM	LPGLSHNKEH	LTEQINVEEK
LCSAEKNSCV	QQSDNLKVAQ	NSPSVENIQT	SQAEQAKPLQ	EDILMQNIET
VHPFRRGSAV	ATSHFEVGNT	CPSEFPSKSI	TFTSRSTSPR	TSTNFSPMRP
QQPNLQHLKS	SPPGFPFPGP	PNFPPQSMFG	FPPHLPPPLL	PPPGFGFAQN
PMVPWPPVVH	LPGQPQRMMG	PLSQASRYIG	PQNFYQVKDI	RRPERRHSDP
WGRQDQQQLD	RPFNRGKGDR	QRFYSDSHHL	KRERHEKEWE	QESERHRRRD
RSQDKDRDRK	SREEGHKDKE	RARLSHGDRG	TDGKASRDSR	NVDKKPDKPK
SEDYEKDKER	EKSKHREGEK	DRDRYHKDRD	HTDRTKSKR

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, якальтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8921 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q92576 (англ.) . Архіворигіналу за 15 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 6

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=PHF3&oldid=46338424

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭