PBX2 Ідентифікатори Символи PBX2 Зовнішні ІД OMIM :176311 MGI: 1341793 HomoloGene: 48115 GeneCards: PBX2 Пов'язані генетичні захворювання бронхіальна астма [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic limb morphogenesis • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 6: 32.18 – 32.19 Mb Хр. 17: 34.81 – 34.82 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
PBX2 (англ. PBX homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 45 881[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MDERLLGPPP PGGGRGGLGL VSGEPGGPGE PPGGGDPGGG SGGVPGGRGK QDIGDILQQI MTITDQSLDE AQAKKHALNC HRMKPALFSV LCEIKEKTGL SIRSSQEEEP VDPQLMRLDN MLLAEGVAGP EKGGGSAAAA AAAAASGGGV SPDNSIEHSD YRSKLAQIRH IYHSELEKYE QACNEFTTHV MNLLREQSRT RPVAPKEMER MVSIIHRKFS AIQMQLKQST CEAVMILRSR FLDARRKRRN FSKQATEVLN EYFYSHLSNP YPSEEAKEEL AKKCGITVSQ VSNWFGNKRI RYKKNIGKFQ EEANIYAVKT AVSVTQGGHS RTSSPTPPSS AGSGGSFNLS GSGDMFLGMP GLNGDSYSAS QVESLRHSMG PGGYGDNLGG GQMYSPREMR ANGSWQEAVT PSSVTSPTEG PGSVHSDTSN
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Monica K., Galili N., Nourse J., Saltman D., Cleary M.L. (1991).PBX2 and PBX3, new homeobox genes with extensive homology to the human proto-oncogene PBX1 .Mol. Cell. Biol .11 : 6149—6157. PMID 1682799 doi :10.1128/MCB.11.12.6149 Aguado B., Campbell R.D. (1995). The novel gene G17, located in the human major histocompatibility complex, encodes PBX2, a homeodomain-containing protein.Genomics .25 : 650—659. PMID 7759099 doi :10.1016/0888-7543(95)80007-9 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Lu Q., Wright D.D., Kamps M.P. (1994).Fusion with E2A converts the Pbx1 homeodomain protein into a constitutive transcriptional activator in human leukemias carrying the t(1;19) translocation .Mol. Cell. Biol .14 : 3938—3948. PMID 7910944 doi :10.1128/MCB.14.6.3938
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
