PAX8 |
---|
 |
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PAX8, paired box 8, PAX-8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM:167415MGI:97492HomoloGene:2589GeneCards:PAX8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | •DNA binding •sequence-specific DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •thyroid-stimulating hormone receptor activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента | •нуклеоплазма •клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес | •regulation of apoptotic process •pronephros development •regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation •диференціація клітин •mesonephric tubule development •positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis •kidney epithelium development •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of metanephric DCT cell differentiation •negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephric nephron morphogenesis •negative regulation of apoptotic process involved in metanephric collecting duct development •розвиток нирки •pronephric field specification •positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis •anatomical structure morphogenesis •metanephric epithelium development •mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis •transcription by RNA polymerase II •regulation of thyroid-stimulating hormone secretion •transcription, DNA-templated •otic vesicle development •metanephric distal convoluted tubule development •negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephros development •mesonephros development •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •metanephric nephron tubule formation •multicellular organism development •central nervous system development •metanephric comma-shaped body morphogenesis •branching involved in ureteric bud morphogenesis •thyroid gland development •positive regulation of thyroid hormone generation •negative regulation of apoptotic process involved in metanephric nephron tubule development •S-shaped body morphogenesis •inner ear morphogenesis •urogenital system development •sulfur compound metabolic process •metanephric S-shaped body morphogenesis •metanephros development •cellular response to gonadotropin stimulus •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •thyroid-stimulating hormone signaling pathway •negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process •ventricular septum development
|
---|
Джерела:Amigo /QuickGO |
|
Шаблонекспресії |
---|


 |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 113.22 – 113.28 Mb | Хр. 2: 24.31 – 24.37 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
PAX8 (англ.Paired box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450амінокислот, амолекулярна маса — 48 218[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
---|
MPHNSIRSGH | | GGLNQLGGAF | | VNGRPLPEVV | | RQRIVDLAHQ | | GVRPCDISRQ |
LRVSHGCVSK | | ILGRYYETGS | | IRPGVIGGSK | | PKVATPKVVE | | KIGDYKRQNP |
TMFAWEIRDR | | LLAEGVCDND | | TVPSVSSINR | | IIRTKVQQPF | | NLPMDSCVAT |
KSLSPGHTLI | | PSSAVTPPES | | PQSDSLGSTY | | SINGLLGIAQ | | PGSDKRKMDD |
SDQDSCRLSI | | DSQSSSSGPR | | KHLRTDAFSQ | | HHLEPLECPF | | ERQHYPEAYA |
SPSHTKGEQG | | LYPLPLLNST | | LDDGKATLTP | | SNTPLGRNLS | | THQTYPVVAD |
PHSPFAIKQE | | TPEVSSSSST | | PSSLSSSAFL | | DLQQVGSGVP | | PFNAFPHAAS |
VYGQFTGQAL | | LSGREMVGPT | | LPGYPPHIPT | | SGQGSYASSA | | IAGMVAGSEY |
SGNAYGHTPY | | SSYSEAWRFP | | NSSLLSSPYY | | YSSTSRPSAP | | PTTATAFDHL |
|
Кодований геном білок за функціями належить добілків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, диференціація, поліморфізм,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1)Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|