PAX4 Ідентифікатори Символи PAX4 , KPD, MODY9, paired box 4Зовнішні ІД OMIM :167413 MGI: 97488 HomoloGene: 4515 GeneCards: PAX4 Пов'язані генетичні захворювання цукровий діабет 1-го типу ,maturity-onset diabetes of the young type 9 [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • retina development in camera-type eye • циркадний ритм • positive regulation of cell differentiation • animal organ morphogenesis • регуляція диференціювання клітин • response to cAMP • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • endocrine pancreas development • pancreas development
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 7: 127.61 – 127.62 Mb Хр. 6: 28.44 – 28.45 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
PAX4 (англ. Paired box 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350амінокислот , амолекулярна маса — 37 833[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MHQDGISSMN QLGGLFVNGR PLPLDTRQQI VRLAVSGMRP CDISRILKVS NGCVSKILGR YYRTGVLEPK GIGGSKPRLA TPPVVARIAQ LKGECPALFA WEIQRQLCAE GLCTQDKTPS VSSINRVLRA LQEDQGLPCT RLRSPAVLAP AVLTPHSGSE TPRGTHPGTG HRNRTIFSPS QAEALEKEFQ RGQYPDSVAR GKLATATSLP EDTVRVWFSN RRAKWRRQEK LKWEMQLPGA SQGLTVPRVA PGIISAQQSP GSVPTAALPA LEPLGPSCYQ LCWATAPERC LSDTPPKACL KPCWDCGSFL LPVIAPSCVD VAWPCLDASL AHHLIGGAGK ATPTHFSHWP
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,білків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші