NOBOX Ідентифікатори Символи NOBOX , OG-2, OG2, OG2X, POF5, TCAG_12042, NOBOX oogenesis homeoboxЗовнішні ІД OMIM :610934 MGI: 108011 HomoloGene: 51066 GeneCards: NOBOX Пов'язані генетичні захворювання передчасне виснаження яєчників [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Оогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 7: 144.4 – 144.41 Mb Хр. 6: 43.28 – 43.29 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
NOBOX (англ. NOBOX oogenesis homeobox ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 691амінокислот , амолекулярна маса — 73 906[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MALLLTLTSP DLEGTWDTRD KDGFKAQEGP PLAVPEFPVC GLYRIYGVCG SFSSFFIIRC SLCALETLKS PQHDPLEIPE QSLKLIPLVS GKRELTRGQK AGEKPLAAGP GEEELLRGSA PHAQDTQSEE LPPSCTISGE KKPPAVSGEA TGADAGRLCP PPRSRAPHKD RTLARSRPQT QGEDCSLPVG EVKIGKRSYS PAPGKQKKPN AMGLAPTSSP GAPNSARATH NPVPCGSGRG PCHLANLLST LAQSNQNRDH KQGPPEVTCQ IRKKTRTLYR SDQLEELEKI FQEDHYPDSD KRREIAQTVG VTPQRIMVKG AGSLVAGWSG GGPTIETLEL QSERSAVAWV WFQNRRAKWR KMEKLNGKES KDNPAAPGPA SSQCSSAAEI LPAVPMEPKP DPFPQESPLD TFPEPPMLLT SDQTLAPTQP SEGAQRVVTP PLFSPPPVRR ADLPFPLGPV HTPQLMPLLM DVAGSDSSHK DGPCGSWGTS ITLPPPCSYL EELEPQDYQQ SNQPGPFQFS QAPQPPLFQS PQPKLPYLPT FPFSMPSSLT LPPPEDSLFM FPCGPSGGTS QGYCPGASSG QILMQPPAGN IGTASWSDPC LPELPFPGPF CPQALGHPPG GDGYFPDLFP TPCPQALGRQ PSSALSWMPE GARPGTGPLL SKAKEEPPAA SLDQPSALEE ARGDDKNSHV P
Кодований геном білок за функцією належить добілків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Huntriss J., Hinkins M., Picton H.M. (2006). cDNA cloning and expression of the human NOBOX gene in oocytes and ovarian follicles.Mol. Hum. Reprod .12 : 283—289. PMID 16597639 doi :10.1093/molehr/gal035 Bouilly J., Bachelot A., Broutin I., Touraine P., Binart N. (2011). Novel NOBOX loss-of-function mutations account for 6.2% of cases in a large primary ovarian insufficiency cohort.Hum. Mutat .32 : 1108—1113. PMID 21837770 doi :10.1002/humu.21543
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші