NKX2-3 Ідентифікатори Символи NKX2-3 Зовнішні ІД OMIM :606727 MGI: 97348 HomoloGene: 17061 GeneCards: NKX2-3 Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента • клітинне ядро • компонент клітини
Біологічний процес • leukocyte homeostasis • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • post-embryonic digestive tract morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • plasma cell differentiation • spleen development • Післязародковий розвиток • transcription, DNA-templated • macrophage differentiation • mucosa-associated lymphoid tissue development • odontogenesis of dentin-containing tooth • gland morphogenesis • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • B cell differentiation • Peyer's patch development • digestive tract development • lymph node development • triglyceride metabolic process • leukocyte migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • диференціація клітин
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 10: 99.53 – 99.54 Mb Хр. 19: 43.6 – 43.6 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
NKX2-3 (англ. NK2 homeobox 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 38 406[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MMLPSPVTST PFSVKDILNL EQQHQHFHGA HLQADLEHHF HSAPCMLAAA EGTQFSDGGE EDEEDEGEKL SYLNSLAAAD GHGDSGLCPQ GYVHTVLRDS CSEPKEHEEE PEVVRDRSQK SCQLKKSLET AGDCKAAEES ERPKPRSRRK PRVLFSQAQV FELERRFKQQ RYLSAPEREH LASSLKLTST QVKIWFQNRR YKCKRQRQDK SLELGAHAPP PPPRRVAVPV LVRDGKPCVT PSAQAYGAPY SVGASAYSYN SFPAYGYGNS AAAAAAAAAA AAAAAAYSSS YGCAYPAGGG GGGGGTSAAT TAMQPACSAA GGGPFVNVSN LGGFGSGGSA QPLHQGTAAG AACAQGTLQG IRAW
Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
