NFIX Ідентифікатори Символи NFIX Зовнішні ІД OMIM :164005 MGI: 97311 HomoloGene: 1872 GeneCards: NFIX Пов'язані генетичні захворювання Marshall–Smith syndrome [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес • реплікація ДНК • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 19: 13 – 13.1 Mb Хр. 8: 84.7 – 84.8 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
NFIX (англ. Nuclear factor I X ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 55 098[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MYSPYCLTQD EFHPFIEALL PHVRAFSYTW FNLQARKRKY FKKHEKRMSK DEERAVKDEL LGEKPEIKQK WASRLLAKLR KDIRPEFRED FVLTITGKKP PCCVLSNPDQ KGKIRRIDCL RQADKVWRLD LVMVILFKGI PLESTDGERL YKSPQCSNPG LCVQPHHIGV TIKELDLYLA YFVHTPESGQ SDSSNQQGDA DIKPLPNGHL SFQDCFVTSG VWNVTELVRV SQTPVATASG PNFSLADLES PSYYNINQVT LGRRSITSPP STSTTKRPKS IDDSEMESPV DDVFYPGTGR SPAAGSSQSS GWPNDVDAGP ASLKKSGKLD FCSALSSQGS SPRMAFTHHP LPVLAGVRPG SPRATASALH FPSTSIIQQS SPYFTHPTIR YHHHHGQDSL KEFVQFVCSD GSGQATGQPN GSGQGKVPGS FLLPPPPPVA RPVPLPMPDS KSTSTAPDGA ALTPPSPSFA TTGASSANRF VSIGPRDGNF LNIPQQSQSW FL
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,реплікація ДНК ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Apt D., Liu Y., Bernard H.U. (1994).Cloning and functional analysis of spliced isoforms of human nuclear factor I-X: interference with transcriptional activation by NFI/CTF in a cell-type specific manner .Nucleic Acids Res .22 : 3825—3833. PMID 7937100 doi :10.1093/nar/22.19.3825 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH.Genomics .28 : 66—73. PMID 7590749 doi :10.1006/geno.1995.1107
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
