| NFATC3 |
|---|
|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | NFATC3, NFAT4, NFATX, nuclear factor of activated T-cells 3, nuclear factor of activated T cells 3, NF-AT4c |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM:602698MGI:103296HomoloGene:27827GeneCards:NFATC3 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | •DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •chromatin binding •transcription factor binding
|
|---|
| Клітинна компонента | •цитоплазма •нуклеоплазма •клітинне ядро •гіалоплазма •transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес | •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •Fc-epsilon receptor signaling pathway •inflammatory response •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II •negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation •GO:0032617 творба цитокінів •calcineurin-NFAT signaling cascade •multicellular organism development
|
|---|
| Джерела:Amigo /QuickGO |
|
| Шаблонекспресії |
|---|


 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 16: 68.08 – 68.23 Mb | Хр. 8: 106.79 – 106.86 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NFATC3 (англ.Nuclear factor of activated T-cells 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 075амінокислот, амолекулярна маса — 115 594[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
| MTTANCGAHD | | ELDFKLVFGE | | DGAPAPPPPG | | SRPADLEPDD | | CASIYIFNVD |
| PPPSTLTTPL | | CLPHHGLPSH | | SSVLSPSFQL | | QSHKNYEGTC | | EIPESKYSPL |
| GGPKPFECPS | | IQITSISPNC | | HQELDAHEDD | | LQINDPEREF | | LERPSRDHLY |
| LPLEPSYRES | | SLSPSPASSI | | SSRSWFSDAS | | SCESLSHIYD | | DVDSELNEAA |
| ARFTLGSPLT | | SPGGSPGGCP | | GEETWHQQYG | | LGHSLSPRQS | | PCHSPRSSVT |
| DENWLSPRPA | | SGPSSRPTSP | | CGKRRHSSAE | | VCYAGSLSPH | | HSPVPSPGHS |
| PRGSVTEDTW | | LNASVHGGSG | | LGPAVFPFQY | | CVETDIPLKT | | RKTSEDQAAI |
| LPGKLELCSD | | DQGSLSPARE | | TSIDDGLGSQ | | YPLKKDSCGD | | QFLSVPSPFT |
| WSKPKPGHTP | | IFRTSSLPPL | | DWPLPAHFGQ | | CELKIEVQPK | | THHRAHYETE |
| GSRGAVKAST | | GGHPVVKLLG | | YNEKPINLQM | | FIGTADDRYL | | RPHAFYQVHR |
| ITGKTVATAS | | QEIIIASTKV | | LEIPLLPENN | | MSASIDCAGI | | LKLRNSDIEL |
| RKGETDIGRK | | NTRVRLVFRV | | HIPQPSGKVL | | SLQIASIPVE | | CSQRSAQELP |
| HIEKYSINSC | | SVNGGHEMVV | | TGSNFLPESK | | IIFLEKGQDG | | RPQWEVEGKI |
| IREKCQGAHI | | VLEVPPYHNP | | AVTAAVQVHF | | YLCNGKRKKS | | QSQRFTYTPV |
| LMKQEHREEI | | DLSSVPSLPV | | PHPAQTQRPS | | SDSGCSHDSV | | LSGQRSLICS |
| IPQTYASMVT | | SSHLPQLQCR | | DESVSKEQHM | | IPSPIVHQPF | | QVTPTPPVGS |
| SYQPMQTNVV | | YNGPTCLPIN | | AASSQEFDSV | | LFQQDATLSG | | LVNLGCQPLS |
| SIPFHSSNSG | | STGHLLAHTP | | HSVHTLPHLQ | | SMGYHCSNTG | | QRSLSSPVAD |
| QITGQPSSQL | | QPITYGPSHS | | GSATTASPAA | | SHPLASSPLS | | GPPSPQLQPM |
| PYQSPSSGTA | | SSPSPATRMH | | SGQHSTQAQS | | TGQGGLSAPS | | SLICHSLCDP |
| ASFPPDGATV | | SIKPEPEDRE | | PNFATIGLQD | | ITLDDVNEII | | GRDMSQISVS |
| QGAGVSRQAP | | LPSPESLDLG | | RSDGL |
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,ацетилювання,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1)Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|