Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

MYOD1

Редагувати посилання

Очікує на перевірку

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

(Перенаправлено зMyoD)

Статус версії сторінки

На цій сторінці показано неперевірені зміни

4 зміни у цій версіїочікують на перевірку.Стабільну версію булоперевірено9 травня 2022.

MYOD1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MDY

Ідентифікатори

Символи

MYOD1, MYF3, MYOD, PUM, bHLHc1, myogenic differentiation 1, MYODRIF

Зовнішні ІД

OMIM:159970 MGI:97275 HomoloGene:7857 GeneCards:MYOD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •sequence-specific DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •protein dimerization activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •transcription factor binding •chromatin binding •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •E-box binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein heterodimerization activity •enzyme binding •transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding •chromatin DNA binding •ubiquitin protein ligase binding •GO:0001105 transcription coactivator activity •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •promoter-specific chromatin binding
Клітинна компонента	•transcription regulator complex •нуклеоплазма •міофібрила •клітинне ядро •цитоплазма •гіалоплазма •ядерні тільця
Біологічний процес	•диференціація клітин •myotube differentiation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •cellular response to starvation •muscle cell fate commitment •cellular response to estradiol stimulus •skeletal muscle fiber adaptation •muscle organ development •regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome •myotube cell development •positive regulation of skeletal muscle fiber development •negative regulation of myoblast proliferation •transcription, DNA-templated •multicellular organism development •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •protein phosphorylation •regulation of RNA splicing •positive regulation of myoblast fusion •myoblast fate determination •cellular response to glucocorticoid stimulus •positive regulation of myoblast differentiation •skeletal muscle fiber development •histone H3 acetylation •myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration •histone H4 acetylation •skeletal muscle cell differentiation •positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration •регуляція експресії генів •striated muscle cell differentiation •cellular response to oxygen levels •myoblast fusion •myoblast differentiation •skeletal muscle tissue development •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •positive regulation of muscle cell differentiation •cellular response to tumor necrosis factor •positive regulation of snRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4654


17927

Ensembl


ENSG00000129152


ENSMUSG00000009471

UniProt


P15172


P10085

RefSeq (мРНК)


NM_002478


NM_010866

RefSeq (білок)


NP_002469


NP_034996

Локус (UCSC)

Хр. 11: 17.72 – 17.72 Mb

Хр. 7: 46.03 – 46.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MYOD1 (англ.Myogenic differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 320амінокислот, амолекулярна маса — 34 501^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELLSPPLRD	VDLTAPDGSL	CSFATTDDFY	DDPCFDSPDL	RFFEDLDPRL
MHVGALLKPE	EHSHFPAAVH	PAPGAREDEH	VRAPSGHHQA	GRCLLWACKA
CKRKTTNADR	RKAATMRERR	RLSKVNEAFE	TLKRCTSSNP	NQRLPKVEIL
RNAIRYIEGL	QALLRDQDAA	PPGAAAAFYA	PGPLPPGRGG	EHYSGDSDAS
SPRSNCSDGM	MDYSGPPSGA	RRRNCYEGAY	YNEAPSEPRP	GKSAAVSSLD
CLSSIVERIS	TESPAAPALL	LADVPSESPP	RRQEAAAPSE	GESSGDPTQS
PDAAPQCPAG	ANPNPIYQVL

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,білків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,диференціація клітин, міогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.Втрата контролю над цим перемикачем може стати причиною утвореннярабдоміосаркоми^[5]^[6].

Література

[ред. |ред. код]

Pearson-White S.H. (1991). Human MyoD: cDNA and deduced amino acid sequence.Nucleic Acids Res.19: 1148—1148.PMID 1850513doi:10.1093/nar/19.5.1148
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Breitschopf K., Bengal E., Ziv T., Admon A., Ciechanover A. (1998). A novel site for ubiquitination: the N-terminal residue, and not internal lysines of MyoD, is essential for conjugation and degradation of the protein.EMBO J.17: 5964—5973.PMID 9774340doi:10.1093/emboj/17.20.5964
McKinsey T.A., Zhang C.L., Olson E.N. (2001). Control of muscle development by dueling HATs and HDACs.Curr. Opin. Genet. Dev.11: 497—504.PMID 11532390doi:10.1016/S0959-437X(00)00224-0
Mal A.K. (2006). Histone methyltransferase Suv39h1 represses MyoD-stimulated myogenic differentiation.EMBO J.25: 3323—3334.PMID 16858404doi:10.1038/sj.emboj.7601229
Chen B., Dias P., Jenkins J.J. III, Savell V.H., Parham D.M. (1998).Methylation alterations of the MyoD1 upstream region are predictive of subclassification of human rhabdomyosarcomas.Am. J. Pathol.152: 1071—1079.PMID 9546368

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7611 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P15172 (англ.) . Архіворигіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=783
↑https://jcp.bmj.com/content/56/6/412

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 11

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=MYOD1&oldid=43439114

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭