Movatterモバイル変換

Перейти до вмісту

MYC

Редагувати посилання

Очікує на перевірку

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

(Перенаправлено зMyc)

Статус версії сторінки

На цій сторінці показано неперевірені зміни

7 змін у цій версіїочікують на перевірку.Стабільну версію булоперевірено22 серпня 2019.

MYC

Наявні структури

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A93,1EE4,1MV0,1NKP,2A93,2OR9,4Y7R

Ідентифікатори

MYC, MRTL, MYCC, bHLHe39, c-Myc, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene homolog, MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor, Genes, myc, c-myc

Зовнішні ІД

OMIM:190080 MGI:97250 HomoloGene:31092 GeneCards:MYC

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •protein dimerization activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •transcription factor binding •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •E-box binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •GO:0032403 protein-containing complex binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•нуклеоплазма •ядерце •клітинне ядро •GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	•Сигнальний шлях Notch •ремоделювання хроматину •negative regulation of monocyte differentiation •positive regulation of metanephric cap mesenchymal cell proliferation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •regulation of telomere maintenance •positive regulation of epithelial cell proliferation •positive regulation of fibroblast proliferation •cellular response to UV •oxygen transport •negative regulation of apoptotic process •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization •MAPK cascade •cellular response to DNA damage stimulus •positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process •branching involved in ureteric bud morphogenesis •negative regulation of cell division •fibroblast apoptotic process •positive regulation of mesenchymal cell proliferation •positive regulation of response to DNA damage stimulus •positive regulation of cell population proliferation •positive regulation of DNA biosynthetic process •регуляція експресії генів •canonical Wnt signaling pathway •negative regulation of stress-activated MAPK cascade •energy reserve metabolic process •response to growth factor •response to gamma radiation •negative regulation of fibroblast proliferation •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •cellular iron ion homeostasis •beta-catenin-TCF complex assembly •transcription, DNA-templated •transcription by RNA polymerase II •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •protein deubiquitination •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •positive regulation of telomerase activity •GO:1901313 positive regulation of gene expression •protein-DNA complex disassembly •ERK1 and ERK2 cascade •cellular response to hypoxia •G1/S transition of mitotic cell cycle •cytokine-mediated signaling pathway •positive regulation of DNA methylation
Джерела:Amigo /QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша


4609


17869


ENSG00000136997


ENSMUSG00000022346


P01106


P01108

RefSeq (мРНК)


NM_002467 NM_001354870


NM_001177352 NM_001177353 NM_001177354 NM_010849

RefSeq (білок)


NP_002458 NP_001341799


NP_001170823 NP_001170824 NP_001170825 NP_034979

Локус (UCSC)

Хр. 8: 127.74 – 127.74 Mb

Хр. 15: 61.86 – 61.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MYC (англ.MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor) – сім'я регуляторних генів та прото-онкогенів, які кодують однойменні фактори транскрипції. Сімейство Myc складається з трьох споріднених генів людини: c-myc, l-myc і n-myc. c-myc був першим геном, виявленим у цій родині, завдяки гомології з вірусним геном v-myc. При раку c-myc часто виражається конститутивно. Розташований у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439амінокислот, амолекулярна маса — 48 804^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLNVSFTNR		NYDLDYDSVQ		PYFYCDEEEN		FYQQQQQSEL		QPPAPSEDIW
KKFELLPTPP		LSPSRRSGLC		SPSYVAVTPF		SLRGDNDGGG		GSFSTADQLE
MVTELLGGDM		VNQSFICDPD		DETFIKNIII		QDCMWSGFSA		AAKLVSEKLA
SYQAARKDSG		SPNPARGHSV		CSTSSLYLQD		LSAAASECID		PSVVFPYPLN
DSSSPKSCAS		QDSSAFSPSS		DSLLSSTESS		PQGSPEPLVL		HEETPPTTSS
DSEEEQEDEE		EIDVVSVEKR		QAPGKRSESG		SPSAGGHSKP		PHSPLVLKRC
HVSTHQHNYA		APPSTRKDYP		AAKRVKLDSV		RVLRQISNNR		KCTSPRSSDT
EENVKRRTHN		VLERQRRNEL		KRSFFALRDQ		IPELENNEKA		PKVVILKKAT
AYILSVQAEE		QKLISEEDLL		RKRREQLKHK		LEQLRNSCA

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції, ацетилювання,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Colby W.W., Chen E.Y., Smith D.H., Levinson A.D. (1983).Identification and nucleotide sequence of a human locus homologous to the v-myc oncogene of avian myelocytomatosis virus MC29.Nature.301: 722—725.PMID 6298632doi:10.1038/301722a0
Rabbitts T.H., Hamlyn P.H., Baer R. (1983).Altered nucleotide sequences of a translocated c-myc gene in Burkitt lymphoma.Nature.306: 760—765.PMID 6419122doi:10.1038/306760a0
Watson D.K., Psallidopoulos M.C., Samuel K.P., Dalla-Favera R., Papas T.S. (1983). Nucleotide sequence analysis of human c-myc locus, chicken homologue, and myelocytomatosis virus MC29 transforming gene reveals a highly conserved gene product.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.80: 3642—3645.PMID 6304729doi:10.1073/pnas.80.12.3642
Rabbitts T.H., Forster A., Hamlyn P., Baer R. (1984). Effect of somatic mutation within translocated c-myc genes in Burkitt's lymphoma.Nature.309: 592—597.PMID 6547209doi:10.1038/309592a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Bentley D.L., Groudine M. (1986).Novel promoter upstream of the human c-myc gene and regulation of c-myc expression in B-cell lymphomas.Mol. Cell. Biol.6: 3481—3489.PMID 3540591doi:10.1128/MCB.6.10.3481

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7553 (англ.) . Архіворигіналу за 31 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.[Архівовано 2017-05-31 уWayback Machine.]
↑UniProt, P01106 (англ.) . Архіворигіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 8

Молекула міоглобіну

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=MYC&oldid=46337607

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭

©2009-2026 Movatter.jp