MYRF Ідентифікатори Символи MYRF Зовнішні ІД OMIM :608329 MGI: 2684944 HomoloGene: 32167 GeneCards: MYRF Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • endoplasmic reticulum membrane • клітинне ядро • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма
Біологічний процес • positive regulation of myelination • oligodendrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • протеоліз • central nervous system myelination • central nervous system myelin maintenance • диференціація клітин • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • transcription, DNA-templated • oligodendrocyte development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein autoprocessing
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 11: 61.75 – 61.79 Mb Хр. 19: 10.19 – 10.22 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
MYRF (англ. Myelin regulatory factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 124 397[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MEVVDETEAL QRFFEGHDIN GALEPSNIDT SILEEYISKE DASDLCFPDI SAPASSASYS HGQPAMPGSS GVHHLSPPGG GPSPGRHGPL PPPGYGTPLN CNNNNGMGAA PKPFPGGTGP PIKAEPKAPY APGTLPDSPP DSGSEAYSPQ QVNEPHLLRT ITPETLCHVG VPSRLEHPPP PPAHLPGPPP PPPPPPHYPV LQRDLYMKAE PPIPHYAAMG QGLVPTDLHH TQQSQMLHQL LQQHGAELPT HPSKKRKHSE SPPSTLNAQM LNGMIKQEPG TVTALPLHPT RAPSPPWPPQ GPLSPGPGSL PLSIARVQTP PWHPPGAPSP GLLQDSDSLS GSYLDPNYQS IKWQPHQQNK WATLYDANYK ELPMLTYRVD ADKGFNFSVG DDAFVCQKKN HFQVTVYIGM LGEPKYVKTP EGLKPLDCFY LKLHGVKLEA LNQSINIEQS QSDRSKRPFN PVTVNLPPEQ VTKVTVGRLH FSETTANNMR KKGKPNPDQR YFMLVVALQA HAQNQNYTLA AQISERIIVR ASNPGQFESD SDVLWQRAQV PDTVFHHGRV GINTDRPDEA LVVHGNVKVM GSLMHPSDLR AKEHVQEVDT TEQLKRISRM RLVHYRYKPE FAASAGIEAT APETGVIAQE VKEILPEAVK DTGDMVFANG KTIENFLVVN KERIFMENVG AVKELCKLTD NLETRIDELE RWSHKLAKLR RLDSLKSTGS SGAFSHAGSQ FSRAGSVPHK KRPPKVASKS SSVVPDQACI SQRFLQGTII ALVVVMAFSV VSMSTLYVLS LRTEEDLVDT DGSFAVSTSC LLALLRPQPP GGSEALCPWS SQSFGTTQLR QSPLTTGLPG IQPSLLLVTT SLTSSAPGSA VRTLDMCSSH PCPVICCSSP TTNPTTGPSL GPSFNPGHVL SPSPSPSTNR SGPSQMALLP VTNIRAKSWG LSVNGIGHSK HHKSLEPLAS PAVPFPGGQG KAKNSPSLGF HGRARRGALQ SSVGPAEPTW AQGQSASLLA EPVPSLTSIQ VLENSMSITS QYCAPGDACR PGNFTYHIPV SSGTPLHLSL TLQMNSSSPV SVVLCSLRSK EEPCEEGSLP QSLHTHQDTQ GTSHRWPITI LSFREFTYHF RVALLGQANC SSEALAQPAT DYHFHFYRLC D
Кодований геном білок за функціями належить догідролаз ,протеаз ,активаторів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,диференціація клітин , ацетилювання,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі , мембрані,ендоплазматичному ретикулумі .
Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes.Genomics .49 : 419—429. PMID 9615227 doi :10.1006/geno.1998.5291 Li Z., Park Y., Marcotte E.M. (2013). A bacteriophage tailspike domain promotes self-cleavage of a human membrane-bound transcription factor, the myelin regulatory factor MYRF.PLoS Biol .11 : E1001624—E1001624. PMID 23966832 doi :10.1371/journal.pbio.1001624 Stoehr H., Marquardt A., White K., Weber B.H.F. (2000). cDNA cloning and genomic structure of a novel gene (C11orf9) localized to chromosome 11q12-->q13.1 which encodes a highly conserved, potential membrane-associated protein.Cytogenet. Cell Genet .88 : 211—216. PMID 10828591
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
