MYB Наявні структури PDB Пошук ортологів:PDBe RCSB Список кодів PDB 1GUU ,1GV2 ,1GV5 ,1GVD ,1H88 ,1H89 ,1IDY ,1IDZ ,1MBE ,1MBF ,1MBG ,1MBH ,1MBJ ,1MBK ,1MSE ,1MSF ,1SB0 ,2AGH
Ідентифікатори Символи MYB Зовнішні ІД OMIM :189990 MGI: 97249 HomoloGene: 31311 GeneCards: MYB Пов'язані генетичні захворювання ожиріння [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • ремоделювання хроматину • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K4 methylation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K9 methylation • positive regulation of T-helper cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • response to hypoxia • positive regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of glial cell proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to retinoic acid • positive regulation of transforming growth factor beta production • positive regulation of neuron death • positive regulation of hepatic stellate cell proliferation • positive regulation of hepatic stellate cell activation • positive regulation of testosterone secretion • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 6: 135.18 – 135.22 Mb Хр. 10: 21 – 21.04 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
MYB (англ. MYB proto-oncogene, transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 72 341[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MARRPRHSIY SSDEDDEDFE MCDHDYDGLL PKSGKRHLGK TRWTREEDEK LKKLVEQNGT DDWKVIANYL PNRTDVQCQH RWQKVLNPEL IKGPWTKEED QRVIELVQKY GPKRWSVIAK HLKGRIGKQC RERWHNHLNP EVKKTSWTEE EDRIIYQAHK RLGNRWAEIA KLLPGRTDNA IKNHWNSTMR RKVEQEGYLQ ESSKASQPAV ATSFQKNSHL MGFAQAPPTA QLPATGQPTV NNDYSYYHIS EAQNVSSHVP YPVALHVNIV NVPQPAAAAI QRHYNDEDPE KEKRIKELEL LLMSTENELK GQQVLPTQNH TCSYPGWHST TIADHTRPHG DSAPVSCLGE HHSTPSLPAD PGSLPEESAS PARCMIVHQG TILDNVKNLL EFAETLQFID SFLNTSSNHE NSDLEMPSLT STPLIGHKLT VTTPFHRDQT VKTQKENTVF RTPAIKRSIL ESSPRTPTPF KHALAAQEIK YGPLKMLPQT PSHLVEDLQD VIKQESDESG IVAEFQENGP PLLKKIKQEV ESPTDKSGNF FCSHHWEGDS LNTQLFTQTS PVADAPNILT SSVLMAPASE DEDNVLKAFT VPKNRSLASP LQPCSSTWEP ASCGKMEEQM TSSSQARKYV NAFSARTLVM
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , ацетилювання,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Majello B., Kenyon L.C., Dalla-Favera R. (1986). Human c-myb protooncogene: nucleotide sequence of cDNA and organization of the genomic locus.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .83 : 9636—9640. PMID 3540945 doi :10.1073/pnas.83.24.9636 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Nicolaides N.C., Gualdi R., Casadevall C., Manzella L., Calabretta B. (1991).Positive autoregulation of c-myb expression via Myb binding sites in the 5' flanking region of the human c-myb gene .Mol. Cell. Biol .11 : 6166—6176. PMID 1944282 doi :10.1128/MCB.11.12.6166 Matre V., Nordgaard O., Alm-Kristiansen A.H., Ledsaak M., Gabrielsen O.S. (2009). HIPK1 interacts with c-Myb and modulates its activity through phosphorylation.Biochem. Biophys. Res. Commun .388 : 150—154. PMID 19646965 doi :10.1016/j.bbrc.2009.07.139 Westin E.H., Gorse K.M., Clarke M.F. (1990).Alternative splicing of the human c-myb gene .Oncogene .5 : 1117—1124. PMID 2202948 Jacobs S.M., Gorse K.M., Westin E.H. (1994).Identification of a second promoter in the human c-myb proto-oncogene .Oncogene .9 : 227—235. PMID 8302584
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
