MEIS1 Ідентифікатори Символи MEIS1 , Meis homeobox 1Зовнішні ІД OMIM :601739 MGI: 104717 HomoloGene: 135741 GeneCards: MEIS1 Пов'язані генетичні захворювання синдром неспокійних ніг [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding
Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес • megakaryocyte development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • locomotory behavior • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • lens morphogenesis in camera-type eye • Ангіогенез • definitive hemopoiesis • negative regulation of myeloid cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • кровотворення
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 2: 66.43 – 66.57 Mb Хр. 11: 18.83 – 18.97 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
MEIS1 (англ. Meis homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390амінокислот , амолекулярна маса — 43 016[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MAQRYDDLPH YGGMDGVGIP STMYGDPHAA RSMQPVHHLN HGPPLHSHQY PHTAHTNAMA PSMGSSVNDA LKRDKDAIYG HPLFPLLALI FEKCELATCT PREPGVAGGD VCSSESFNED IAVFAKQIRA EKPLFSSNPE LDNLMIQAIQ VLRFHLLELE KVHELCDNFC HRYISCLKGK MPIDLVIDDR EGGSKSDSED ITRSANLTDQ PSWNRDHDDT ASTRSGGTPG PSSGGHTSHS GDNSSEQGDG LDNSVASPST GDDDDPDKDK KRHKKRGIFP KVATNIMRAW LFQHLTHPYP SEEQKKQLAQ DTGLTILQVN NWFINARRRI VQPMIDQSNR AVSQGTPYNP DGQPMGGFVM DGQQHMGIRA PGPMSGMGMN MGMEGQWHYM
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,білків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , поліморфізм,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Smith J.E. Jr., Bollekens J.A., Inghirami G., Takeshita K. (1997). Cloning and mapping of the MEIS1 gene, the human homolog of a murine leukemogenic gene.Genomics .43 : 99—103. PMID 9226379 doi :10.1006/geno.1997.4766 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші